Geri Dön

Identification of tissue, developmental stage and stress response specificity of WRKY transcription factor family

WRKY transkripsiyon faktör ailesinin doku, büyüme evresi ve stress cevabı açısından özgünlüğünün tanımlanması

  1. Tez No: 573245
  2. Yazar: ESRA KARAKAŞ
  3. Danışmanlar: DOÇ. DR. ZAHİDE NESLİHAN ÖZTÜRK GÖKÇE
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Genetik, Ziraat, Genetics, Agriculture
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2019
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: Niğde Ömer Halisdemir Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Tarımsal Genetik Mühendisliği Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 108

Özet

WRKY transkripsiyon faktör ailesi bitkilerde stres faktörlerinin etkili olduğu durumlarda önemli role sahip olan en büyük protein ailelerinden biridir. Bu transkripsiyon faktörü ailesi özellikle bitkilerde stres faktörlerine maruz kalındığı durumlarda protein fonksiyonlarının kaybolmaması adına oldukça önemlidirler. Bu tezde seçilmiş olan 3 monokot ve 1 dikot olmak üzere toplamda dört bitkideki (Arabidopsis thaliana, Zea mays, Oryza sativa subsp. japonica ve Brachypodium distachyon) WRKY genleri belirlenmiş ve kuraklık, tuzluluk ve sıcaklık koşulları gibi başlıca abiyotik stres faktörleri altında ve bitkilerin farklı gelişim evrelerinde WRKY transkripsiyon faktörlerinin ifadelenme düzeyleri biyoinformatik yöntemler kullanılarak tespit edilmiştir. Her bitki için ayrı ayrı filogenetik ağaçlar oluşturulmuş, kromozomlar üzerinde WRKY genlerinin yerleri ve korunmuş bölgeleri belirlenmiş, yapılan in silico çalışmalarla ayrıca gen yapısı (ekzon/intron), gen ontolojisi ve hedef miRNA'lar tespit edilerek WRKY proteinlerinin annotasyonu amaçlanmıştır.

Özet (Çeviri)

The WRKY transcription factor family is one of the largest protein families that has an important role in stress. Especially in plants they have a crucial importance to maintain the protein functions in situations where plant exposed to stress factors. In this study, in four plants selected as 3 monocots and 1 dicot, Arabidopsis thaliana, Zea mays, Oryza sativa subsp. japonica and Brachypodium distachyon, WRKY genes were identified and changes in WRKY transcription under different abiotic stress factors such as drought, salinity and temperature conditions were investigated. The expression levels of the factors were determined using bioinformatics methods. Phylogenetic trees were created for each plant separately, the location and conserved regions of WRKY genes on chromosomes were determined, gene structure (exon / intron), gene ontology and target miRNAs were determined and annotation of WRKY proteins was aimed with these in silico studies.

Benzer Tezler

  1. Yabani zeytin (Olea europaea L. var. oleaster) bitkisi genomunda MADS-box transkripsiyon faktörü ailesi tanımlanması ve qRT- PZR ile ifade analizi

    Identification and expression analysis of MADS-box transcription factor family genes in wild olive (Olea europaea L. var. oleaster) genome

    GÜNSELİ BABAOĞLU

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2016

    BiyolojiÇankırı Karatekin Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. TURGAY ÜNVER

  2. Arı sütü ve rosmarinik asitin yara iyileştirme potansiyelinin araştırılması

    Investigation of wound healing potential of royal jelly and rosmarinic acid

    YUNUS AKSÜT

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2024

    Biyolojiİstanbul Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. EMİNE ŞEKÜRE NAZLI ARDA

  3. Deniz ürünlerinin toplam antioksidan kapasitesinin spektroskopik tayini

    Spectroscopic analysis of total antioxidant capacity of seafood products

    ELENUR İMERT

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2024

    Kimyaİstanbul Teknik Üniversitesi

    Kimya Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. BİRSEN ÖZTÜRK

    DOÇ. DR. DİLEK ÖZYURT

  4. Patlıcan (Solanum melongena L.) bitkisi tohumlarının çimlenmesinde çinko (Zn) stresi ile meydana gelen DNA değişikliklerinin belirlenmesi

    Identification of DNA changes in eggplant (Aubergine) (Solanum melongena L.) seedlings induced by zinc stress

    SHAPOUR GHABELNEZAM

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2015

    BiyolojiAnkara Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. EMİNE SÜMER ARAS

  5. Design of fluorescent probes for bioorthogonal labeling of carbonylation in live cancer cells

    Canlı kanser hücrelerinde karbonilasyon işaretlenmesi için biyoortogonal floresan probe sentezi

    HAZEL ERKAN

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2018

    BiyoteknolojiYeditepe Üniversitesi

    Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. DİLEK TELCİ

    DOÇ. DR. ÖZLEM DİLEK