Geri Dön

Mass spectrometry-based proteome analysis of Leishmania Major parasite in two clinical isolates which exhibit different impact on virulence

Leishmania Major parazitinin farklı virülens etki gösteren iki klinik vakada kütle spektrometresine dayalı proteomik analizi

PDF İndir

  1. Tez No: 622453
  2. Yazar: NAZLI GÜVENÇ
  3. Danışmanlar: PROF. DR. TALAT YALÇIN
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Kimya, Chemistry
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2018
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: İzmir Yüksek Teknoloji Enstitüsü
  10. Enstitü: Mühendislik ve Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Kimya Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 87

Özet

Leşmanyöz, leşmanya parazitinin sebep olduğu ve genelde üç farklı klinik formda bulunan bulaşıcı bir hastalıktır. L. major paraziti ise kütanöz leşmanyöz türlerinden olmakla birlikte genelde, Irak ve Suriye gibi bölgelere yayılmıştır. Fakat, ülkemizin jeolojik konumundan dolayı, L. major parazitine bağlı deride oluşan leşmanyöz vakaları ülkemizde de saptanmaya başlamıştır. Vakaların genelinde farklı bölgelerde ve farklı şiddette görülen lezyonlar, parazitin virulans etkisinin farklılık gösterebildiğinin kanıtı olmuştur. Kütle spektrometresine dayalı büyük ölçekli protein incelemeleri, günümüzde birçok proteom analizinde kullanılmaya başlanmıştır. Genelde, jele dayalı ve jelden bağımsız (LC-MS/MS) gibi iki temel prensip dünyaca kabul görmüştür. Bu çalışmada, leşmanyöz üzerinde pasif ve agresif virülans etki gösteren iki klinik vakada L. major parazitinin proteome analizini karakterize etmek için jel içermeyen LC-MS / MS analizi uygulanmıştır. Sonuçta, agresif ve pasif etki gösteren L. major parazitinin proteome analizinden elde edilen birbirinden farklı ve ortaklık gösteren proteinler, L. major'un virülans etkisinin kaynağının hangi proteinlerden kaynaklandığını görmek için ele alınmıştır. Sonuç olarak, literatürde bulunmuş L. major virülansına etki eden GP63, salgılanan asit proteazları, sistein proteazları ve peroksiredoksin proteinleri bu çalışmada da bulunmuştur. Bunun dışında, sadece agresif örnekde gözlenen, sistatiyonin beta-sentaz proteini, sistein sentezinde kullanılması ve ayrıca piridoksal fosfat bağlanması aktivitesinden ötürü L. major'ün virülans etkisinde rol oynayacağı öne sürülmüştür.

Özet (Çeviri)

Leishmaniasis is a disease that covered under the title of neglected tropical diseases caused by protozoan parasites called Leishmania which can classify into three groups as visceral, cutaneous and mucocutaneous leishmaniasis. L. major is a type of parasite that causes cutaneous leishmaniasis and it is endemic in Iran, and Syria. However, cutaneous type leishmaniasis caused by L. major has been begun to detect in Turkey due to its close location to such countries. Moreover, the variety in the infectivity of L. major in a different region of Turkey has detected. Therefore, the uncertainty under the virulence effect of L. major is aimed to investigate. Large-scale protein analysis by mass spectrometry-based proteomics has cleared up to proteome mapping for different organism recently. Generally, although two methodologies that involve gel-free and gel-based approaches have widely accepted for proteomic analysis, gel-free LC-MS/MS analysis were applied to characterize the proteome analysis of L. major parasite in two clinical case exhibiting passive and aggressive virulence effect on leishmaniasis. Finally, differential and common proteins that can affect the infectivity of L. major invastigated by shotgun analysis. As a result, samples showed that there are conflict results with the literature about GP63, secreted acid proteases, cysteine proteases and Peroxiredoxin proteins existence and also in the aggressive L. major cystathionine beta-synthase protein which has an role to synthesis of CPs and pyridoxal phosphate binding activity were proposed as a critical protein for L. major infectivity due to its association with SAPs, CPs.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    662696

    Discovery of novel enzymes using proteomic approaches

    Proteomik yaklaşımlar kullanılarak yeni enzimlerin keşfi

    MERVE ÖZTUĞ KILINÇ

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2021

    Biyokimyaİstanbul Teknik Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. NEVİN GÜL KARAGÜLER

    DOÇ. DR. MÜSLÜM AKGÖZ

  2. Tez No

    276015

    Proteomic study and flux analysis of metabolic pathways of halophilic microorganisms

    Halofilik mikroorganizmaların metabolik yollarının proteomik çalışması ve akı analizi

    SELİM CEYLAN

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2010

    Kimya MühendisliğiMarmara Üniversitesi

    Kimya Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. DİLEK KAZAN

    YRD. DOÇ. BERNA S. AKBULUT

  3. Tez No

    421256

    Proteome analysis of Brachypodium distachyon leaves under drought stress

    Kuraklık stresi altında Brachypodium distachyon yapraklarının proteom analizi

    ÖZGE TATLI

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2015

    Biyolojiİstanbul Teknik Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. GİZEM DİNLER DOĞANAY

  4. Tez No

    520357

    Analysis of cell surface reorganization during cell division

    Hücre bölünmesi sırasında hücre yüzey düzenlenmesinin analizi

    NAZLI EZGİ ÖZKAN KÜÇÜK

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2018

    BiyolojiKoç Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    DOÇ. NURHAN ÖZLÜ

  5. Tez No

    629695

    Search for the novel protein markers that may allow early diagnosis of breast cancer by using comparative serological proteome analysis of breast cancer tissues

    Meme kanser dokularında karşılaştırmalı serolojik proteom analizi yaparak meme kanserinin erken tanısında kullanılabilecek potansiyel biyomarker moleküllerin araştırılması

    KÜBRA KARAOSMANOĞLU YÖNETEN

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2020

    Tıbbi BiyolojiKocaeli Üniversitesi

    Biyomedikal Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MURAT KASAP

Geri Dön