Van Belediye mezbahasında kesilen ruminantlarda paramphistomum SPP.'nin moleküler identifikasyonu
Molecular identification of paramphistomum SPP. in ruminants cut in Van municipality slaughterhouse
- Tez No: 584174
- Danışmanlar: DR. ÖĞR. ÜYESİ AYŞE SONA
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Parazitoloji, Parasitology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2019
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Van Yüzüncü Yıl Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Parazitoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 47
Özet
Paramphistomum türlerinin morfolojik olarak teşhisi mikroskobik yöntemlerle yetersiz olduğundan, kesin teşhis için moleküler yöntemlere ihtiyaç duyulmaktadır. Bu çalışma Mart 2018–Eylül 2018 tarihleri arasında Van Belediye mezbahasına kesime getirilen ruminantlarda bulunan Paramphistomum spp.'nin moleküler yöntemler ile identifikasyonu amaçlandı. Çalışma materyali, toplam 100 adet enfekte ruminantdan (50 sığır ve 50 koyun) toplanan ergin Paramphistomum spp.'lerden oluşmaktadır. Paramphistomum parazitlerinin DNA izolasyonları, ticari kit ile yapıldıktan sonra rDNA ITS2 gen bölgesi PCR ile çoğaltıldı. Elde edilen PCR ürünleri agaroz jelde yürütülerek 399 bp'lik bantlar elde edildi. Amplikonlar sekanslanmış ve BLAST ile Genbank'daki referans sekanslarla karşılaştırıldı. İzolatların genotipleri tam veya en yakın benzerliklerine göre belirlendi. Ayrıca, Neighbour-Joining Tree kullanılarak MEGA 7 program ile filogenetik ağaç oluşturuldu. Çalışmamızda elde edilen 10 adet PCR ürünününden çift yönlü sekans analizi yapıldı. Sekans analizi sonucu 5 koyun ve 3 sığırdan Paramphistomum leydeni, 2 adet sığırdan ise Calicophoron daubneyi identifiye edildi. Sonuç olarak, Türkiye'de daha önce morfolojik tanı yöntemleri ile varlığı bildirilen Calicophoron daubneyi'nin Van ilinde moleküler yöntemler ile varlığı kesinlik kazanmış olup, ayrıca daha önce Türkiye'de bildirilmeyen P. leydeni ise ilk defa moleküler yöntemlerle bu çalışma ile tespit edildi.
Özet (Çeviri)
Since the morphological diagnosis of Paramphistomum species is insufficient by microscopic methods, molecular methods are needed for definitive diagnosis. In this study, it was aimed to identify by molecular methods of Paramphistomum spp in ruminants that were brought in Van Municipality slaughterhouse between March 2018 and September 2018. The study material consisted of adult Paramphistomum spp, collected from 100 infected ruminants (50 cattle and 50 sheep). DNA isolations of Paramphistomum parasites were made by commercial kit and then rDNA ITS2 gene region was amplified by PCR. The resulting PCR products were run on agarose gel and 399 bp bands were obtained. Amplicons were sequenced and compared with reference sequences in Genbank with BLAST. Genotypes of isolates were determined according to their complete or nearest similarities. Also, a phylogenetic tree was created with MEGA 7 program by using Neighbor-Joining Tree. In our study, bi-directional sequence analysis was performed from 10 PCR products obtained. As a result of the sequence analysis, 5 sheep and 3 cattle were identified as Paramphistomum leydeni, while 2 cattle were identified as Calicophoron daubneyi. In conclusion, previously diagnosed with of morphological methods C. daubneyi in Turkey which has become definite the diagnosis with molecular methods in Van province. Also the presence of the previously unreported P. leydeni was determined by molecular methods for the first time in Turkey.
Benzer Tezler
- Van Belediye Mezbahasında kesilen ruminantlarda helmint enfeksiyonlarının yayılış oranları
Incidence of helminth infestation in ruminants sloughtered in Van municipality sloughter house
MUSTAFA CELLAT
Yüksek Lisans
Türkçe
2003
Veteriner HekimliğiYüzüncü Yıl ÜniversitesiParazitoloji (Veterinerlik) Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. ABDURRAHMAN GÜL
- Van Mezbahası'nda kesilen hayvanlarda paraziter fauna tesbiti çalışmaları
Başlık çevirisi yok
ZEYNEP TAŞ
Yüksek Lisans
Türkçe
1997
Veteriner HekimliğiYüzüncü Yıl ÜniversitesiParazitoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ.DR. SERDAR DEĞER
- Van Belediye Mezbahası'nda kesilen koyun ve keçilerde Dicrocoeliasis'in yayılışı
Spread the cut Dicrocoeliasis sheep and goats in Van Municipal Slaughterhouse
SERDAR KUŞMAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2015
ParazitolojiYüzüncü Yıl ÜniversitesiParazitoloji (Veterinerlik) Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MUSTAFA SERDAR DEĞER
- Mezbahada kesilen koçların orşitis ve epididimitisleri üzerine makroskobik, mikroskobik ve immunohistokimyasal incelemeler
Macroscopic, microscopic and immunohistochemical studies on orchitis and epididymitis in rams slaughtered at slaughterhouse
ÖMER FARUK KELEŞ
Yüksek Lisans
Türkçe
2016
PatolojiYüzüncü Yıl ÜniversitesiParazitoloji (Veterinerlik) Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ZABİT YENER
- Van ve yöresinde fascioliasis
Fascioliasis in Van and its region
ERHAN ERASLAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2001
Veteriner HekimliğiYüzüncü Yıl ÜniversitesiParazitoloji (Veterinerlik) Ana Bilim Dalı
DOÇ.DR. SERDAR DEĞER