Mitochondrial and nuclear dna phylogeographies for two botryllid ascidian species from the north-eastern mediterranean sea
Kuzey-doğu Akdeniz'den iki botryllid asidiyan türünün mitokondriyel ve nükleer dna filocoğrafyasi
- Tez No: 647830
- Danışmanlar: DOÇ. DR. ARZU KARAHAN
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Deniz Bilimleri, Biyoloji, Marine Science, Biology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2020
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Orta Doğu Teknik Üniversitesi
- Enstitü: Deniz Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Deniz Biyolojisi ve Balıkçılık Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Tüm dünya denizlerinde yaklaşık 3000 kadar türü bulunan asidiyanlar tulumlular içindeki en büyük gruptur. Botrylloides, dünyada yayılım gösteren botryllid tulumluları grubuna ait cinstir. Doğu Akdeniz'de total 6 Botryllid türü tespit edilmiştir. Fakat Türkiye'nin Akdeniz kıyılarındaki asidiyan dağılımları ve filocoğrafyası ile ilgili herhangi bir çalışma yapılmamıştır. Bu çalışma kapsamında, 2012 ve 2019 yılları arasında örnekler Hatay (Konacık), Mersin (Mezitli, Kızkalesi, Tisan) va Antalya (Alanya)'dan yaklaşık 550 km uzunluğu kapsayan kıyısal bölgeden toplanmıştır. Toplanan 62 örneğin COI bölgesi %100 başarı ile çoğaltılabilmiş fakat diğer belirteçler için amplifikasyon başarı oranı örnekleme istasyonlarına göre sıfır ile %100 arasında değişmiştir. Mitokondriyal (COI, CytB) ve nükleer (18s, H3) gen bölgeleri çoğaltılmıştır. Haplotipler/lokasyonlar için tür içi ve türler arası uzaklıklar hesaplanarak, median-joining network analizleri yapılmış ve filogenetik ağaçlar oluşturulmuştur. Neutrality test ve mismatch dağılım analizi herhangi bir demografik değişikliği belirlemek amacıyla yapılmıştır. Botrylloides ancep, Botrylloides sp. ve Botrylloides israeliense türleri ilk defa Levanten Denizi'nde Türkiye kıyılarında kayıt edilmiştir. Filocoğrafik analiz Tisan'dan tek bir örnekleme yapılan B. israeliense'nin tersine Konacık, Mezitli, Kızkalesi ve Alanya istasyonlarından birden fazlaörnekleme yapılabildiği için B. anceps ve Botrylloides sp. türleri için yapılabilmiştir. COI ve CytB gen bölgeleri B. anceps için, 18S gen bölgesi de Botrylloides sp. için varyasyon göstermemiştir. H3 geni B. anceps türü için varyasyon göstermişse de neutrality test ve Raggedness indeks istatistiki olarak önemli değerler vermemiştir. B. anceps türünün genetik varyasyonunun az olmasından dolayı istila edebilme kapasitesi düşük bulunmuştur ve bu durum bölgeye antropojenik yollarla tek girişin olması ve koloni yaşıyla ilişkilendirilmiştir. Botrylloides sp. türü için kullanılan iki mitokondriyal bölgede de varyasyon gözlenmiştir fakat P-değeri önemli olacak kadar değildir. Dolayısıyla, hem B. anceps hem de Botrylloides sp. türü için populasyonda büyüme gözlenmemiştir. Fakat Kızkalesi ve Mezitli'den toplanan Botryllodies sp. örnekleri arasında larvanın kısıtlı yayılım kapasitesinin sonucu olan güçlü genetik farklılaşma (FST=0.556COI, 0.361CytB) iki mitokondriyal bölge için de gözlenmiştir. B. israeliense ve Botrylloides sp. arasında farklı genotiplerde birden fazla koloni içeren kimerik oluşum gözlenmiştir. Çalışma ile türlerin blastogenik döngüleri, haftalık eşeysiz üreme, ilk kez tanımlanmıştır. Bu çalışmada, Türkiye'nin Akdeniz kıyılarında üç asidiyan türünün dağılımı verilmiştir ve populasyonlar filocoğrafik olarak karşılaştırılmıştır. Populasyonların sabit büyüklükte olduğu gözlemlenmiş ve belirteçlerin birlikte kullanılması gerektiği vurgulanmıştır.
