Antibiotic resistance profiles of Pseudomonas aeruginosa isolates isolated from clinical samples, and evaluation of biofilm formation and the presence of biofilm-related genes (pelA, pslD and algD)
Klinik örneklerden izole edilen Pseudomonas aeruginosa izolatlarında antibiyotik direnç profilleri, biyofilm oluşumu ve biyofilm ile ilişkili genlerin (pelA, pslD ve algD) varlığınındeğerlendirilmesi
- Tez No: 779456
- Danışmanlar: DR. ÖĞR. ÜYESİ YAŞAR KEMAL YAZGAN, PROF. DR. MOHAMMED F. AL MARJANI
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Biology
- Anahtar Kelimeler: Biyofilm oluşumu, Pseudomonas aeruginosa, pelA, Polisakkarit, Biyofilm formation, Pseudomonas aeruginosa, pelA, Polysacharide
- Yıl: 2022
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Çankırı Karatekin Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 118
Özet
Pseudomonas aeruginosa, bağışıklık sistemi zayıflamış kişilerde ağırlıklı olarak nozokomiyal enfeksiyonlar oluşturduğu için fırsatçı bir patojen olarak tanımlanır. P. aeruginosa patogenezi ile ilgili mevcut bilgiler öncelikle klinik izolatların çalışmasından elde edilmiştir. Mevcut çalışmada Bağdat hastanelerinin çeşitli yerlerinden elde edilen ve üç gruba ayrılan toplam 100 örnek vardı: yanıklardan klinik izolatlar (40), yaralardan örnekler (40) ve balgamdan (30). Bu örnekler Ekim 2021'den Nisan 2022'ye kadar toplandı: Bu örneklerden yirmi P. aeruginosa izolatı bulunmuş ve spesifik ve farklı ortamlarla kültürlenmiş, kültür koşulları, biyokimyasal analizler ve VİTEK-2 kompakt sistemi kullanılarak bakteriler tanımlanmıştır. Tüm bakteri izolatları için antibiyotik duyarlılık testi minimum inhibitör konsantrasyona (MICs) göre geçerlidir. Maksimum direnç seviyesinin Tigesikline (8) ve ardından Sefazolin (64) karşı olduğu gösterilmiştir. Yüksek duyarlılık ise Siprofloksasin (0.25), sonra sırasıyla Levofloksasin (0.5) ve Gentamisin (1), sefepim (1), Ceftazidime (2), İmipenem (2), Amikasin (2) ve Piperasilin/Tazobactum'da (8) izlenmiştir. Mikro titrasyon plakası tekniği kullanılarak biyofilm oluşumu tespit edildi, suşların çoğunluğu (%50) orta derecede biyofilmler üretti, %35'i güçlü biyofilmler üretti ve %15'i zayıf biyofilmler üretti. Virülans genleri anlamında 20 izolatta üç gen saptandı. 17 izolatta (%85) algD geni, 17 izolatta (%85) pelA ve 15 izolatta (%75) pslD saptandı. algD, pslD ve pelA genleri virülans faktörleri olarak seçildi, ki bu biyofilm gelişiminin fenotipik paterninden sorumlu olan genotipik algD / pslD / pelA paternidir. Çeşitli kaynaklardan biyofilm oluşturan izolatlar arasında genotipik örüntü baskınlığında istatistiksel olarak anlamlı farklılıklar vardı. Ki-kare analizi kullanılarak biyofilm oluşturma kabiliyeti ile genetik örüntü arasında çok anlamlı bir ilişki bulundu (p değeri 0.764). Bu çalışmada biyofilm üretimi ile biyofilm ile ilişkili genlerin (algD, pelA, pslD) ekspresyonu arasındaki ilişkiyi araştırdık ve izole edilen P. aeruginosa klinik örneklerinde antibiyotik direnç profillerinin analizini yaptık.
