Farklı meme kanseri hücre tiplerinin (MCF-7, MDA-MB-231, CRL-4010) organik asit profilinin incelenmesi
Investigation of the organic acid profile of different breast cancer cell types (MCF-7, MDA-MB-231, CRL-4010)
- Tez No: 566734
- Danışmanlar: DR. ÖĞR. ÜYESİ ATAMAN GÖNEL
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyokimya, Biochemistry
- Anahtar Kelimeler: MCF-7, MDA-MB-231, Organik asit profili, MCF-7, MDA-MB-231, CRL-4010, organic acid profil
- Yıl: 2019
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Harran Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Tıbbi Biyokimya Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 100
Özet
Meme kanseri bayanlarda en çok rastlanan kanser türü olup, akciğer kanserinden sonra ikinci sırada gelmektedir. Prognozu patolojik tiplendirmesine göre faklılık gösteren meme kanserinde kemoterapi vazgeçilmez tedavi yöntemidir. Kemoterapi ile erken evrelerde bile tam kür şansı düşüktür. Kanser hücrelerinin metabolik aktivitelerinin ve karekteristiğinin tanımlanması yeni tedavi modaliteleri ve kür açısından fayda sağlayabilir. Bunu tanımlayacak yöntemlerden biri bu hücrelerin salgıladığı organik asit düzeylerinin ölçümüdür. Geniş bileşik sınıfı organik asitler, aminoasit metabolizması gibi primer metabolik yollarda, yağ asidi oksidasyonu, lipit metabolizması, krebs döngüsü vb. ara maddeler olarak ortaya çıkar. In-vivo koşullarda organik asit konsantrasyonları diğer doku ve organ fonksiyonlarına bağlı olarak değişkenlik gösterebilse de, izole edilmiş hücre kültür ortamında bu ara maddelerin sentezindeki eksitasyon ve inhibisyonlar daha doğru olarak saptanabilir. Bu çalışmada, MDA-MB-231 (meme adenokarsinomu) MCF-7, (duktal meme karsinomu) ve CRL 4010 normal hücre hattının organik asit düzeylerinin analizi ve bu ara metabolit düzeylerinin tanımlanması ve karşılaştırılması amaçlanmıştır. Hücre kültür ortam sıvısının 54 plazma organik asit düzeyi, LC-MS / MS tekniği kullanılarak ölçüldü. 28 organik asit panel-I, 26 organik asit panel-2 yöntemi kullanılarak gradyan elüsyonu ile 12 dakikada analiz edildi. Verilerin dağılımlarına göre yapılan istatistiksel analizde oxoproline, malicacid, sebacic acid, suberic acid, 3-methylglutaconic acid, glutaconic acid, 3-methyl-2-oxovaleric acid, pyruvic acid, 2-oh glutaric acid, 2 oh isocabroic acid, 3 oh isovaleric acid, 3 oh pentanoic acid, 2 keto glutaric acid, citric acid, ethyl malonic acid, lactic acid, methyl malonic acid, orotic acid düzeylerinde anlamlı değişiklikler saptandı. Östrojen reseptör pozitif MCF-7 duktal karsinomlu hücrelerin daha fazla diferansiye olmuş MDA-MB- 231 adenokarsinom hücrelerine göre sağlıklı hücrelere daha yakın fizyolojik aktivitelere sahip olduğu, kötü prognozlu histolojik yapının anaerobik solunum yolunu daha fazla seçtiği, TCA siklus aktivitesini kaybetme eğiliminde olduğu tespit edilmiştir. ER- (östrojen reseptör negatif) olan MDA-MB-231 hücreleri normal meme hücrelerinin gösterdiği özelliklerini kaybetmiştir. Kanser hücre metabolomiksinin gelişen LC-MS/MS tekniğiyle tanımlanması ve metabolit düzeylerinin analizi diferansiyasyonu artmış hücrelerin metastaz oluşumları ve programlı hücre ölümlerine direnç kazanmasıyla ilişkilendirilebilir. Metabolit düzeylerindeki değişikliklerden elde edilen ipuçları yeni tedavi stratejilerinin geliştirilmesinde fayda sağlayabilir.