Özet (Çeviri)
With approximately 3000 species, ascidians are the largest tunicate group in the world seas. Botrylloides belongs to the genera of the worldwide spread Botryllid ascidians. In the Eastern Mediterranean coasts, a total of six Botryllid ascidians have been observed up to date. However, there is no study considering the distribution and phylogeographic analysis of ascidian species along the Mediterranean Sea's Turkish coasts. Within this study's scope, specimens were collected from the coastal area of Hatay (Konacık), Mersin (Mezitli, Kızkalesi, Tisan) and Antalya (Alanya) regions comprising approximately 550 km of coastline between 2012 and 2019. Mitochondrial (COI, CytB) and nuclear (18s, H3) gene regions were amplified for the analysis. For COI, 100% amplification success was obtained for 62 samples; however, the success rate varied from zero to 100% for the other markers according to sampling location. The intra- and inter-specific distances were calculated between the haplotypes/locations. The Median-joining network analysis of haplotypes was done, and the phylogenetic trees were constructed for the samples. Neutrality tests and mismatch distribution analyses were applied to detect any demographic change. B. anceps, Botrylloides sp. and Botrylloides israeliense were recorded on the Turkish coasts of Levantine Sea for the first time. The phylogeographic analysis was done only for B. anceps and Botrylloides sp., which could be sampled at Konacık, Mezitli, Kızkalesi, and Alanya sampling stations, in contrast to B. israeliense, for which only one specimen could be encountered in Tisan during sampling. No genetic variation was detected for the COI and CytB regions of B. anceps and the 18S gene regions of Botrylloides israeliense. H3 gene showed low variation for B. anceps, thus resulted in an insignificant neutrality test and Raggedness statistics. Therefore, B. anceps was found to have low invasive capacity due to low genetic variation related to a single introduction event that happened via anthropogenic ways and colony age. For Botrylloides sp., both mitochondrial markers have shown variations; however, not enough for a significant P-value. Thus, population size change or population expansion could not be detected for B. anceps and Botrylloides sp. species. On the other hand, Mezitli and Kızkalesi samples of Botrylloides sp. have shown strong genetic differentiation; FST=0.556COI and 0.361CytB, is an outcome of the limited dispersal capacity of the larva. A chimera formation, a single colony, consisting of at least two colonies with distinct genotypes, recorded between B. israeliense and Botrylloides sp. The blastogenesis, weekly asexual reproduction, of the species was monitored for the first time in this study. In this study, the distribution of three ascidian species on Turkey's Mediterranean coasts was revealed, and their populations were compared for phylogeographic analysis. Populations were found to be in a constant size, and the need for the use of combined markers was emphasized.
Benzer Tezler
- Phylogeographic resolution of botrylloides affinis leachii (savigny, 1816) from the North-Eastern Mediterranean Sea
Kuzey-Doğu Akdeniz'den botrylloides affinis leachii'nin filocoğrafik çözümlenmesi
BERİVAN TEMİZ
Yüksek Lisans
İngilizce
2019
Orta Doğu Teknik ÜniversitesiDeniz Biyolojisi ve Balıkçılık Ana Bilim Dalı
Yükleniyor...
- The phylogeographic history, taxonomy and conservation of two cave-dwelling bat species: Miniopterus schreibersii and Myotis capaccinii (Chiroptera: Vespertilionidae)
Mağarada yaşayan iki yarasa türünün, Miniopterus schreibersii ve Myotis capaccinii (Chiroptera: Vespertilionidae) filocoğrafi tarihi, taksonomisi ve korunması
KANAT GÜRÜN
- Molecular evolution and phylogeography of the Eastern Mediterranean water frog (Pelophylax) complex
Doğu Akdeniz su kurbağaları (Pelophylax) kompleksinin moleküler evrimi ve filocoğrafyası
ÇİĞDEM AKIN PEKŞEN
- Türkiye kayalık sansarı Martes foina'nın filogenisi ve genetik yapısı
Phylogeny and genetic structure of the stone marten Martes foina in Turkey
YAĞMUR ASLAN
- Ege ve İç Anadolu (Türkiye) bölgelerinde dağılış gösteren Emys ve Mauremys cinslerinin genetik karşılaştırılması
Genetic comparison of genus emys and mauremys distributed in Aegean and Central Anatolia (Turkey)
MUHAMMED SÜLEYMAN İLHAN
