Geri Dön

Analysis of differentially expressed genes in bipolar disorder: Transcriptomic signature of adolescence and young adulthood in working memory-relared area

Bipolar bozuklukta farklı eksprese genlerin analizi: Çalışma belleği ile ilgili bölgelerde ergenlik ve genç erişkinliğin transkriptom imzası

PDF İndir

  1. Tez No: 654706
  2. Yazar: RABİA ŞEN
  3. Danışmanlar: PROF. DR. TIMOTHEA TOULOPOULOU
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Genetik, Psikiyatri, Genetics, Psychiatry
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2020
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: İhsan Doğramacı Bilkent Üniversitesi
  10. Enstitü: Mühendislik ve Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Nörobilim Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 53

Özet

Bipolar bozukluk (BB) kalıtsal, ciddi bir hastalıktır. BB'nin belirtilerinden biri, bilişsel ve kalıtımsal bir işlev olan çalışma belleği (ÇB) bozukluğudur. Bu çalışmanın amacı transkriptomik düzeyde BB'nin ve ÇB ilişkili beyin bölgelerindeki gelişimsel biyobelirteçleri belirlemektir. Analizimizi hem bilişsel gelişim hem de BB için kritik bir dönem olan ergenlik ve genç yetişkinlik dönemine göre kurduk. Gene Omnibus veritabanından, bir sağlıklı, üç bipolar olmak üzere dört halka açık verisetini seçtik. BB ve sağlıklı beyin gelişimi arasındaki farklılıkları göstermek için, öncelikle sağlıklı örnekleri karşılaştırdık, daha sonra aynı adımları bipolar örnekleri için ayrıca uyguladık. Bu karşılaştırmaları gen düzeyinde analiz ve geneset düzeiynde analiz olarak iki adımda izledik. Bir sonraki aşamada, farklı analizlerden gelen ortak gen ve genesetleri belirledik. Bu karşılaştırma sonucunda, altı gen anlamlı olarak tanımlanırken, beş Gene Ontology (GO) genesetinin bipolar ve sağlıklı beyinlerde farklı şekillerde düzenleme gösterdiğini gözlemledik. Literatür araştırması anlamlı biyolojik gensetlerin tedavi yoluyla etkilendiğini gösterdi.

Özet (Çeviri)

Bipolar disorder (BD) is a heritable severe illness. One of the indications of BD is working memory (WM) impairment which is a heritable cognitive trait. The aim of the current study is to identify the transcriptomic level developmental biomarkers of BD in WM-related brain regions. We based our analysis on adolescence and young adulthood (AYA), the critical period for both BD and cognitive development. We have chosen 4 publicly available datasets from Gene Omnibus database for which one is derived from healthy controls and three from bipolar disorder patients. We compared different developmental periods of the brains of normal subjects to determine healthy brain development at the transcriptomic level. After applying the same method to detect bipolar development to show differences between BD and healthy brains. We followed these comparisons in two steps; on gene-level analysis and geneset level analysis. Next, we identifi ed common genes and pathways from the results of different analyses. As a result of this comparison, while six genes were identi fied diffrentially expressed, we observed 5 Gene Ontology (GO) genesets shown different regulation patterns in bipolar and healthy brains. The literature review has been shown that the signifi cant biological pathways might be influenced by the treatment.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    868590

    Multiomic data analysis of schizophrenia and bipolar disorder

    Şizofreni ve bipolar bozukluğa dair çoklu omik verilerinin analizi

    BURAK ÇARDAK

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2024

    Biyomühendislikİstanbul Medeniyet Üniversitesi

    Biyolojik Veri Bilimi Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ MUHAMMED ERKAN KARABEKMEZ

  2. Tez No

    526275

    Bipolar bozukluk tanılı hastaların indüklenmiş pluripotent kök hücrelerinde (IPS) mikroRNA ekspresyon değişimlerinin incelenmesi

    Analyzing mirna expression changes in bipolar disorder patientspecific induced pluripotent stem cells (İPSC).

    BEGÜM ALURAL

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2018

    BiyolojiDokuz Eylül Üniversitesi

    Sinir Bilimi Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ŞERMİN GENÇ

  3. Tez No

    246744

    Analysis of differentially expressed genes in breast cancer: BRCA1-induced gene expression profiles and meta-analysis gene signature

    Meme kanserinde farklılaşmış ifade gösteren genlerin analizi: BRCA1 tarafından indüklenen gen ifade profilleri ve meta-analiz gen imzası

    BALA GÜR DEDEOĞLU

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2009

    Biyolojiİhsan Doğramacı Bilkent Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. IŞIK G. YULUĞ

  4. Tez No

    695598

    Systems biology analysis of kinase inhibitors in liver cancer cells using next generation sequencing data

    Yeni nesil dizileme tekniği kullanılarak karaciğer kanserinin sistem biyolojisi analizi

    KÜBRA NARCI

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2021

    BiyolojiOrta Doğu Teknik Üniversitesi

    Sağlık Bilimleri Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. YEŞİM AYDIN SON

    PROF. DR. RENGÜL ÇETİN ATALAY

  5. Tez No

    568950

    Kuraklık stresi uygulanmış mercimek (Lens Culinaris Medik.) bitkisinin RNA dizileme yöntemi ile transkripsiyonel analizi

    Transcriptional analysis of lentil (Lens culinaris Medik.) plant exposed to drought stress by RNA sequencing method

    HANDE MORGİL

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    Biyolojiİstanbul Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. GÜL CEVAHİR ÖZ

    PROF. DR. İBRAHİM HALİL KAVAKLI

Geri Dön