Özet (Çeviri)
Breast cancer is the most common type of cancer in women and comes second after lung cancer. Chemotherapy is an indispensable treatment method in breast cancer, which shows different prognosis according to pathological typing. Even in the early stages of chemotherapy, the chance of full cure is low. The identification of metabolic activities and characteristics of cancer cells may be beneficial in terms of new treatment modalities and cure. One method to identify this is to measure the levels of organic acid secreted by these cells. Wide range of compound organic acids, primary metabolic pathways such as amino acid metabolism, fatty acid oxidation, lipid metabolism, krebs cycle and so on. as intermediates. Although organic acid concentrations may vary depending on other tissue and organ functions in in vivo conditions, excitations and inhibitions in the synthesis of these intermediates in isolated cell culture media can be more accurately detected. In this study, it was aimed to analyze the organic acid levels of MDA-MB-231 (breast adenocarcinoma) MCF-7, (ductal breast carcinoma) and CRL 4010 normal cell line and to identify and compare these intermediate metabolite levels. The plasma organic acid level of cell culture medium fluid 54 was measured using the LC-MS / MS technique. 28 organic acid panel-I were analyzed in 12 minutes by gradient elution using 26 organic acid panel-2 method. In the statistical analysis according to the distribution of data, oxoproline, malicacid, sebacic acid, suberic acid, 3-methylglutaconic acid, glutaconic acid, 3-methyl-2-oxovaleric acid, pyruvic acid, 2-oh glutaric acid, 2 oh isocabroic acid, 3 oh isovaleric acid, 3 oh pentanoic acid, 2 keto glutaric acid, citric acid, ethyl malonic acid, lactic acid, methyl malonic acid, orotic acid levels were found significant changes. It was found that estrogen receptor positive MCF-7 ductal carcinoma cells had more physiological activities closer to healthy cells than more differentiated MDA-MB-231 adenocarcinoma cells, histologic structure with poor prognosis chose more anaerobic airway and TCA cycle activity tended to lose activity. MDA-MB-231 cells, which are ER- (estrogen receptor negative), have lost the characteristics of normal breast cells. The identification of cancer cell metabolomics by developing LC-MS / MS technique and analysis of metabolite levels may be associated with increased differentiation of cells with resistance to metastasis formation and programmed cell death. Clues from changes in metabolite levels may be helpful in developing new treatment strategies.
Benzer Tezler
- Farklı meme kanseri hücre tiplerinin (MCF-7, MDA-MB-231 ve CRL-4010) serbest aminoasit profilinin incelenmesi
Investigation of the free aminoacide profile of different breast cancer cell types (MCF-7, MDA-MB-231 and CRL-4010)
MEVLUT BAHÇEVAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2019
BiyokimyaHarran ÜniversitesiTıbbi Biyokimya Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ İSMAİL KOYUNCU
- Polifenol katkılı ZIF-8 metal organik kafes ilaç taşıyıcı sistemlerin sentezi, karakterizasyonu ve antikanser etkilerinin araştırılması
Investigation of the synthesis, characterization and anti-cancer effects of polyphenol doped ZIF-8 metal organic framework drug delivery systems
MÜNTEHA ÖZSOY
- Molecular mechanism of drug induced apoptosis and chemoresistance in estrogen receptor alpha +/- breast cancer cell lines: MCF-7 and MDA-MB-231
Östrojen reseptör alfa +/- MCF-7 ve MDA-MB-231 meme kanseri hücrelerinde ilaçlarca tetiklenen apoptoz ve ilaca direnç moleküler mekanizması
ELİF DAMLA ARISAN
Doktora
İngilizce
2009
BiyolojiSabancı ÜniversitesiBiyoloji Bilimleri ve Biyomühendislik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. HÜVEYDA BAŞAĞA
- Meme kanseri ve hiperglisemi/hiperinsülinemi ilişkisinde hedef yolak inhibitörü bileşiklerin potansiyel etkilerinin in vitro araştırılması
Investigation of the potential effects of targeted pathway inhibitory compounds in breast cancer and hyperglycemia/hyperinsulinemia relationship, in vitro
BÜŞRA DEMİR ÇETİNKAYA
Doktora
Türkçe
2021
Eczacılık ve FarmakolojiEge ÜniversitesiFarmasötik Toksikoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. FERZAN LERMİOĞLU ERCİYAS
DOÇ. DR. ÇIĞIR BİRAY AVCI
- Meme kanserinde PKİ-402'nin PI3K/AKT/mtor yolağı ve radyo duyarlılık üzerindeki etkilerinin araştırılması
Investigation of the effects of PKI-402 on pi3k/AKT/MTOR pathway and radio sensitivity in breast cancer
ROYA GASIMLI