Özet (Çeviri)
Pseudomonas aeruginosa is identified as an opportunistic pathogen since it predominantly creates nosocomial infections in immune compromised people. The available knowledge about P. aeruginosa pathogenesis has primarily come from investigating clinical isolates; in this case there were a total of 100 samples obtained from a variety of locations in Baghdad hospitals and sorted into three groups: clinical (40) isolates from burns and (40) specimen from wounds and (30) from sputum, collected from October 2021 to the April 2022. Twenty isolates of P. aeruginosa were found of these samples and they cultured by specific and differential media, Using culture conditions, biochemical assays, and the VITEK-2 compact system, bacteria were identified. For all bacterial isolates, the antibiotic sensitivity test is valid according to the minimum inhibitory concentration (MICs). The maximum level of resistance was demonstrated to be against Tigecycline (8), followed by Cefazolin (64), while high sensitive was to Ciprofloxacin (0.25), followed by Levofloxacin (0.5) and Gentamicin (1), cefepime (1), Ceftazidime (2) and Imipenem (2), Amikacin (2) and Piperacillin /Tazobactum (8) respectively according to MICs results of each antibiotics. Biofilm production was detected using the micro titration plate technique, with the majority of strains (50%) producing moderate biofilms, 35% producing strong biofilms, and 15% producing weak biofilms. When it comes to virulence genes, In 20 isolates, three genes were identified, the algD gene was found in 17 isolates (85%), pelA was found in 17 isolates (85%), and pslD was found in 15 isolates (75%). The genes algD, pslD, and pelA were chosen as virulence factors, the genotypic algD/pslD/pelA – pattern, which is responsible for the phenotypic pattern of biofilm development. There were statistically significant variations in genotypic pattern predominance across biofilm forming isolates from various sources, Using Chi-square analysis, a very significant relationship between biofilm forming capability and genetic pattern (p value 0.764) was discovered. In this research we wanted to reveal if there was a linkage between the production of biofilms and the expression of biofilm-related genes (algD, pelA, pslD), and analyzing antibiotic resistance profiles in P. aeruginosa clinical samples isolated.
Benzer Tezler
- Pseudomonas aeruginosa izolatlarında biyofilm üretimi ile antibiyotik dirençlilik ilişkisinin karşılaştırmalı değerlendirilmesi
The comparative evaluation of biofilm production and antibiotic resistance in pseudomonas aeruginosa isolates
SERVET EKSELLİ
Yüksek Lisans
Türkçe
2019
MikrobiyolojiOndokuz Mayıs ÜniversitesiMikrobiyoloji (Veterinerlik) Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ALPER ÇİFTCİ
- Yanık ünitesinde infeksiyon etkenleri ve antibiyotik direnci
Başlık çevirisi yok
BÜLENT KAYA
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2010
Klinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon HastalıklarıSağlık BakanlığıEnfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
UZMAN ÖZNUR AK
- Antibiyotiğe dirençli pseudomonas aeruginosa'larda lizojenik ve litik bakteriyofaj varlığı ve PIP/TAZ antibiyotik ile sinerji etkinliğinin araştırılması
Detection of the lysogenic and lytic bacteriophage of antibiotic resistant pseudomonas aeruginosa and synergistic effect with PIP/TAZ antibiotic
NAWAL MAHMOOD ALI AL AAZI
Doktora
Türkçe
2024
MikrobiyolojiGaziantep ÜniversitesiMoleküler Biyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. İBRAHİM HALİL KILIÇ
PROF. DR. YASEMİN ZER
- Klinik pseudomonas aerugınosa izolatlarının antibiyotiklere duyarlılık durumu ve serotiplendirilmesi
Antibiotic susceptibilities and serotyping of clinical pseudomonas aeruginosa isolates
PINAR EKİNCİOĞLU
Yüksek Lisans
Türkçe
2012
MikrobiyolojiErciyes ÜniversitesiMikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. DUYGU PERÇİN
- Yoğun bakım hastalarından izole edilen çoklu ilaca dirençli pseudomonas aeruginosa izolatlarında amikasin, tigesiklin ve meropenemin seftolozan/tazobaktam ile kombinasyonlarının in vitro etkinliğinin araştırılması
Investigation of in vitro efficacy of combinations of amikacin, tigecycline and meropenem with ceftolozane/tazobactam in multidrug-resistant pseudomonas aeruginosa strains isolated from intensive care patients
ESRA YARTAŞI
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2023
MikrobiyolojiSağlık Bilimleri ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. BEDİA DİNÇ