Escherichia coli izolatlarında hızlı duyarlılık yöntemi geliştirilmesi
Development of rapid susceptibility method in Escherichia coli isolates
- Tez No: 617381
- Danışmanlar: PROF. DR. BELMA DURUPINAR
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
- Anahtar Kelimeler: Escherichia coli, duyarlılık yöntemi, rezasurin mikroplak yöntemi, Escherichia coli, susceptibility method, resazurin microplate metod
- Yıl: 2019
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Ondokuz Mayıs Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 94
Özet
Amaç: Bakterilerin etken olduğu enfeksiyonlarda erken mikrobiyolojik tanı ve antibiyotik tedavisine erken başlanması hayati öneme sahiptir. Bu çalışmada, E. coli klinik izolatlarında hızlı sonuç veren yeni bir duyarlılık yönteminin geliştirilerek antibiyotik duyarlılık test sonuçlarının kısa sürede klinisyene raporlanması sağlanması amaçlanmıştır. Materyal ve Metot: Çalışmada 110 E. coli klinik izolatı test edilmiştir. E. coli izolatlarının duyarlılıklarının test edilmesinde EUCAST tarafından önerilen antibiyotiklerden; amoksisilin-klavulanat, sefiksim, seftriakson, ertapenem, siprofloksasin, gentamisin, trimetoprim-sulfametoksazol ve nitrofurantoin test edilmiştir. Kalite kontrol için de E. coli ATCC25922, E. coli ATCC35218, S. aureus ATCC29213 ve E. coli 13846NTCC suşları kullanılmıştır Rereferans yöntem olarak CLSI tarafından önerilen sıvı mikrodilüsyon yöntemi kullanılmış, MİK değerleri saptanarak EUCAST kriterlerine göre antimikrobiyal duyarlılıkları belirlenmiştir. Geliştirilen rezasurin mikroplak yöntemiyle referans mikrodilüsyon yöntemi sonuçları karşılaştırılmıştır. Bulgular: Çalışmamızda geliştirdiğimiz rezasurin mikroplak yönteminin referans yöntemle karşılaştırılması sonucunda test edilen 8 antibiyotik için hesaplanan TU oranlarının %82,72-100, KU oranlarının ise %95,45-100 arasında değiştiği tespit edilmiştir. Sonuç: Çalışmanın sonucunda, rezasurin mikroplak yönteminin sonuçlarınnın referans yöntem sonuçlarıyla yüksek seviyede uyumlu olduğu görülmüştür. Rezasurin mikroplak yöntemimiz, 5 saat gibi kısa süre içinde antibiyotik duyarlılıklarını saptanma olanağı sunarak, özellikle de kısıtlı imkanlara sahip hastane ve laboratuvarlar için tercih nedeni olabileceğini göstermiştir.
Özet (Çeviri)
Aim: It is vital to start early microbiological diagnosis and antibiotic treatment early in infections caused by bacteria. In this study, it was aimed to develop a new sensitivity method that provides rapid results in E. coli clinical isolates and to report the antibiotic susceptibility test results to the clinician in a short time. Material and Method: 110 E. coli clinical isolates were tested in the study. Antibiotics recommended by EUCAST for testing the sensitivity of E. coli isolates; amoxicillin-clavulanate, cefixime, ceftriaxone, ertapenem, ciprofloxacin, gentamicin, trimethoprim-sulfamethoxazole and nitrofurantoin were tested. For quality control, E. coli ATCC25922, E. coli ATCC35218, S. aureus ATCC29213 and E. coli 13846NTCC strains were used. Liquid microdilution method recommended by CLSI was used as reference method. MIC values were determined and antimicrobial susceptibilities were determined according to EUCAST criteria. The result of resazurine microplate method were compared. Results: As a result of comparing the resazurine microplate method developed in our study with the reference method, it was determined that the calculated TU ratios for 8 antibiotics varied between 82,72-100%, and the KU rates ranged between 95,45-100%. Conclusion: As a result of the study, it was observed that the results of the resazurine microplate method are highly compatible with the results of the reference method. Our resazurine microplate method has shown the possibility of detecting antibiotic susceptibilities within a short period of time, such as 5 hours, and has shown that it may be preferred for hospitals and laboratories with limited facilities.
Benzer Tezler
- Molecular identification and antimicrobial resistance profiles of Escherichia coli isolated in urine cultures from Shamiya State Hospital (Iraq)
Şamiye Devlet Hastanesi (Irak) idrar kültürlerinden izole edilen Escherichia coli'nin moleküler tanımlanması ve antimikrobiyal direnç profilleri
ALI HAMEED NEAMAH ALHUSSEINI
Yüksek Lisans
İngilizce
2024
MikrobiyolojiAfyon Kocatepe ÜniversitesiMoleküler Biyokimya ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MEHMET OĞUZ ÖZTÜRK
- İnvazif enfeksiyonlara neden olan genişlemiş spektrumlu beta-laktamaz (GSBL) oluşturan Enterobacteriaceae izolatlarının hızlı teşhisi için DNA aptamerlerinin geliştirilmesi
Development of DNA aptamers for rapid diagnosis of extensive spectrum beta-lactamase (ESBL) producing Enterobacteriaceae isolates which causes invasive infections
HATİCE NUR HALİPÇİ TOPSAKAL
Doktora
Türkçe
2018
BiyolojiKahramanmaraş Sütçü İmam ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ASHABİL AYGAN
PROF. DR. FATMA KÖKSAL ÇAKIRLAR
- Klinik Escherichia coli izolatlarında plazmit aracılı kinolon direnç genlerinin araştırılması
Investigation of plasmid-mediated quinolone resistance genes in clinical Escherichia coli isolates
AHMED MOHSIN SALEH AL-AZZAWI
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
BiyolojiKırşehir Ahi Evran ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. FATMA FİLİZ ARI
- Karbapeneme dirençli klebsiella pneumoniae suşlarında kolistin direncinin flow sitometri yöntemi ile araştırılması
Carbapenem resistant klebsiella pneumoniae strains' investigation of colistin resistance by flow cytometry
ŞAFAK CEREN UÇAK
Doktora
Türkçe
2023
Mikrobiyolojiİstanbul ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. BETİGÜL ÖNGEN
- İdrar kültürlerinden izole edilen GSBL oluşturan ve oluşturmayanEscherichia coli izolatlarında fosfomisin duyarlılığının otomatize sıvı mikrodilüsyon sistemi (Vitek-2), hızlı fosfomisin/E. Coli NP testi, disk difüzyon ve agar dilüsyon yöntemleri ile karşılaştırmalı olarak araştırılması
Comparative investigation of fosfomycin susceptibility in esbl-forming and non-esbl-forming escherichia coli isolates isolated from urine cultures by automated liquid microdilution system (Vitek-2), rapid fosfomycin/E.Coli NP test, disk diffusion and agar dilution methods
ELİF TUĞÇE GÜNER
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2023
MikrobiyolojiSağlık BakanlığıTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ÜMMÜ GÜL ERDEM