Farklı türlere ait adenovirus hexon gen bölgesinin karşılaştırmalı analizi
Comparative analysis of adenovirus hexon gen region of different species
- Tez No: 618042
- Danışmanlar: PROF. DR. TUBA ÇİĞDEM OĞUZOĞLU
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Veteriner Hekimliği, Veterinary Medicine
- Anahtar Kelimeler: Adenovirüs enfeksiyonları, Adenovirüsler, Moleküler analiz, Moleküler yapı, Adenoviridae infections, Adenoviridae, Moleküler analysis, Molecular structure
- Yıl: 2019
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Ankara Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Viroloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
AdV'lar, insanlarda ve hayvanlarda enfeksiyonlara neden olabilmektedir. Adenoviridae ailesinde bulunan ve tez çalışmamızda moleküler analizi yapılan insan, sığır ve koyun AdV'ları Mastadenovirus genusunda yer almaktadır. Doku tropizmi ve neden oldukları enfeksiyonların ciddiyeti, etkilenen sistem, klinik bulgular, epidemi / endemi yapma karakteristikleri; alt gruplar ve genotipler arasında farklılık göstermektedir. Ülkemizde solunum sistemi enfeksiyonuna neden olan AdV'ların hexon geni moleküler analizi ile, sirküle olan suşların genotipik dağılımının tespitinin hedeflendiği bu tez çalışmasında; 30 pozitif AdV örneğinin (23 insan, 4 koyun ve 3 sığır) hexon geni yönünden parsiyel sekans analizi yapıldı. Ayrıca 4 HAdV-B genotipinin tam hexon geni analizi yapıldı. Tez bulguları olarak; insanlarda solunum sistemi örneklerinde en sık HAdV- B ve HAdV- C saptanmıştır. En sık genotip, HAdV-B 3 olup, örneklerden dördünde HAdV- C 2/6 rekombinasyonunun saptanması ve 2 solunum sistemi örneğinde gastrointestinal sisteme tropizm gösteren HADV-F 41 genotipi saptanması dikkat çekicidir. Ayrıca, son yıllarda Asya'da yeniden ortaya çıkan ve ciddi enfeksiyonlara neden olan patojenler olarak bildirilen ve ülkemizde daha önce bildirilmeyen HAdV - B7 genotipi, 1 olguda saptanmış olup bu bulgu önem arz etmektedir. Hexon geni parsiyel analizinde; ovine orijinli örneklerde OAdV-1, OAdV-2, OAdV-3 ve OAdV-5, bovine orijinli örneklerde de BAdV-1, BAdV-2 ve BAdV-3 moleküler olarak karakterize edilmiş olup bu etkenlerin de tür spesifik olduğu saptanmıştır. Çalışmamızda, insan ve hayvan sağlığı açısından önemli verilere ulaşılmış olup, bu bilgiler Ülkemizde kısıtlı olan AdV moleküler epidemiyolojisine katkı sağlayacaktır.
Özet (Çeviri)
AdVs can cause infections in humans and animals. Human, Bovine and Ovine AdV's molecular analysis of which are investigated in our thesis study, are located in the genus Mastadenovirus of Adenoviridae family. Tissue tropism and the severity of infections caused, the affected system, clinical findings, epidemic / endemic characteristics varies due to subgroups and genotypes. In this thesis study, it was aimed to determine the genotypic distribution of circulating strains by hexon gene molecular analysis of AdVs causing respiratory system infection in our country; Partial sequence analysis of hexon gene of 30 positive AdV samples (23 human, 4 sheep and 3 cattle) was performed. In addition, full hexon gene analysis of 4 HAdV-B genotypes was performed. As the findings of thesis; HAdV-B and HAdV-C were the most common pathogens in respiratory system samples of humans. The most common genotype was HAdV-B 3, and it is noteworthy that HAdV-C 2/6 recombination was detected in four samples and HADV-F 41 genotype showing tropism in the gastrointestinal tract in two respiratory system samples. In addition, HAdV-B7 genotype, which has been reported as pathogens that re-emerged in Asia in recent years and causes serious infections, was found in one case, has not been reported in our country before, and this finding is also important. OAdV-1, OAdV-2, OAdV-3 and OAdV-5 in ovine-derived samples, BAdV- 1, BAdV-2 and BAdV-3 in bovine-derived samples were found to be species-specific with the moleculer characterisation of hexon gene partial analysis. In our thesis study, important data for human and animal health have been obtained and this information will contribute to the limited preexisting epidemiology of AdVs in our country.
Benzer Tezler
- Exploring NFIB phosphorylation motifs and signaling pathways upstream of NFI phosphorylation in glioblastoma cell lines
Glioblastoma hücre hatlarında NFIB fosforilasyon motiflerinin ve NFI fosforilasyonundan yukarı yöndeki sinyal yollarının araştırılması
ELİF DİLEK
Yüksek Lisans
İngilizce
2025
Biyolojiİstanbul Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı (disiplinlerarası)
DOÇ. DR. ASLI KUMBASAR
- Çiğ sığır eti karışımlarında farklı türlere ait etlerin fourier dönüşümlü kızıl ötesi (FT-IR) spektroskopisi ile belirlenmesi
Species identification of raw beef mixtures with fourier transform infrared spectroscopy (FT-IR)
EBRU DENİZ
Doktora
Türkçe
2018
Gıda MühendisliğiAnkara ÜniversitesiGıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. KEZBAN CANDOĞAN
- Peynir yapımında kullanılan sütün orijininin belirlenmesi ve farklı türlere ait sütlerden yapılan peynirlerin çeşitli özellikleri
Determination of cheese milk origin and some properties of the cheeses made with milks from different milk animals
FATMA TEMELLİ
Yüksek Lisans
Türkçe
2005
Gıda MühendisliğiYüzüncü Yıl ÜniversitesiGıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. YUSUF TUNÇTÜRK
- Farklı oranlarda esmer şeker ve demineralize peyniraltı suyu kullanılarak fermente edilen su kefiri içeceğinde değişik türlere ait üzüm suyu ve kuru üzüm kullanımının etkisi
The effect of using different types of grape juice and raisins in water kefir beverage fermented by using different quantity of brown sugar and demineralized whey
HAVVA ŞAFAK
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
Gıda MühendisliğiBurdur Mehmet Akif Ersoy ÜniversitesiHayvansal Ürünler Hijyen ve Teknolojisi Ana Bilim Dalı (disiplinlerarası)
DR. ÖĞR. ÜYESİ İLHAN GÜN
- Farklı korunga (Onobrychis Mill.) türlerine ait aksesyonların flow sitometri ve DNA markör (SSR) yöntemleriyle karakterizasyonu
Characterization of accessions of some Onobrychis species by flow cytometer and DNA markers (SSR)
ELBİ CANSU YILMAZ
Yüksek Lisans
Türkçe
2020
ZiraatTekirdağ Namık Kemal ÜniversitesiTarla Bitkileri Ana Bilim Dalı
PROF. DR. METİN TUNA