Analysis of tnfrsf10b-as long-noncoding rna's effects on various cancer cell properties
Tnfrsf10b uzun kodlanmayan rna'sının değişik kanser hücre özellikleri üzerine etkilerinin incelenmesi
- Tez No: 616761
- Danışmanlar: PROF. DR. BÜNYAMİN AKGÜL
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Genetik, Genetics
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2019
- Dil: İngilizce
- Üniversite: İzmir Yüksek Teknoloji Enstitüsü
- Enstitü: Mühendislik ve Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: 53
Özet
Uzun kodlanmayan RNA'lar 200 nükleotid uzunluğundan daha fazla olup RNA moleküllerinin farklı bir sınıfını oluşturmaktadırlar. Birçok çalışma gösteriyor ki bu RNA'lar kanser gelişiminin de içinde bulunduğu hücresel proseslerde düzenleyici görev almaktadırlar. Bu özellik onların kanseri teşhis ve tedavi etmede birer potansiyel biyoişaret olmasına olanak sağlar. Bu çalışmada TNFRSF10B uzun kodlanmayan RNA'sının değişik kanser hücre özellikleri üzerine etkilerinin incelenmesi amaçlanmıştır. Doxorubicin, Fas mAB, TNF-alpha and Cisplatin ile muamele edilmiş HeLa hücre hattından seçildi ve seçilen aday uzun kodlanmayan RNA'ların ifade düzeyleri metastatic (H1299 and MDA-MB-231), metastatik olmayan (A549 and MCF-7) ve sağlıklı (BEAS2B and MCF10A) hücre hatları üzerinde qPCR ile tespit edildi. Birkaç aday arasından TNFRSF10B-AS ve lncCAMTA1 seçildi ve bu uzun kodlanmayan RNA'ların etkileri hücre proliferasyon analizi yapılarak araştırıldı. qPCR sonuçlarından bu RNA'ların hücre karşılaştırmalarından en az birinde farklı ifade edildiği görüldü. Buna ek olarak TNFRSF10B-AS'in susturulmasının HeLa hücre hattında proliferasyonun azalmasına neden olduğu tespit edildi. lncCAMTA1'in susturulmasının veya fazla ifadesinin herhangi bir fenotipic etkiye neden olmadığı yapılan apoptoz ve proliferasyon çalışmalarıyla tespit edildi. Ayrıca, TNFRSF10B-AS'nin HeLa dışındaki diğer hücre hatlarında susturulması sonucu da herhangi bir fenotipik değişiklik gözlemlenemedi.
Özet (Çeviri)
Long noncoding RNAs (lncRNAs) being longer than 200 nucleotides constitute a different class of RNA molecules. Several studies indicated that they have regulatory role in cellular processes including cancer development. Some of them have exclusively high expression in particular cancer types and regulate certain cancer cell properties. This renders them potential biomarker or therapeutic target in cancer. In this study, effects of a candidate lncRNA TNFRSF10B-AS and lncCAMTA1 on cancer cell properties were investigated. Candidate lncRNAs from Doxorubicin, Fas mAB, TNF-alpha and Cisplatin treated HeLa cell line were chosen and their expression level was measured in different cell lines including healthy (BEAS2B and MCF10A), metastatic (H1299 and MDA-MB-231) and non-metastatic cell lines (A549 and MCF-7) by qPCR. From a few candidates lncCAMTA1 and TNFRSF10B-AS were selected for further analysis. qPCR results obtained from comparison of different cancer cell lines showed that their expression differs at least in one comparison of cell lines. TNFRSF10B-AS silencing decreased proliferation of HeLa cells. lncCAMTA1 was silenced or overexpressed in HeLa cells but phenotypic effect couldn't be detected by apoptosis and cell proliferation assay. Additionally, phenotypic effect also couldn't be observed in other cell lines when TNFRSF10B-AS was silenced.
Benzer Tezler
- Molecular characterization of long non coding rnas that mediate apoptosis in human
İnsanda apoptozu düzenleyen uuzun kodlamayan rna'ların moleküler karakterizyonu
OSAMA ABDELHADY BIAOMY SWEEF
Doktora
İngilizce
2020
Biyolojiİzmir Yüksek Teknoloji EnstitüsüMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. BÜNYAMİN AKGÜL
- Bazı bitki ekstrelerinin in vitro antikanser ve apoptotik aktivitelerinin değerlendirilmesi
Assessment of in vitro anticancer and apoptotic activities of some plant extracts
FULYA TUĞBA ARTUN
Doktora
Türkçe
2018
Biyolojiİstanbul ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ALİ KARAGÖZ
- Hücre kültüründe apoptozun moleküler mekanizmaları üzerine gama radyasyonunun etkileri
The effects of gamma radiation on molecular mechanisms of apoptosis on cell culture
WALID KHALILIA
- İzoindol türevli bileşiklerin insan meme ve kolon kanseri hücrelerinde çoklu ilaç direncine ve apoptotik sinyal yolaklarına etkilerinin belirlenmesi
Investigation of the effects of isoindol derivative compounds on multi-drug resıstance and apoptotic signaling pathways in human breast and colon cancer cells
SEDA MESCİ
- Peri-implantitisli bireylerde genetik yatkınlıkta hastalıkta etkin rol oynayan enflamatuar mediyatörlerin, olası gen polimorfizmlerinin etkilerinin incelenmesi
Analysis of Pro-inflammatory cytokines gene polymorphisms in periimplantitis patients
MELİS SOYTÜRK
Doktora
Türkçe
2019
Diş Hekimliğiİstanbul ÜniversitesiPeriodontoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. HALİL ERHAN FIRATLI