Kıyma, et, tavuk ve peynir örneklerinden izole edilen Escherichia coli'nin bazı antimikrobiyal direnç ve virülans genlerinin PCR ile tespiti
Dedection of some antimicrobial resistance and virulence genes of Escherichia coli isolated from ground meat, meat, chicken, cheese samples by PCR
- Tez No: 575545
- Danışmanlar: PROF. DR. AYTEN ÇELEBİ KESKİN
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyomühendislik, Bioengineering
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2019
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Kırıkkale Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyomühendislik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 100
Özet
E. coli insanların ve sıcakkanlı hayvanların bağırsağındaki yaygın bakterilerden biridir. E. coli suşları dünya çapında çeşitli gıda kaynaklı hastalıklara neden olur ve halk sağlığını tehdit ederler. E. coli'nin bazı suşları virülans genler ve antimikrobiyal direnç genlerine sahiptir. E. coli suşlarının virülans genleri adezinleri, demir kazanım sistemlerini, lipoproteinleri, kapsüler polisakkaritleri kodlarlar. Bunlar insanlarda E. coli'nin hastalık yapmasına neden olurlar. Bazı E.coli suşları hastalıkların tedavisinde kullanılan trimetoprim, beta-laktam, makrolid ve kinolon gibi önemli antimikrobiyallere direnç gösterirler. Bu çalışmanın amacı, Bolu ilindeki çeşitli marketlerden toplanan et, tavuk, kıyma, peynir örneklerinden izole edilen 283 E. coli izolatının fimH, fyuA, papG II, traT, kpsMT II virülans genleri ve gyrA, dhfrV, ereA, blaTEM, blaCTX-M antimikrobiyal direnç genlerinin bulunma sıklığını Polimeraz Zincir Reaksiyonu (PCR) ile tespit etmektir. PCR hızlı, kolay, doğru ve ekonomik olduğundan tercih edilmiştir. Çalışmamızda varlığını araştırdığımız virülans genleri ve antimikrobiyal direnç genleri farklı oranlarda tespit edilmiştir. Antimikrobiyal direnç genlerinden blaCTX-M hiçbir izolatta tespitedilemezken, gyrAgeni tüm izolatlardatespit edilmiştir. ereA geni ise sadece 2(%1,48) izolatta tespit edilmiştir. Çalışmamızdaki izolatlardan 2 (T42, T43)'sinde 4 (gyrA, dhfrV, ereA, blaTEM) antimikrobiyal direnç geni tespit edilmiştir. 39 izolatta hiçbir virülans gen tespit edilememiştir. Çalışılan izolatlarda en çok fimH (%61) virülans geni tespit edilirken, en az papG II (%13,4) ve kpsMT II (%13,1)genleri tespit edilmiştir. Çalışmamızın sonuçları; tükettiğimiz hayvansal gıdalarda virülans genlerin ve antimikrobiyal direnç genlerinin oldukça yaygın olduğunu moleküler yöntemlerle ortaya koymuştur ve hayvanlardan insanlara antimikrobiyal direncinin geçmesi için potansiyel bir kaynak olduğunu göstermiştir.
Özet (Çeviri)
Escherichia coli is one of the most common bacteria of human and warm-blooded animals intestinal. E. coli strains cause various foodborne diseases worldwide and threat public health. Some strains of E. coli have virulance genes and antimicrobial resistance genes. Virulence genes of E.coli strains encode adhesins, iron acquistion systems, lipoproteins, capsular polysaccharides.Some strains of E. coli are resistant to important antimicrobials such as trimethoprim, beta-lactam, macrolide and quinolone used in the treatment of diseases. The aim of this study was to determine the frequencyoffimH, fyuA, papG II, traT,kpsMT II virulence genes andthe frequency of gyrA, dhfrV, ereA, blaTEM, blaCTX-M antimicrobial resistance of 283 E. coli strains isolated from meat, chicken, minced meat and cheese samples collected from various markets of Bolu provinceby Polymerase Chain Reaction (PCR). PCR is preferred because it is fast, easy, accurate and economical. The virulence genes and antimicrobial resistance genes that we investigated in our study were dedected at different rates. blaCTX-M, one of the antimicrobial resistance genes, was not detected in any of the isolates, whereas the gyrA gene was detected in all isolates.ereAgene wasdedected in only 2 (1.48%)isolates. 4 antimicrobial resistance genes(gyrA, dhfrV, ereA, blaTEM) were detected in 2 of the isolates(T42, T43) in our study. No virulence genes were detected in 39 isolates. While the most virulence gene was dedected to be fimH (61%), at least papG II (13.4%) and kpsMT II (13.1%)genes were dedected in the isolates. The results of our study; It has been demonstrated by molecular methods that virulence genes and antimicrobial resistance genes are very common in animal foods we consume and have shown that it is a potential source for passing antimicrobial resistance from animals to humans.
Benzer Tezler
- Bazı gıdalardan izole edilen escherıchıa colı suşlarında ki antimikrobiyal direnç ve virülans faktör genlerinin yaygınlığı ve dağılımının moleküler karakterizasyonu
Molecular characterization of prevalence and distribution of the antimicrobial resistance and virulence factor genes in escherichia coli strains isolated from some foods
CANSU BAŞAK ÖZIŞIK
Yüksek Lisans
Türkçe
2019
BiyomühendislikKırıkkale ÜniversitesiBiyomühendislik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. AYTEN ÇELEBİ KESKİN
- Türkiye'de üretilen pastırma, sucuk, peynir gibi gıda örneklerindeki biyojenik aminlerin belirlenmesi
Determination of biogenic amines in food samples such as, pastrami, sausage, cheese which were produced in Turkey
BERNA KILIÇ
- Gıda ve gıdalar ile temas eden yüzeylerden elde edilen staphylococcus aureus izolatlarında bıyofılm üretiminin fenotipik ve genotipik karakterizasyonu
Phenotypic and genotypic characterization of biofilm production in staphylococcus aureus isolates from food and food contact surfaces
NİHAT AKYOL
Yüksek Lisans
Türkçe
2023
Veteriner HekimliğiErciyes ÜniversitesiVeteriner Besin Hijyeni ve Teknolojisi Ana Bilim dalı
PROF. DR. NURHAN ERTAŞ ONMAZ
- Hayvansal kaynaklı bazı gram pozitif bakterilerdeki beta laktamaz ve beta laktam dirençliliğinin saptanması
Determination beta lactamase and resistance of beta lactam's from some of gram positive bacteria
MERYEM BURCU KAVUKOĞLU
- Tekirdağ'da satışa sunulan bazı hayvansal ürünlerde salmonella SPP., escherichia coli o157 ve listeria monocytogenes prevalansının belirlenmesi ve suşların antibiyotik duyarlılıkların saptanması
Determination of salmonella spp E. coli o157 and. L. monocytogenes, prevalance and antibiotic resistance in some animal products offered for sale in Tekirdağ province
CAN ATABEY
Doktora
Türkçe
2020
Besin Hijyeni ve Teknolojisiİstanbul Üniversitesi-CerrahpaşaBesin Hijyeni ve Teknolojisi Ana Bilim Dalı
PROF. DR. TOLGA KAHRAMAN
PROF. DR. AHMET KOLUMAN