TLR3 ve TLR5 gen polimorfizmlerinin şizofreni ile ilişisinin araştırılması
Association of TLR3 and TLR5 gene polymorphism with schizophrenia
- Tez No: 657327
- Danışmanlar: DOÇ. DR. SEVİM KARAKAŞ ÇELİK
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Genetik, Biology, Genetics
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2021
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Zonguldak Bülent Ecevit Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 97
Özet
Şizofreni, oluşma nedeni ve patogenezi tam aydınlatılamamış, nöropsikiyatrik bozukluktur. Toplumun yaklaşık %1'lik kısmını etkiler. Şizofreninin etiyolojisinde TLR'lerin rolü hakkında bilgi eksikliği olmasına rağmen, TLR'lerin prenatal enfeksiyon, inflamasyon, obstetrik komplikasyon, oksidatif/nitrozatif stres, nörodejenerasyon ve bilişsel rolü hakkındaki çalışmalar, TLR'lerin şizofreni patogenezine katkıda bulunabileceğini göstermektedir. Bildiğimiz kadarıyla TLR gen polimorfizmleriyle şizofreni ilişkisini araştıran çalışma bulunmamaktadır. Bu çalışmada şizofreni ile TLR3 ve TLR5 gen polimorfizmleri arasında ilişki olup olmadığının belirlenmesi amaçlanmıştır. Çalışmamıza şizofreni tanısı konmuş 140 hasta ve herhangi nöropsikiyatrik hastalığı olmayan 104 sağlıklı birey katıldı. TLR3 rs3775291 ve TLR5 rs1861172 gen polimorfizmleri MAF değerine bakıldıktan sonra PolyPhen 2.0, MirSNP ve SIFT veri tabanları kullanılarak seçildi. Polimorfizmler polimeraz zincir reaksiyonu-restriksiyon parça uzunluk polimorfizmi (PCR-RFLP) yöntemiyle tespit edildi. Şizofreniyle rs3775291 polimorfizmi arasındaki ilişki incelendiğinde CC, CG, GG genotipleri sırasıyla şizofreni grubunda %61.4, %31.4, %7.1, kontrol grubunda CC, CG, GG genotipleri sırasıyla %53.8, %37.5, %8.7 olarak bulundu. Gruplar arasında istatistiksel olarak anlamlı fark bulunamadı (p>0.05). Şizofreniyle rs1861172 polimorfizmi arasındaki ilişki incelendiğinde AA, AG, GG genotipleri sırasıyla şizofreni grubunda %30.7, %55.0, %14.3, kontrol grubunda AA, AG, GG genotipleri sırasıyla %33.7, %51.9, %14.4 olarak bulundu. Gruplar arasında istatistiksel olarak anlamlı fark bulunamadı (p>0.05). Bu çalışma şizofreninin rs3775291 ve rs1861172 polimorfizmleriyle arasındaki ilişkinin araştırıldığı ilk çalışmadır. Ancak gruplar arasında istatistiksel olarak anlamlı fark saptanmamıştır. Şizofreninin etnik varyasyon gösterdiği düşünüldüğünde çalışmanın başka popülasyonlarda tekrarlanması faydalı olacaktır.
Özet (Çeviri)
Schizophrenia is a neuropsychiatric disorder whose cause and pathogenesis have not been fully clarified. It affects approximately 1% of the society. Despite the lack of knowledge about the role of TLRs in the etiology of schizophrenia, TLRs appear to belong to the pathogenesis of schizophrenia in studies of prenatal infection, inflammation, obstetrication, oxidative/nitrosative stress, neurodegeneration, and cognitive role. To the best of our knowledge, there are no studies investigating the relationship between TLR gene polymorphisms and schizophrenia. In this study, it was aimed to determine whether there is a association between schizophrenia and TLR3 and TLR5 gene polymorphisms. 140 patients diagnosed with schizophrenia and 104 healthy individuals without any neuropsychiatric disease participated in our study. TLR3 rs3775291 and TLR5 rs1861172 gene polymorphisms were selected by using PolyPhen 2.0, MirSNP and SIFT databases after checking the MAF value. Polymorphisms were detected by polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism (PCR-RFLP) method. When the association between schizophrenia and rs3775291 polymorphism was find, CC, CG, GG genotypes respectively 61.4%, 31.4%, 7.1% in the schizophrenia group, and CC, CG, GG genotypes respectively 53.8%, 37.5%, 8.7% in the control group. There was no statistically significant difference between the two groups (p> 0.05). When the association between schizophrenia and rs1861172 polymorphism was examined, AA, AG, GG genotypes respectively 30.7%, 55.0%, 14.3% in the schizophrenia group, and AA, AG, GG genotypes respectively 33.7%, 51.9%, 14.4% in the control group. There was no statistically significant difference between the two groups (p> 0.05). This study is the first study investigating the association between schizophrenia with rs3775291 and rs1861172 polymorphisms. After all; there was no statistically significant difference between the groups. Considering the ethnic variation of schizophrenia, it will be useful to repeat the study in other populations.
Benzer Tezler
- TLR9 ve Irak4 genlerindeki sekans varyantların akciğer kanseri riski ile ilişkisinin belirlenmesi
Determining the association of sequence variants in TLR9 and İrak4 genes with lung cancer risk
TUĞÇE GÜL GÜNEY
Yüksek Lisans
Türkçe
2023
Tıbbi BiyolojiKütahya Sağlık Bilimleri ÜniversitesiTıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. CANSU ÖZBAYER
- Contribution of notch signaling on hcc stem cell status and utilizing TLR agonists and notch inhibition to improve HCC therapy
Notch yolağının hcc kök hücrelerine katkısı ve HCC tedavisi için TLR ulaklarıyla notch baskılamasının kullanılması
YUSUF İSMAİL ERTUNA
Yüksek Lisans
İngilizce
2014
Biyolojiİhsan Doğramacı Bilkent ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. İHSAN GÜRSEL
PROF. DR. MEHMET ÖZTÜRK
- Expression of toll like receptores in lung cancer and investigating their effect on apoptosis
Akciğer kanser hücrelerinde toll like reseptörlerin ekspresyonu ve apoptozise olan etkisinin araştırılması
HALEH AINESAZ
Yüksek Lisans
İngilizce
2014
OnkolojiHacettepe ÜniversitesiBiyoloji Bölümü
PROF. DR. EMİN KANSU
YRD. DOÇ. DR. HANDE CANPINAR
- Investigation of lung cancer cell culture supernatants activated with tlr agonists effect on macrophage polarization
TLR agonistleri ile aktive olan akciğer kanseri hücre kültür süpernatanlarının makrofaj polarizasyonuna etkisinin araştırılması
BEHNAM AHMADZADEH
Yüksek Lisans
İngilizce
2018
Moleküler TıpHacettepe ÜniversitesiTemel Onkoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. DİCLE GÜÇ
DR. HANDE CANPINAR
- Leishmanıa tropica ile enfekte U937 makrofaj hücre hattının toll-lıke reseptörleri ve yolaklarının PCR Array ile araştırılması
Analysis of the effect of toll-like receptors on Leishmania tropica and U937 macrophage cell line by PCR Array
EBRU UYSAL
Yüksek Lisans
Türkçe
2018
ParazitolojiErciyes ÜniversitesiTıbbi Parazitoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ALPARSLAN YILDIRIM