Beş yıllık idrar kültür sonuçlarının değerlendirilmesi ve izole edilen Escherichia coli suşlarının antimikrobiyal direnç profilleri
Evaluatuan of the five year urine culture results and antimicrobial suscepbility profiles of E.coli strains from urine
- Tez No: 586034
- Danışmanlar: PROF. DR. OSMAN AKTAŞ
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
- Anahtar Kelimeler: E. coli, İdrar kültürü, İdrar yolları enfeksiyonu, Antimikrobiyal direnç, Erzurum, E. coli, Urine culture, Urinary tract infections, Antimicrobial resistance, Erzurum
- Yıl: 2019
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Atatürk Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 114
Özet
Amaç: Bu çalışmanın amacı, hastaneye başvuranlarda ve hastanede yatarak tedavi görenlerde idrar kültür sonuçlarının mikrobiyolojik bir değerlendirmesini yapmak ve izole edilen Escherichia coli suşlarının antimikrobiyal direnç profillerinin yıllar içerisindeki değişimini araştırmaktır. Materyal ve Metot: Atatürk Üniversitesi Araştırma Hastanesine 2014-2018 yıllarında başvuran ve hastanede yatmakta olan hastaların idrar kültür sonuçları retrospektif olarak değerlendirilmiştir. İzole edilen mikroorganizmaların tanısı ve Escherichia coli suşlarının antibiyotik duyarlılıkları rutin yöntemlerle ya da VITEK® 2 (bioMérieux Clinical Diagnostics, France) ya da BD Phoenix™ otomatize identifikasyon ve duyarlılık test sistemi cihazlarıyla araştırılmıştır. Bulgular: 162.296 idrar örneğinin 213 (% 0.1)'u uygunsuz örnek olduğu için işleme alınmamış; kültürü yapılan örneklerin 25.533 (% 15.7)'ünden pozitif sonuç alınmış; 16.985 (%10.5)'inde kontaminasyon gözlenmiştir. Kültür pozitifliği kadınlarda erkeklere oranla; küçük yaşlarda ve yaşlılarda genç yaşlara oranla yüksek bulunmuştur. Kültür pozitifliği ayaktan hastalarda (% 38,6), yatarak tedavi görenlere (% 38,4) kıyasla çok daha yaygındı. En sık izole edilen bakteri 12.247 (%48.0) suşla Escherichia coli olmuş bunu sırasıyla suşla Enterococcus spp. (%9.1), koagülaz negatif stafilokok (%8.3), Candida spp. (%6.9) ve Klebsiella pneumoniae (%6.9) takip etmiştir. Escherichia coli suşlarının 3401 (%27.8)'i ESBL pozitif bulunmuştur. Escherichia coli suşlarına en etkili antibiyotikler imipenem, meropenem, ertapenem ve amikasin olmuş en fazla direnç ise ampisilin, piperasilin, ampisilin-sulbaktam, TMP-SMX ve siprofloksasine gözlenmiştir. Sonuç: Erzurum'da toplum ya da hastane kaynaklı idrar yolu enfeksiyonu yüksek oranlarda tespit edilmiştir. Escherichia coli suşlarının tedavilerinde kullanılan antibiyotiklerin önemli bir kısmına yüksek oranlarda dirençli oldukları; bu dirençliliğin özellikle ESBL üreten suşlarda çok daha yüksek olduğu görülmüştür. ESBL üretmeyen Escherichia coli suşlarının 2018 yılındaki direnç artışı dikkat çekici boyutlardadır.
Özet (Çeviri)
Aim: The aim of this study was to make a microbiological evaluation of urine culture results in hospitalized and non-hospitalized patients and to investigate the variation of antimicrobial resistance profiles of Escherichia coli strains isolated from urine. Material and Method: During a five-year period between 1 January 2014 and 31 December 2018, a total of 162.296 urine culture results of hospitalized and non-hospitalized patients were retrospectively evaluated. Diagnosis of isolated microorganisms and antibiotic susceptibility of Escherichia coli strains were investigated by routine methods or automated identification and susceptibility test systems such as VITEK® 2 (bioMérieux Clinical Diagnostics, France) or BD Phoenix™. Results: Of the 162.296 specimens, 213 (0.1%) were not processed because they were inappropriate; positive results were obtained from 25.533 (15.7%) of the cultured samples; contamination was observed in 16.985 (10.5%). Culture positivity in women compared to men; it was found to be higher in early ages and older people compared to younger ages. Culture positivity was far more common in outpatients (61.6%) compared to inpatients (38.4%). The most frequently isolated bacteria was Escherichia coli with 12.247 (48.0%) strains and followed Enterococcus spp. (9.1%), Coagulase-negative staphylococci (%8.3), Candida spp., (%6.9) and Klebsiella pneumoniae strains, respectively. Of the Escherichia coli strains, 3401 (27.8%) were ESBL positive. The most effective antibiotics for Escherichia coli strains were imipenem (0.7% resistance), ertapenem (4.7% resistance) and amikacin (5.1% resistance), respectively. Conclusion: Community or hospital-acquired urinary tract infection was found to be high in Erzurum. Escherichia coli strains are highly resistant to a significant proportion of antibiotics used in the treatment; this resistance was found to be much higher, especially in ESBL producing strains. The increase in resistance rates of ESBL-producing Escherichia coli strains in 2018 is remarkable.
Benzer Tezler
- Ege Üniversitesi Tıp Fakültesi Hastanesi İç Hastalıkları Anabilim Dalı'nda beş yıllık sürede otolog kök hücre nakli yapılan hastalardan alınan kültürlerin alınma sıklığı ve kültürlerde üreyen mikroorganizmaların retrospektif olarak değerlendirilmesi
Başlık çevirisi yok
DEMET KÖSELİ
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2008
Klinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon HastalıklarıEge ÜniversitesiEnfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. A.ÇAĞRI BÜKE
- Böbrek nakli uygulanmış hastalarda görülen idrar yolu enfeksiyonları ve risk faktörlerinin değerlendirilmesi
Researching of urinary tract infection and risk factors after renal tranplantation
HASAN ÇETİN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2015
ÜrolojiOndokuz Mayıs ÜniversitesiÜroloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. YARKIN KAMİL YAKUPOĞLU
- K.K.K. lığı Askerî Mahkemesi kararlarına göre askerî itaat ve inkıyadı bozan suçlar
Military crimes against military obedience and order according to Turkish army Military Court's verdicts
HAKAN CANDAR
Yüksek Lisans
Türkçe
2005
Savunma ve Savunma TeknolojileriKara Harp Okulu KomutanlığıGüvenlik Bilimleri Ana Bilim Dalı
DR. ALİ UZUN
- Periton diyalizi hastalarında periton eşitleme testinin yıllar içerisinde değişimi ve bu değişime etki eden faktörlerin tespiti
Changes of peritoneal equalization test in years at peritoneal dialysis patients and determination of factors affecting this change
HASAN SÖZEL
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2014
NefrolojiAkdeniz ÜniversitesiDahili Tıp Bilimleri Bölümü
PROF. DR. FETTAH FEVZİ ERSOY
- Çocuk yoğun bakım ünitesinde yatan hastalarda sağlık bakımı ilişkili enfeksiyonların incelenmesi: Beş yıllık sürveyans çalışması
Evaluation of healthcare service-associated infections in patients admitted to pediatric intensive care unit: A 5-years surveillance study
AYŞEGÜL ŞAHİN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2021
Çocuk Sağlığı ve HastalıklarıErciyes ÜniversitesiÇocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ BENHUR ŞİRVAN ÇETİN