A qsar study on the mutagenic activity of azo dyes and aromatic amine derivatives
Azo boyaları ve aromatik amin türevlerinin mutajenik aktivitesi üzerine bir kyai çalışması
- Tez No: 613330
- Danışmanlar: PROF. DR. MELEK SAÇAN
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Çevre Mühendisliği, Environmental Engineering
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2019
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Boğaziçi Üniversitesi
- Enstitü: Çevre Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Çevre Bilimleri Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 119
Özet
Bu çalışmada, çeşitli azo boyaları ve aromatik amin türevlerinin S9 aktivasyonlu TA98 Salmonella typhimurium bakteri türü üzerindeki mutajenik aktivitesi kullanılarak kantitatif yapı - aktivite ilişkisi (KYAİ; (QSAR)) modeli geliştirilmiştir. Model geliştirme için gerekli tanımlayıcılar SPARTAN (v.10) ve DRAGON (v.7.0) yazılım programları ile elde edilmiştir. Tanımlayıcıların seçimi, QSARINS (v.2.2.3) yazılımında bulunan araçlar ile yapılmıştır. Tüm veri setinin % 80'i ve % 20'si sırası ile eğitim ve test setleri olacak şekilde farklı ayrımlar denenmiştir. 6 (CIC2, Chi_D/Dt, L/Bw, TDB09p, Mor28s and piPC08) tanımlayıcı ile nihai modeli oluşturulmuştur. Nihai modelin tahmin yeteneği, deneysel mutajenite verisi olmayan, halihazırda kullanılan 33 anyonik suda çözünür tekstil boyalarını (sekiz antrakinon ve 25 azo boyası) içeren harici bir veri seti kullanılarak test edilmiştr. Oluşturulan modelin uygulanabilirlik alanı (AD), hem aktivite hem de tanımlayıcıların oluşturduğu aralık gözönünde bulundurularak tanımlanmıştır. Önerilen KYAİ modelinin yapısal olarak dış setteki bileşiklerin %70 'ini kapsadığı görülmüştür. Halen kullanımda olan 22 adet antrakinon ve azo boyasının mutajenik aktiviteleri, önerilen QSAR modelinin uygulanabilirlik alanı içinde kalmıştır. Bu da mutajenik aktivitelerinin model tarafından iyi tahmin edildiklerini göstermiştir. En yüksek mutajenik aktivite gösteren, pamuk, elyaf boyama ve deri gölgemesi için kullanılmakta olan 6 antrakinon boyanın mutajenik aktivitelerinin sıralaması Asit Mavi 62>Asit Mavi 40>Asit Mavi 45>Asit Mavi 80>Asit Mavi 230>Asit Mavi 344 'tür. En düşük mutajenik aktiviteye sahip azo boya ise esas olarak pamuk, ipek, yün ve bunların karışımlı kumaş boyaması ve baskısı için kullanılmakta olan Direkt Turuncu 34' tür. Bu boya ayrıca deri ve kağıt gölgelemesi için de kullanılmaktadır.
Özet (Çeviri)
In the present study, the mutagenic activity of diverse structure of azo dyes and aromatic amine derivatives on TA98 Salmonella typhimurium bacterial strain with S9 activation was used to generate a quantitative structure – activity relationship (QSAR) model. The descriptors required for the model development were obtained by SPARTAN (v.10), DRAGON (v.7.0) software packages. The selection of descriptors was carried out by the tools implemented in QSARINS (v.2.2.3) software. Many division trials were performed on the dataset as training and test sets which comprise the 80% and 20% of the whole set, respectively. 6 descriptors (CIC2, Chi_D/Dt, L/Bw, TDB09p, Mor28s and piPC08) constitute the final model. The applicability domain (AD) of the generated QSAR model was defined by both the ranges of response and descriptors. The predictive ability of the final model was tested using an external dataset consisting of currently used 33 anionic water soluble textile dyes (eight anthraquinone and 25 azo dyes) with no experimental mutagenicity data. The proposed QSAR model had 70% structural coverage for the external set chemicals. The mutagenic activities of 22 current textile dyes belonging anthraquinone and azo dyes fell within the applicability domain of the proposed QSAR model which means that they were well predicted by the model. The order of 6 anthraquinone dyes which are mainly used for cotton, fiber dyeing and leather shading with the most mutagenic activity is: Acid Blue 62>Acid Blue 40>Acid Blue 45>Acid Blue 80>Acid Blue 230>Acid Blue 344. The least mutagenic azo dye is Direct Orange 34 which is mainly used for cotton, silk, wool and their blended fabric dyeing and printing, also can be used for leather and paper shading.
Benzer Tezler
- Sülfonamit artığı taşıyan yeni pirazol türevlerinin sentezi ve sitotoksik etkilerinin araştırılması
Synthesis of new pyrazole derivatives containing sulfonamide moiety and investigation of their cytotoxic effects
DİLAN ÖZMEN ÖZGÜN
Doktora
Türkçe
2021
Eczacılık ve FarmakolojiAtatürk ÜniversitesiFarmasötik Kimya Ana Bilim Dalı
PROF. DR. H. İNCİ GÜL
- In vitro and in silico evaluation of hedera helix extract for mutagenic/antimutagenic activities and protective effects against inflammation
Hedera helix ekstresinin mutajenik, antimutajenik ve inflamasyona karşı koruyucu etkilerinin in vitro ve in silico değerlendirmesi
MAKBULE KÜBRA DOĞAN
Yüksek Lisans
İngilizce
2022
Farmasötik ToksikolojiYeditepe ÜniversitesiFarmasötik Toksikoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. MUHAMMED HAMİTOĞLU
DR. ÖĞR. ÜYESİ GÜLÇİN TUĞCU
- Bazı 2-Sübstitüye-N-[4-(1-Metil-4,5-Difenil-1H-İmidazol-2-İl)Fenil] asetamid türevlerinin sentezleri ve antikanser aktivitelerinin araştırılması üzerine çalışmalar
Studies on the Synthesis and Anticancer Activity Investigation of Some 2-substitued-N-[4-(1-Methyl-4,5-Diphenyl-1H-Imidazole-2-yl)Phenyl] Acetamide Derivatives
YUSUF ÖZKAY
Doktora
Türkçe
2009
Eczacılık ve FarmakolojiAnadolu ÜniversitesiFarmasötik Kimya Ana Bilim Dalı
PROF. DR. İLHAN IŞIKDAĞ
- Parazitik bitki Cuscuta sp. türlerini kontrol etmek amacıyla kullanılabilecek bazı doğal biyomoleküllerin in-silicomoleküler karakterizasyonu
In-silico molecular characterization of natural biochemicals to control the parasitic plant Cuscuta sp.
PINAR ÖZDEMİR
Yüksek Lisans
Türkçe
2023
KimyaÜsküdar ÜniversitesiMoleküler Biyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. VİLDAN ENİSOĞLU ATALAY
DR. ÖĞR. ÜYESİ MEHMET EMİN URAS
- Kumarinlerin karbonik anhidraz CA-XII izo-enzimine karşı inhibitör aktivitelerinin QSAR modellemesi
QSAR study of coumarin derivatives as carbonic anhydrase CA-XII isozyme inhibitors
MEHMET KIYTAK