Spinal müsküler atrofi fenotipinde modifiye edici genlerin etkilerinin araştırılması
Effects of modifying genes in the spinal muscular atrophy phenotype investigation
- Tez No: 638970
- Danışmanlar: DOÇ. DR. HAKAN GÜRKAN
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Genetik, Genetics
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2020
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Trakya Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoteknoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 93
Özet
Spinal Müsküler Atrofi (SMA) otozomal resesif kalıtım özelliği gösteren, kas güçsüzlüğü ve atrofi ile birlikte erken ölümlere yol açan, 1/5000-1/10000 doğum oranına sahip nörömusküler bir hastalıktır. SMA'nin kromozom 5q11.2-5q13.3'de haritalanmış olan SMN1 (Survival Motor Nöron 1) geni ile ilişkili olduğu rapor edilmiştir. SMA hastalarının % 95-98'inde SMN1 geninde delesyon/duplikasyon, % 2-5'inde dizi analizi ile patojenik varyasyon saptanabilir. Literatürde SMN2 geni ekzon 7/8 kopya sayısı artışının SMA'de klinik şiddeti azalttığı bildirilmiş olup, bu durum modifiye edici etki olarak tanımlanlanmıştır. Çalışmamızda, SMA hastalığında modifiye edici etkisi olduğu düşünülen Plastin 3 (PLS3), Profilin II (PFN2), Zinc Finger (ZPR1), Coronin 1C (CORO1C), General Transcription Factor 2H-Polypeptide 2 (GTF2H2), Neuritin 1 (NRN1), Small Edrk-Rich factor 1A (SERF1A-H4F5), Neurocalcin delta (NCALD), Neuronal Apoptosis İnhibitory protein (NAIP), Cytotoxic Granule-Associated RNA-binding protein (TIA1) genlerinin ifade düzeylerinin ile SMA prognozu arasındaki ilişkinin araştırılması amaçlanmıştır. Çalışmamıza, Trakya Üniversitesi Hastanesi, Tıbbı Genetik Anabilim Dalı, Genetik Hastalıklar Tanı Merkezine SMA klinik ön tanısı ile gelerek, yapılan moleküler genetik test (MLPA) sonucunda SMA tanısı alan 17 hasta ile kendisinde ve ailesinde nöromuskuler hastalık öyküsü olmayan 8 sağlıklı kontrol dahil edildi. Hasta grubu, SMA tip I klinik tanılı 6, SMA tip II klinik tanılı 8 ve SMA tip III klinik tanılı 3 hastadan oluşmaktaydı. İstatistiksel analizler Trakya Üniversitesi Tıp Fakültesi Biyoistatistik ve Tıbbi Bilişim Anabilim Dalında SPSS 20.0 (Lisans No: 10240642) paket programı kullanılarak yapıldı. p
Özet (Çeviri)
Spinal Muscular Atrophy (SMA) is an autosomal recessive neuromuscular disorder caused by the degeneration of motor neurons, muscle weakness, atrophy, and frequently leads to infant's death. It is a disease with 1/5000-1/10000 birth rate. Gene for this disorder has been identified as the SMN (Survival Motor Neuron) and it is located in 5q11.2-5q13.3 regions. 95-98% of SMA patients have deletion/duplication of the SMN1 gene, whereas pathogenic variation can be detected by sequencing in 2-5%. Published researches inform that the duplication of exon 7/ 8 in the SMN2 gene, reduces clinical severity of disease and it is defined as modifying effect. In this thesis we aimed to investigate the expression of modifying genes related with prognosis of SMA like, Plastin 3 (Pls3), Profilin II (PFN2), Zinc Finger (ZPR1), Coronin 1C (CORO1C), General Transcription Factor 2H-Polypeptide 2 (GTF2H2), Neuritin 1 (NRN1), Small Edrk-Rich factor 1A (SERF1A-H4F5), Neurocalcin delta (NCALD), Neuronal Apoptosis İnhibitory protein (NAIP), Cytotoxic Granule-Associated RNA-binding protein (TIA1). Seventeen patients who came to Trakya University, Faculty of Medicine, Medical Genetics department with preliminary diagnosis of SMA disease, and 8 healthy controls were included in this thesis. We have 6 patients diagnosed with SMA type I, 8 with SMA type II and 3 of them with SMA type III. Statistical analysis done by T.U. Biostatistics and Medical informatics department using SPSS 20.0 (License No: 10240642). p
Benzer Tezler
- Spinal müsküler atrofi patogenezinde rol alan genetik düzenleyicilerin ifade analizi
The expression analysis of modifier genes in pathogenesis of spinal muscular atrophy
İNCİ HANDE YENER
Yüksek Lisans
Türkçe
2013
Tıbbi BiyolojiHacettepe ÜniversitesiTıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. DİDEM DAYANGAÇ ERDEN
- Investigation of motor neuron diseases by wes: genetic dissection of a Turkish ALS cohort
Tüm ekzom dizileme ile motor nöron hastalıklarının analizi: Türk ALS kohortunun genetik incelenmesi
FULYA AKÇİMEN
Yüksek Lisans
İngilizce
2017
GenetikBoğaziçi ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ESRA BATTALOĞLU
PROF. DR. AYŞE NAZLI BAŞAK
- Spinal musküler atrofide (SMA) bazı genlerin, tek nükleotid polimorfizmlerinin (SNP) in silico olarak araştırılması
In silico investigation of single nucleotide polymorphisms (SNPs)of some genes in spinal muscular atrophy
HALİL İBRAHİM KORKULMUŞ
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
GenetikÜsküdar ÜniversitesiMoleküler Biyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MUHSİN KONUK
DR. ÖĞR. ÜYESİ TUĞBA KAMAN
- Spinal müsküler atrofili erişkin hastalarda tedavi öncesi ve tedavi periyodunda serum ve beyin omurilik sıvısı (BOS)'nda interlökin düzeyi ve hammersmith fonksiyonel test sonuçlarının karşılaştırılması
Comparison of interleukin levels and hammersmith functional test results in serum and cerebrospinal fluid (CSF) before and during treatment in adult patients with spinal muscular atrophy
HÜRÜ RABİA GÜLEÇ
Yüksek Lisans
Türkçe
2021
BiyoteknolojiÇukurova ÜniversitesiBiyoteknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. AYŞE FİLİZ KOÇ
- Spinal müsküler atrofi'li drosophila melanogaster modelinde RDP3 proteini ve histon asetilasyon düzeylerinin araştırılması
Investigation of RPD3 protein and histone acetylation levels in drosophila melanogaster model of spinal muscular atrophy
CEM HAZIR
Yüksek Lisans
Türkçe
2021
Tıbbi BiyolojiHacettepe ÜniversitesiTıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. HAYAT YURTER