CRISPR-Cas9 sistemi kullanılarak erkek kısır tütün (Nicotiana tabaccum) bitkilerinin geliştirilmesi
CRISPR-Cas9 mediated male sterility of Tobacco (Nicotiana tabaccum) by silencing acos gene
- Tez No: 634353
- Danışmanlar: DOÇ. DR. MUSA KAVAS
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoteknoloji, Biotechnology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2020
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Ondokuz Mayıs Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Tarımsal Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Bitkisel Biyoteknoloji Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: 46
Özet
Gen düzenleme teknolojileri ile erkek kısırlık genlerini hedef alarak işlevsiz allel varyantlarını elde etmek mümkündür. Geleneksel ıslahın aksine, CRISPR / Cas9 sistemi yoluyla erkek kısır hatların geliştirilmesi verimli ve kullanışlı olup daha az zaman gerektirir. CRISPR tabanlı genom düzenleme teknolojileri için en önemli faktörlerden biri uygun rehber RNA'ların (gRNA) tasarlanması ve seçimidir. Bu çalışmada ACOS geni, erkek kısır bitkiler elde etmek için tütün genomunda hedeflemiştir. Potansiyel gRNA'lar Benchling yazılımı ile tasarlanmıştır. Hedef dışı potansiyeli daha düşük olan yüksek özgüllük skoruna sahip potansiyel gRNA' lardan ikisi, bitki ekspresyon vektörüne (pKI1.1R) klonlanmıştır. Tütün bitkilerine hazırlanan vektörün aktarımı, Agrobacterium tumefaciens (AGL1) kullanılarak gerçekleştirilmiştir. sgRNA1 ve sgRNA2 için sırasıyla toplam 12 ve 13 adet olmak üzere T0 tütün hattı elde edilmiştir. Hedeflenen genom bölgesi için spesifik primerler kullanılarak çoğaltılan PCR ürünü, sanger sekanslama ile dizilenmiştir.
Özet (Çeviri)
By introduction of gene editing technologies, targeting the male sterility genes is now possible to obtain dysfunctional allele variants. In contrast to conventional breeding, development of male sterile lines through CRISPR/Cas9 system is efficient, convenient and requires less time. Designing and selection of appropriate guide RNAs (gRNAs) are one of the most important factors for CRISPR-mediated genome editing technologies. In present study, ACOS gene was targeted in tobacco genome to obtain male sterile plants. Potential gRNAs were designed through Benchling software. Two of the potential gRNAs having high specificity score with less off-target potential was cloned into plant expression vector (pKI1.1R). Generation of genome edited tobacco plants was achieved by using Agrobacterium tumefaciens AGL1. A total of 12 and 13 T0 genome edited putative tobacco lines were obtained for sgRNA1 and sgRNA2, respectively. To evaluate genome editing rates, PCR product amplified by using spesific primers for targeted genome region was sequenced with Sanger sequencing.
Benzer Tezler
- Generation and validation of genome editing tools for mouse CatSper β & Ɣ using CRISPR/Cas9 and split-EGFP systems
Fare CatSper β & Ɣ genlerinin CRISPR/Cas9 ve ayrık-EGFP sistemleri için genom değiştirme araçlarının oluşturulması ve doğrulanması
YUSUF İŞERİ
Yüksek Lisans
İngilizce
2016
Genetikİstanbul Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. NEVİN GÜL-KARAGÜLER
YRD. DOÇ. DR. JEAN-JU L.CHUNG
- CRISPR/CAS9 sistemi kullanılarak domates (Solanum lycopercium) bitkisinde CCDC124 geninin susturulması
Utilizing the CRISPR/CAS9 system to silence the CCDC124 gene in tomato (Solanum lycopercium)
HİLAL CİVELEK
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
BiyoteknolojiGebze Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. UYGAR HALİS TAZEBAY
PROF. DR. YELDA ÖZDEN ÇİFTÇİ
- Artificial intelligence assisted drop pattern analysis and RNAseq profiling for early diagnosis and follow-up of bladder cancer
Mesane kanserinin erken tanı ve takibinde yapay zeka destekli damla motif analizi ve RNAseq profilleme
RAMİZ DEMİR
Doktora
İngilizce
2023
Moleküler TıpKoç ÜniversitesiHücresel ve Moleküler Tıp Ana Bilim Dalı
PROF. DR. DEVRİM GÖZÜAÇIK
- Improvement of Bacilysin biosynthesis in Bacillus subtilisPY79 VIA CRISPR/CAS9 technology
Bacillus subtilis PY79 suşunda basilisin biyosentezinin CRISPR/CAS9 teknolojisi ile iyileştirilmesi
HADEEL WALEED ABDULMALEK
Doktora
İngilizce
2023
Biyoteknolojiİstanbul Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. AYTEN KARATAŞ
- KCNQ1 geni CRISPR/CAS9 sistemi ile düzenlenmiş insan uyarılmış pluripotent kök hücre kaynaklı kardiyomiyositlerin karakterizasyonu
Characterization of crispr/CAS9 edited kcnq1 gene variants in human induced pluripotent stem cell-derived cardiomyocytes
TUĞCE TORUN
Yüksek Lisans
Türkçe
2019
Genetikİstanbul Medipol ÜniversitesiTıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ESRA ÇAĞAVİ