Analysis of differentially expressed genes in bipolar disorder: Transcriptomic signature of adolescence and young adulthood in working memory-relared area
Bipolar bozuklukta farklı eksprese genlerin analizi: Çalışma belleği ile ilgili bölgelerde ergenlik ve genç erişkinliğin transkriptom imzası
- Tez No: 654706
- Danışmanlar: PROF. DR. TIMOTHEA TOULOPOULOU
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Psikiyatri, Genetik, Psychiatry, Genetics
- Anahtar Kelimeler: Bellek, Beyin, Bipolar bozukluk, Ergenler, Gen ifadesi, Genç yetişkinler, Transkriptomlar, Çalışma belleği, Memory, Brain, Bipolar disorder, Adolescents, Gene expression, Young adult, Transcriptomics, Working memory
- Yıl: 2020
- Dil: İngilizce
- Üniversite: İhsan Doğramacı Bilkent Üniversitesi
- Enstitü: Mühendislik ve Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Nörobilim Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Bipolar bozukluk (BB) kalıtsal, ciddi bir hastalıktır. BB'nin belirtilerinden biri, bilişsel ve kalıtımsal bir işlev olan çalışma belleği (ÇB) bozukluğudur. Bu çalışmanın amacı transkriptomik düzeyde BB'nin ve ÇB ilişkili beyin bölgelerindeki gelişimsel biyobelirteçleri belirlemektir. Analizimizi hem bilişsel gelişim hem de BB için kritik bir dönem olan ergenlik ve genç yetişkinlik dönemine göre kurduk. Gene Omnibus veritabanından, bir sağlıklı, üç bipolar olmak üzere dört halka açık verisetini seçtik. BB ve sağlıklı beyin gelişimi arasındaki farklılıkları göstermek için, öncelikle sağlıklı örnekleri karşılaştırdık, daha sonra aynı adımları bipolar örnekleri için ayrıca uyguladık. Bu karşılaştırmaları gen düzeyinde analiz ve geneset düzeiynde analiz olarak iki adımda izledik. Bir sonraki aşamada, farklı analizlerden gelen ortak gen ve genesetleri belirledik. Bu karşılaştırma sonucunda, altı gen anlamlı olarak tanımlanırken, beş Gene Ontology (GO) genesetinin bipolar ve sağlıklı beyinlerde farklı şekillerde düzenleme gösterdiğini gözlemledik. Literatür araştırması anlamlı biyolojik gensetlerin tedavi yoluyla etkilendiğini gösterdi.
Özet (Çeviri)
Bipolar disorder (BD) is a heritable severe illness. One of the indications of BD is working memory (WM) impairment which is a heritable cognitive trait. The aim of the current study is to identify the transcriptomic level developmental biomarkers of BD in WM-related brain regions. We based our analysis on adolescence and young adulthood (AYA), the critical period for both BD and cognitive development. We have chosen 4 publicly available datasets from Gene Omnibus database for which one is derived from healthy controls and three from bipolar disorder patients. We compared different developmental periods of the brains of normal subjects to determine healthy brain development at the transcriptomic level. After applying the same method to detect bipolar development to show differences between BD and healthy brains. We followed these comparisons in two steps; on gene-level analysis and geneset level analysis. Next, we identifi ed common genes and pathways from the results of different analyses. As a result of this comparison, while six genes were identi fied diffrentially expressed, we observed 5 Gene Ontology (GO) genesets shown different regulation patterns in bipolar and healthy brains. The literature review has been shown that the signifi cant biological pathways might be influenced by the treatment.
Benzer Tezler
- Multiomic data analysis of schizophrenia and bipolar disorder
Şizofreni ve bipolar bozukluğa dair çoklu omik verilerinin analizi
BURAK ÇARDAK
Yüksek Lisans
İngilizce
2024
Psikiyatriİstanbul Medeniyet ÜniversitesiBiyoistatistik ve Tıp Bilişimi Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ MUHAMMED ERKAN KARABEKMEZ
- Bipolar bozukluk tanılı hastaların indüklenmiş pluripotent kök hücrelerinde (IPS) mikroRNA ekspresyon değişimlerinin incelenmesi
Analyzing mirna expression changes in bipolar disorder patientspecific induced pluripotent stem cells (İPSC).
BEGÜM ALURAL
Doktora
Türkçe
2018
Moleküler TıpDokuz Eylül ÜniversitesiSinir Bilimi Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ŞERMİN GENÇ
- Ota-C osilatörlerinde ideal olmama problemi
Başlık çevirisi yok
UĞUR ÇAM
Yüksek Lisans
Türkçe
1996
Elektrik ve Elektronik Mühendisliğiİstanbul Teknik ÜniversitesiPROF.DR. H. HAKAN KUNTMAN
- Çimentonun sertleşmesi üzerinde kimyasal komponentlerin etkisi
Başlık çevirisi yok
NACİYE TÜRKEL
Yüksek Lisans
Türkçe
1986
Kimya MühendisliğiUludağ ÜniversitesiKimya Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MUSTAFA CEBE
- Nükleer rezonasta moleküler yapıların incelenmesi (yapısal faz geçiş kuramları üzerine bir inceleme)
Başlık çevirisi yok
ABDURRAHMAN ANDİÇ
Yüksek Lisans
Türkçe
1986
Fizik ve Fizik MühendisliğiUludağ ÜniversitesiFizik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. AYTAÇ YALÇINER