Geri Dön

Pseudomonas aeruginosa izolatlarında biyofilm üretimi ile antibiyotik dirençlilik ilişkisinin karşılaştırmalı değerlendirilmesi

The comparative evaluation of biofilm production and antibiotic resistance in pseudomonas aeruginosa isolates

PDF İndir

  1. Tez No: 617382
  2. Yazar: SERVET EKSELLİ
  3. Danışmanlar: PROF. DR. ALPER ÇİFTCİ
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Mikrobiyoloji, Veteriner Hekimliği, Microbiology, Veterinary Medicine
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2019
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Ondokuz Mayıs Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Mikrobiyoloji (Veterinerlik) Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 78

Özet

Amaç: Bu çalışmada çeşitli klinik örneklerden izole edilmiş olan 48 adet Pseudomonas aeruginosa izolatında biyofilm varlığının, antibiyotik dirençliliklerinin ve her 2 fenotipik determinantta rol oynayan ilişkili genlerin belirlenmesi ve aralarındaki ilişkinin karşılaştırmalı olarak değerlendirilmesi amaçlandı. Materyal ve metot: Çalışmada P.aeruginosa izolatlarının identifikasyonları PCR ile doğrulandı. İzolatların antibiyotik direnç durumu Kirby-Bauer Disk Difüzyon metodu ile 6 antibiyotik grubuna ait 8 antibiyotik için belirlendi. İzolatların biyofilm oluşturma durumları in vitro olarak Kongo Red Agar, Modifiye Tüp Aderans ve Mikroplak yöntemleri ile araştırıldı. Her üç yöntemle de biyofilm pozitif olduğu belirlenen izolatların filogenetik yakınlıklarının belirlenmesi amacıyla RADP-PCR gerçekleştirildi. İzolatlarda biyofilm üretiminden sorumlu olan PelA, quorum sensing genleri olan lasI, lasR, rhlI, rhlR ile biyofilme bağlı antibiyotik direncinden sorumlu olan PA0756, PA0757, PA2070 ve PA5033 gen varlıkları PCR ile araştırıldı. Bulgular: İzolatların enrofloksasine %16,67, seftriaksona %60,42, amoksisilin + klavulanik asite %100, siprofloksasine %10,42, meropeneme %29,17, kolistine %4,17, gentamisine %12,5 ve azitromisine karşı %97,9 oranında dirençli olduğu belirlendi. Biyofilm oluşturma durumları CRA metoduna göre 40(%83,33), Christensen Yöntemine göre 45(%93,75) ve Mikroplak Yöntemine göre 31(%64,58) olarak belirlendi. Tüm izolatların pelA, lasI, rhlI ve rhlR genlerine sahip olduğu görüldü. İzolatların %97,92'sinde ise lasR geni belirlendi. İzolatların 46(%95,83) tanesinin PA0756 ve PA0757, 45(%93,75) izolatın ise PA2070 ve PA5033 genlerine sahip olduğu belirlendi. Her üç yöntem ile biyofilm pozitiflik görülen izolatların filogenetik yakınlıkları %56-93 olarak belirlendi. Sonuç: Klinik izolatı P. aeruginosa suşlarında biyofilm üretiminin ve çoklu antibiyotik direncinin yüksek olduğu, genetik düzeyde incelenen genlerin tek başına biyofilm oluşumundan ve buna bağlı antibiyotik direncinden sorumlu olmadığı saptandı. Bu durum farklı ve daha fazla genetik ve fenotipik parametrenin biyofilme bağlı antibiyotik direncinden sorumlu olduğunu gösterdi. Bu durumun belirlenmesi ve biyofilme bağlı antibiyotik direnç mekanizmalarının aydınlatılması için daha geniş ve ileri düzeyde çalışmalar yapılma gerekliliğini gösterdi.

