Çerezlik kabak populasyonlarının genetik analizi
Genetic analysis of pumpkins populations
- Tez No: 557070
- Danışmanlar: PROF. DR. OSMAN GÜLŞEN
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Ziraat, Agriculture
- Anahtar Kelimeler: Çerezlik Kabak, ISSR, AMOVA, NTSYS, ARLEQUIN, Pumpkin, ISSR, AMOVA, NTSYS, ARLEQUIN
- Yıl: 2019
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Erciyes Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Bahçe Bitkileri Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 75
Özet
Bu çalışma Kayseri ilinde yetiştiriciliği yapılan farklı genotip kaynaklarında varyasyon düzeyini araştırmak, genetik ilişkileri tespit etmek ve bağlantı eşitsizliğini belirlemek amacıyla yapılmıştır. Çalışma kapsamında ağırlıklı olarak Kayseri ilinin Develi, Yeşilhisar ve Tomarza ilçelerinden temin edilen 140 farklı çerezlik kabak genotipinin genetik analizi yapılmıştır. DNA amplifikasyonu için 18 farklı ISSR primeri kullanılmıştır. Bant veren ve skorlanabilen primerlerle tüm DNA örnekleri ile PCR yapılmıştır. Toplamda kaydedilen 188 markır, NTSYS ve ARLEQUIN programı kullanılarak analiz edilmiştir. NTSYS'le UPGMA ve PCA analizleri, diğer programla da populasyon içi ve populasyonlar arası varyasyon dağılımını (AMOVA) görmek ve bağlantı eşitsizliği durumunu tespit etmek amacıyla sırasıyla LD analizleri gerçekleştirilmiştir. LD analizleri çerezlik kabak populasyonlarında tespit edilen markırlar arasında tesadüfi olmayan bağlantıları tespit edebilmek için bağlantı eşitsizliği (LD) analizleri yapılmıştır. Yürütülen bu çalışmada PCR çalışmaları ile elde edilen analizler sonucunda ISSR primerleri ile elde edilen 188 markır için, toplam polimorfizm oranı %98 olarak belirlenmiştir. Yapılan NTSYS ve UPGMA analizleri sonucunda 140 genotip benzerlik düzeyinin 0.72 ortalama ile 0.47-0.97 arasında değiştiği ve temelde 2 ana grup oluşturduğu görülmüştür. AMOVA analizleri sonucunda ise toplam varyasyonun %68'inin populasyon içinde %32'sinin ise populasyonlar arasında olduğu tespit edilmiştir. Bu sonuç ıslah programlarında hem populasyon içinin hem de farklı populasyonların dikkate alınması gerektiğini ortaya koymuştur. LD analizlerinde ise markırlar arasında yapılan bağlantı analizlerinde farklı markırlarla bağlantılı markır sayııları değişken bulunmakla beraber markırlarla önemli karakterleri yöneten genler açısından haritalama yapılabilceğini ortaya koymuştur.
Özet (Çeviri)
Within the scope of this study, genetic analysis of 140 types of pumpkin genotypes obtained from Develi, Yeşilhisar and Tomarza districts of Kayseri province were performed. Molecular characterization studies were performed by DNA isolation from fresh leaf samples. For DNA amplification, 18 different ISSR primers were used. PCR was performed with all DNA samples with banding and scoring primers. A total of 188 markers were obtained. Obtained data were analyzed by using NTSYS and ARLEQUIN program. UPGMA and PCA analyze with NTSYS were also measured by AMOVA analysis to see intra- and inter-population variation distribution within the other program. In addition, inequality (LD) analyses were performed in order to detect non-random connections between the markers detected in the snack pumpkin populations studied. In this study, as a result of the analyzes obtained by PCR studies, a total of 188 bands were obtained with ISSR primers and the total polymorphism rate was determined as 97%. As a result of the NTSYS and UPGMA analyzes, 140 genotype similarity levels ranged from 0.47 to 0.97 with an average of 0.72 and basically formed two main groups. As a result of AMOVA analysis, the population differences among pumpkins varied between 0.10 and 0.68. There were significant LD among the loci analyzed.
Benzer Tezler
- Farklı kabak (Cucurbita pepo L.) popülasyonlarının ISSR markörler kullanılarak filogenetik karakterizasyonu
Phylogenetic characterization of different pumpkin (Cucurbita pepo L.) populations with ISSR markers
ŞEYMA TUĞÇE TARTAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2024
GenetikGebze Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. FUNDA ŞENTÜRK AKFIRAT
- Farklı çerezlik kabak (Cucurbita pepo L.) popülasyonlarının ssr markörleri ile moleküler karakterizasyonu
Molecular characterization of different Cucurbita Pepo L. populations with SSR markers
ESRA HÜLYA EKİNCİ
Yüksek Lisans
Türkçe
2020
GenetikGebze Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. FUNDA ŞENTÜRK AKFIRAT
- Ülkemizde yetiştirilen farklı çekirdeklik kabak populasyonlarının bazı tane özelliklerinin saptanması ve rapd yöntemi ile genetik ilişkilerinin belirlenmesi
The determining of some grain properties of several pumpkin genotips and their genetic relationships with rapd method which is grow in Turkey
SELEN ŞEKER
Yüksek Lisans
Türkçe
2012
GenetikNamık Kemal ÜniversitesiBahçe Bitkileri Ana Bilim Dalı
PROF. DR. LEVENT ARIN
- Çerezlik ayçiçeği (Helianthus annuus L.) çeşit ve popülasyonlaırnın verim ile kalite unsurları açısından değerlendirilmesi
The evaluation of confectionary sunflower (Helianthus annuus L.) cultivars and populations for yield and quality components
GÜLER CEBBAR
Yüksek Lisans
Türkçe
2019
ZiraatTekirdağ Namık Kemal ÜniversitesiTarla Bitkileri Ana Bilim Dalı
PROF. DR. FADUL ÖNEMLİ
- Çerezlik ayçiçeği (Helianthus annuus L.) populasyonlarında dane özellikleri ve özellikler arası ilişkiler
Grain characteristics and relationships between characters in confectionary sunflower (Helianthus annuus L.) populations
ORÇUN POLATLI
Yüksek Lisans
Türkçe
2013
ZiraatAdnan Menderes ÜniversitesiTarla Bitkileri Ana Bilim Dalı
PROF. DR. AYDIN ÜNAY