Geri Dön

Enterobacteriacea türlerinde karbapenemaz üretiminin fenotipik yöntemlerle araştırılması

Investigation of carbapenemase production on enterobactericeae species by phenotypic methods

PDF İndir

  1. Tez No: 548942
  2. Yazar: EMIN GULUZADE
  3. Danışmanlar: PROF. DR. ASUMAN BİRİNCİ
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
  6. Anahtar Kelimeler: Enterobacteriaceae, Fenotipik testler, Karbapenem direnci, Karbapenemazlar, Carbapenem resistance, Carbapenemases, Enterobacteriaceae, Phenotypic tests
  7. Yıl: 2019
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Ondokuz Mayıs Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 62

Özet

Amaç: Enterobacteriacea spp sık karşılaşılan gram negatif etkenlerdir. Dirençli türler karbapenem kullanımını ve direnç gelişimini arttırmaktadır. Bu direncin tespiti önem arzetmektedir. Mevcut metodların sensitivite ve spesifite düşüklüğü yeni metodların geliştirilmesine neden olmuştur. Amacımız karbapenem dirençli Enterobacteriaceae izolatlarında karbapenemaz varlığını fenotipik yöntemlerle incelemek, fenotipik ve moleküler yöntemlerin arasında, fenotipik yöntemlerin kendi aralarında uyumluluğu incelemektir. Materyal ve Metod: Ondokuz Mayıs Üniversitesi Tıp Fakültesi Hastanesi Mikrobiyoloji Laboratuvarında izole edilen ve karbapenem direnç geni tespit edilmiş 70 Enterobactericeae suşu çalışmaya dahil edildi. Çalışmaya ayrıca karbapenem dirençli olan ancak direnç geni tespit edilmeyen negatif kontrol olarak 40 Enterobactericeae dahil edildi. Suşlarda karbapenemaz tespiti için Modifiye Hodge Testi (MHT), Kromojenik test, CarbaNP testi ve MAST disk testleri kullanıldı. Elde edilen sonuçlarla fenotipik testlerin sensitivite, spesivite, pozitif ve negatif prediktif değerleri hesaplandı. Bulgular: Çalışmaya dahil edilen 110 suştan 78 (%70,9)'inde MHT pozitif, 32 (%29,1)'i negatif, CarbaNP testiyle 82 (%74,5)'si pozitif, 28 (%25,5) suş negatif, kromojenik besiyeri testi ise 73 (%66,4) suşu pozitif, 37 (%33,6) suşu negatif bulmuştur. 110 suşta MAST disk test sonucuna göre 74(%67,3) suş pozitif, 13(%32,7) suş negatif bulunmuştur. PZR pozitif suşların 67 (%95,7)'sinde MAST disk pozitiflik saptandı ve en fazla OXA-48 (%87,1) karbapenemaz türü saptandı. Dört farklı metodu karşılaştırdığımızda sırası ile sensitivite, spesifiteleri, PPD ve NPD'leri en yüksek olan testler CarbaNP ile MAST disk olmuştur. Sonuç: Karbapenem MİK değerlerinde artış saptanan izolatlarda bu artışın doğrulanması ve hastane içinde, karbapenem dirençli Enterobacteriaceae prevalansının arttığı birimlerde taşıyıcılık taraması yapılması mantıklı görünmektedir.

Özet (Çeviri)

Aim: Enterobactericeae is the most encountered gram negative pathogen. Resistant spesies increasing carbapenem use and therefore resistance. Detection of this resistance iscrusial. Low sensitivity and specivity of known methods forced to develop new methods. Aim of our study is to investigate phonotypic methods on carbapenemase resistant Enterobacteriaceae izolates, to compare phonotypic and molecular methods, also evaluate phonetypic tests amogst themselves. Material and Method: 70 genotypically positive Enterobacteriacea strain included to study that has been isolated in OMU Medical Faculty Microbiology Laboratory. 40 Enterobacteriaceae are also included as a negative contol. Carbapenemase production tested using Modified Hodge Test, Chromogenic test, CarbaNP test and MAST Disc test. Results used to calculate sensitivity, spesivity, positive predictive and negative predictive values of phenotypic tests Results: 78 (%70,9) from investigated 110 strains MHT was positive and 32 (%29,1)' was negative, CarbaNP detected 82 (%74,5) as positive, 28 (%25,5) as negative, results from Chromogenic Medium showed 73 (%66,4) as positive and 37 (%33,6) as negative. Total 110 isolate showed 74(%67,3) positive, 13(%32,7) negative results on MAST Disk test. Among PCR positive isolates 67(%95,7) MAST disk detected as positive and showed OXA-48 (%87,1) type carbapenemaes. Comparing four different methods CarbaNP and Mast disk method showed highest sensitivity, spesifity, positive and negative predictive values accordingly. Conclusion: Confirmation of elevated carbapenem MİC results and hospital screening for vectors especially in departments with high prevalence of carbapenem resistance seems rational

Benzer Tezler

  1. Tez No

    496742

    Çeşitli klinik örneklerden izole edilen enterobacteriaceae türlerinde karbapenemaz varlığının fenotipik olarak araştırılması

    Phenotypic investigation of carbapenemase in enterobacteriaceae species isolated from various clinical specimens

    KÜBRA ALAY KARA

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2018

    MikrobiyolojiAtatürk Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MUHAMMET HAMİDULLAH UYANIK

  2. Tez No

    426508

    Klinik örneklerden ızole edilen gram-negatif basillerde metallo-β-laktamaz'ların fenotipik-genotipik olarak araştırılması ve suşların filogenetik analizi

    Phenotypical-genotypical investigation of metallo-β-lactamases identified from clinical gram-negative bacilli and phylogenetical analysis of isolates

    FARZAD HEYDARI

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2016

    MikrobiyolojiÇukurova Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. FATİH KÖKSAL

  3. Tez No

    511668

    İnvazif enfeksiyonlara neden olan genişlemiş spektrumlu beta-laktamaz (GSBL) oluşturan Enterobacteriaceae izolatlarının hızlı teşhisi için DNA aptamerlerinin geliştirilmesi

    Development of DNA aptamers for rapid diagnosis of extensive spectrum beta-lactamase (ESBL) producing Enterobacteriaceae isolates which causes invasive infections

    HATİCE NUR HALİPÇİ TOPSAKAL

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2018

    BiyolojiKahramanmaraş Sütçü İmam Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. ASHABİL AYGAN

    PROF. DR. FATMA KÖKSAL ÇAKIRLAR

  4. Tez No

    844298

    Karbapenem dirençli enterobacteriaceae izolatlarında karbapenem direnç genlerinin Genexpert Carba Paneli ile değerlendirilmesi

    Evaluation of carbapenem resistance genes in carbapenem-resistantenterobacteriaceae isolates with Genexpert Carba Panel

    CANAN DİZİLİ YELGİN

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    MikrobiyolojiAtatürk Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. HALİL YAZGI

    DOÇ. DR. BARIŞ GÜLHAN

  5. Tez No

    878736

    Enterobacterales türlerinde karbapenemaz tiplerinin saptanmasında farklı yöntemlerin karşılaştırılması

    Comparison of different methods for detecting carbapenemase types in enterobacterales species

    ÇİSİL ŞEYMA ÖZEL DAVULCU

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2024

    MikrobiyolojiÇanakkale Onsekiz Mart Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ALPER AKÇALI

Geri Dön