Geri Dön

Özel ortamlardan izole edilen aktinomiset izolatlarının antioksidan ve antikanser aktivitesi

Antioxidant and anticancer activity of actinomycete isolates obtaited from special area

  1. Tez No: 661181
  2. Yazar: BAHAR GÜLCE KORKMAZ KAHVECİ
  3. Danışmanlar: PROF. MUSTAFA YAMAÇ
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyoloji, Biology
  6. Anahtar Kelimeler: Aktinomisetler, antioksidan aktivite, sitotoksik aktivite, apoptotik etki, UV koruyu aktivite, gen ifadesi, Actinomycetes, antioxidant activity, cytotoxic activitiy, apoptotic effect, UV protective activity, gene expression
  7. Yıl: 2021
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Eskişehir Osmangazi Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Temel ve Endüstriyel Mikrobiyoloji Bilim Dalı
  13. Sayfa Sayısı: 231

Özet

Bu çalışmada öncelikle özel ortamlardan izole edilen toplam 319 adet aktinomiset izolatının antimikrobiyal, DPPH radikal süpürücü ve MTS yöntemiyle sitotoksik aktivitelerine dayalı olarak bir tarama çalışması gerçekleştirilmiştir. Seçilen 404i ve C3-3 izolatlarına ait metabolitlerin antioksidan, UV koruyucu ve sitotoksik ve apoptotik etkileri kapsamlı olarak araştırılmıştır. 404i ve C3-3 izolatlarının liyofilize kültür sıvıları ile 0.018 ve 0,019 mg/ml gallik asit eşdeğeri total fenolik madde miktarı ve 16,59 ve 13,20 mg/ml DPPH radikal süpürücü aktivite EC50 değerleri belirlenmiştir. 404i ve C3-3 izolatlarının 120. dakikanın sonunda betakaroteni %59 ve %68 oranında koruduğu bulunmuştur. İzolatların ABTS radikal katyon renk giderim aktivitesi 0,3 mg/ml'de %100 ve metal şelatlayıcı aktivitesi sırasıyla 0,302 ve 0,291 mg/ml EDTA eşdeğeri olarak, saptanmıştır. Ayrıca, lipit peroksidasyonunun inhibisyonu çalışmalarında ferrik tiyosiyanat yöntemi ile %53,35 ve %55,88 inhibisyon ve tiyobarbiturik asit yöntemi ile %76,91 ve %78,9 inhibisyon oranlarına ulaşılmıştır. 404i ve C3-3 izolatlarının aktif metabolitleri, Saccharomyces cerevisiae modelinde UV koruyucu özellik göstermemiştir. 404i ve C3-3 izolatlarının liyofilize kültür sıvılarının MTS yöntemi ile belirlenen IC50 değerleri, sırasıyla K562 hücre hattı için 312,57 ve 266,66 μg/ml, HL-60 hücre hattı için 141,80 ve 75,85 μg/ml ve THP-1 hücre hattı için 112,95 ve 90,42 μg/ml olarak bulunmuştur. İzolatlara ait metabolitlerin HL-60 ve THP-1 hücre hatlarında Real Time PZR yöntemiyle apoptotik aktivite açısından Apaf-1, ASK-1, TNF-α, NF-KB ve NF-KB1 genlerinin mRNA ifadeleri üzerinde etkili olduğu gözlenmiştir. Özellikle THP-1 hücre hattında NF-KB1 geninde, mRNA ifade düzeyinde 404i ve bortezomibin kontrole göre kıyasla 2,5 ve 9 kat azaldığı, Apaf-1 ve ASK-1 genlerinde ise 1,1-2 kat arasında bir azalmaya neden olduğu görülmüştür.