Özet (Çeviri)

Aim: In this tudy, it was aimed to investigate the biofilm occurrence, antibiotic resistance profiles, the genes which play roles for biofilm and antibiotic resistances of 48 P.aeruginosa isolates isolated from different clinical materials. Material and methods: The identification of the P.aeruginosa isolates were confirmed with PCR. The antibiotic resistances among 8 antibiotics from 6 antibiotic groups were dtermined by Kirby-Bauer Disc Diffusion method. The biofilm occurrences of the isolates were investigated in vitro with Congo Red Agar, Modified Tube Adherence and Micro plate Methods. The isolates which were found as positive with three methods were genotyped with RAPD-PCR. pelA which plays role in the biofilm formation, lasI, lasR, rhlI, rhlR genes which were quorum sensing genes and PA0756, PA0757, PA2070 and PA5033 genes which were responsible for the antibotic resistance depending on the biofilm were investigated with PCR. Results: The antibiotic resistance rates of the isolates among enrofloxacine, ceftriaxone, amoxicilline-clavulanique acid, ciprofloxacin, meropenem, colistin gentamycin and azithromycin were found as 16,67%, 60,42%, 100%, 10,42%, 29,17%, 4,17%, 12,5 % and %97,9, respectively. The biofilm formation ratios were determined as 40(83,33%) with CRA, 45(93,75%) with Christensen method and 31(64,58%) with micro plate method. pelA, lasI, rhlI and rhlR were carried by all the isolates. lasR gene was found in %97,92 of the isolates.46(%95,83) of the isolates carried PA0756 and PA0757. 45(%93,75) of the isolates were found as positive for PA2070 and PA5033 genes. The phylogenetic relations of the biofilm positive isolates were calculated as 56-93%. Conclusion: The biofilm formation and multiple antibiotic resistance rates were found as high in the clinical isolates of P. aeruginosa. The genotypic parameters for biofilm formation and related antibiotic resistances were thought as not responsable by oneself and the other different genotypic/phenotypic parameters should be determined for this situation. In conclusion, the widespread and advanced studies thought to be performed for the lightening of this situation and biofilm related antibiotic resistances.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    468819

    Hastanede yatan hastalardan izole edilen mikroorganizmaların biyofilm formasyon aktiviteleri

    Biofilm formation activities of isolated microorganisms from hospitalized patients

    ABDULHAMİT ÇALI

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2017

    MikrobiyolojiCumhuriyet Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. CEM ÇELİK

  2. Tez No

    495452

    Hastane kökenli Pseudomonas aeruginosa suşlarının virülans faktörlerinin quorum sensing yönünden değerlendirilmesi ve epitel hücrelerindeki etkileri

    Evaluation of virulence factors of hospital-acquired Pseudomonas aeruginosa strains for quorum sensing and their effects on epithel cells

    CEREN YAVUZ

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2018

    BiyolojiAnadolu Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. HÜLYA SİVAS

    DOÇ. DR. TUBA YILDIRIM

  3. Tez No

    779456

    Antibiotic resistance profiles of Pseudomonas aeruginosa isolates isolated from clinical samples, and evaluation of biofilm formation and the presence of biofilm-related genes (pelA, pslD and algD)

    Klinik örneklerden izole edilen Pseudomonas aeruginosa izolatlarında antibiyotik direnç profilleri, biyofilm oluşumu ve biyofilm ile ilişkili genlerin (pelA, pslD ve algD) varlığınındeğerlendirilmesi

    NOOR RIYADH HAMOODAH ALMZIL

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2022

    BiyolojiÇankırı Karatekin Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ YAŞAR KEMAL YAZGAN

    PROF. DR. MOHAMMED F. AL MARJANI

  4. Tez No

    818556

    Study the correlation between genes for virulence factors and quorum-sensing in Pseudomonas aeruginosa isolated from clinical sources in Iraq

    Irak'ta klinik kaynaklardan izole edilen Pseudomonas aerugınosa'da virülans faktörleri genleri ile quorum-sensıng arasındaki ilişkiyi incelemek

    AMENAH HASHIM FERMAN AL JANABI

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2023

    BiyolojiÇankırı Karatekin Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ OKAN ÜRKER

    DR. ÖĞR. ÜYESİ NUHA JOSEPH KANDALA

  5. Tez No

    887296

    Irak'ın Babylon kentindeki yanıklardan, yaralardan ve idrar yolu enfeksiyonu hastalarından izole edilen pseudomonas aeruginosa'nın moleküler tanımlanması ve virülans analizi

    Molecular identification and virulence analysis of pseudomonas aeruginosa isolated from burns, wounds and uti patients in Babylon, Iraq

    ZAINAB MOHAMMED NAJI AL-SHAMMARI

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2024

    BiyolojiÇankırı Karatekin Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. TARKAN YORULMAZ

Geri Dön