Özet (Çeviri)

In this study, firstly, a screening study was performed for totally 319 actinomycetes isolates obtained from special areas based on their antimicrobial, DPPH radical scaving and cytotoxic activities. The metabolites of selected isolates, 404i and C3-3, were investigated for their antioxidant, UV protective, cytotoxic and apoptotic effects in detail. Total amount of phenolic content of lyophilized culture fluid of 404i and C3-3 isolates were determined as 0.018 and 0.019 mg/ml of gallic acid equivalent, and the EC50 values of DPPH radical scavenging activity of the isolates were 16.59 and 13.20 mg/ml. It was found that the 404i and C3-3 isolates protected beta carotene 59% and 68% at the end of the 120th minutes. ABTS radical cation decolorization activity of the isolates was 100% at 0.3 mg/ml and metal chelating activity was determined as 0.302 and 0.291 mg/ml EDTA equivalent, respectively. In addition, in the inhibition of lipid peroxidation studies, 53.35% and 55.88% inhibition rates were achieved with the ferric thiocyanate method and 76.91% and 78.9% inhibition rates with the thiobarbituric acid method. Active metabolites of the 404i and C3-3 isolates have not presented UV protective properties in the Saccharomyces cerevisiae model.The IC50 values of lyophilized culture fluid of 404i and C3-3 isolates were determined as 312.57 and 266.66 μg/ml for the K562 cell line, 141.80 and 75.85 μg/ml for the HL-60 cell line and 112.95 and 90.42 μg/ml for the THP-1 cell line, respectively. It was observed that the metabolites of the isolates have effective on the mRNA expressions of Apaf-1, ASK-1, TNF-α, NF-KB and NF-KB1 genes in terms of apoptotic activity by Real Time PCR method in HL-60 and THP-1 cell lines. Especially in the NF-KB1 gene of THP1 cell line, the mRNA expression level of 404i and bortezomib have decreased 2.5 and 9 times compared to the control and it caused a 1.1-2 times decrease in the Apaf-1 and ASK1 genes.

Benzer Tezler

  1. Karasal ortamlardan izole edilen streptomyces türlerinin sekonder metabolit biyosentez genlerinin taranması

    Screening of secondary metabolite biosynthesis genes from terrestrial streptomyces strains

    BÜLENT BALİ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2011

    BiyoteknolojiDicle Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. EBRU İNCE YILMAZ

  2. Farklı ortamlardan izole edilen mikrobiyal preparatların nohut bitkisi (Cicer arietinum L.) gelişimi üzerine etkisinin belirlenmesi

    Determining the effect of microbial preparations on development of chickpea plant (Cicer arietinum L.)isolated from different environments

    EMRE TUNÇ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    BiyolojiTokat Gaziosmanpaşa Üniversitesi

    Biyomühendislik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. İSA KARAMAN

    DOÇ. DR. UĞUR TUTAR

  3. Design optimization and experimental validation of the additively manufactured passive vibration isolator of an inertial measurement unit in aerospace applications

    Havacılık uygulamalarında bir ataletsel ölçüm biriminin eklemeli imalat ile üretilen pasif titreşim izolatörünün tasarım optimizasyonu ve deneysel doğrulaması

    COŞKU VARDALLI

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2023

    Makine Mühendisliğiİstanbul Teknik Üniversitesi

    Makine Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. OSMAN TAHA ŞEN

    DR. CEYHUN TOLA

  4. Arnebia densiflora Ledeb. Bitkisinde bitki doku kültürü metotları ile şikonin ve türevlerinin üretilmesi

    Production of shikonin and derivatives with plant tissue culture methods in Arnebia densiflora Ledeb.

    TUĞBA ERÇETİN

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2013

    BiyoteknolojiAnkara Üniversitesi

    Temel Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. GÜLNUR TOKER

  5. Investigation of effect on different organic solvent on solid supported lipid bilayer via atomic force microscopy

    Farklı organik çözücülerin yüzey destekli lipit katmanlar üzerine etkilerinin atomik kuvvet mikroskobu ile araştırılması

    SÜLEYMAN ÇELİK

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2016

    Biyolojiİstanbul Teknik Üniversitesi

    İleri Teknolojiler Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. FATMA NEŞE KÖK

    DOÇ. DR. HAKAN ÖZGÜR ÖZER