Geri Dön

Corynebacterium striatum izolatlarının antimikrobiyal duyarlılıklarının, biyofilm üretimlerinin ve klonal analizlerinin değerlendirilmesi

Evaluation of antimicrobial susceptibility, biofilm production and clonal analysis of corynebacterium striatum isolates

PDF İndir

  1. Tez No: 669621
  2. Yazar: FATMA YAŞAR
  3. Danışmanlar: DOÇ. DR. İPEK MUMCUOĞLU
  4. Tez Türü: Tıpta Uzmanlık
  5. Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
  6. Anahtar Kelimeler: C. striatum, antimikrobiyal direnç, biyofilm, C. striatum, antimicrobial resistance, biofilm
  7. Yıl: 2020
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Sağlık Bilimleri Üniversitesi
  10. Enstitü: Tıp Fakültesi
  11. Ana Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 52

Özet

Amaç: Bu çalışmada tıbbi mikrobiyoloji laboratuvarına gelen örneklerden izole edilen ve etken ya da kontaminant olarak değerlendirilen C. striatum izolatlarının antimikrobiyal duyarlılık testleri, biyofilm üretme kabiliyetleri, genotipleri karşılaştırılmış, hastaların demografik özellikleri incelenmiş ve C.striatum'un klinik önemini etkileyen faktörlerin belirlenmesi amaçlanmıştır. Gereç ve Yöntem: Çalışmaya Ankara Numune Eğitim ve Araştırma Hastanesi Tıbbi Mikrobiyoloji laboratuvarına 1 Kasım 2018 - 30 Nisan 2019 tarihleri arasında gönderilen çeşitli klinik örneklerden izole edilen 58 C. striatum izolatı dahil edilmiştir. Klinisyen tarafından bu izolatların 29'u enfeksiyon etkeni olarak, diğer 29'u kontaminasyon-kolonizasyon olarak değerlendirilmiştir. Hastaların kültür alındığı anda hastanede yatış günü, altta yatan hastalık varlığı (diabetes mellitus, nörolojik hastalık, iskemik kalp hastalığı, kronik böbrek hastalığı, solid tümör), son bir ay içerisinde geçirilen cerrahi, daha önceki antimikrobiyal kullanımı incelenmiştir. Çalışmaya dahil edilen 58 C. striatum izolatından 13 tanesi etken gruptan, 13 tanesi kontaminasyon-kolonizasyon grubundan seçilerek 26 izolatın antimikrobiyal duyarlılık testleri yapılmıştır. Antimikrobiyal duyarlılık testleri, gradiyent strip yöntemiyle yapılmıştır ve EUCAST standartlarına göre değerlendirilmiştir. Çalışmaya alınan tüm suşlarda biyofilm oluşumu negatif yüklü polistren yüzeylerde 96 kuyucuklu mikrotitre plaklarında belirlenmiştir. Klonal analiz için izolatlar PFGE yöntemiyle Xba1 enzimi kullanılarak değerlendirilmiştir. Bulgular: Çalışmaya alınan iki hasta grubunda demografik özellikler açısından fark olmadığı izlenmiştir. Nörolojik hastalığı olanlarda C.striatum etken olarak daha sık izlenirken (p=0,025), diğer komorbiditelerin iki grup arasında farklı olmadığı görülmüştür. Poliklinik hastalarından izole edilen suşların kontaminasyon veya kolonizasyon kabul edilme oranının daha yüksek olduğu anlaşılmıştır (p=0,034). Antimikrobiyal duyarlılık testlerinde her iki grupta da yaygın çoklu ilaç direnci olduğu izlenmiştir. Gruplar arasında antimikrobiyal duyarlılık açısından anlamlı bir fark olmadığı görülmüştür. Biyofilm üretiminin etken grupta anlamlı şekilde daha yüksek olduğu tespit edilmiştir (p=0,015). Genotipik değerlendirmede, izolatların çok farklı PFGE paternleri gösterdiği ve klonal olarak birbiriyle ilişkili olmadığı belirlenmiştir. Sonuç: C. striatum cilt ve mukoz membranların normal florasında bulunmakla birlikte, son yıllarda artan sıklıkta enfeksiyon etkeni olarak da bildirilmektedir. Kültürde C. striatum izole edildiğinde, enfeksiyon etkeni, kontaminasyon veya kolonizasyon olduğunu belirlemek sıklıkla çoklu ilaç direnci olan bu mikroorganizmanın tedavisinde çok önemlidir. Bu çalışmada, enfeksiyon oluşumunda C.striatum izolatlarının genotipleri ve direnç paternlerinden ziyade, bakteriye ait virulans faktörlerinin ve hastaya özgül değişkenlerin önemli olduğu belirlenmiştir.

Özet (Çeviri)

Aim: In this study, antimicrobial susceptibility tests, biofilm production ability, genotypes of C. striatum strains isolated from medical microbiology laboratory samples were compared, demographic characteristics of patients were investigated and the aim of this study was to determine the factors that affect the clinical importance of C.srtiatum. Material and Methods: Fifty eight C. striatum isolates isolated from various clinical samples sent to Ankara Numune Training and Research Hospital Medical Microbiology Laboratory between November 1, 2018 and April 30, 2019 were included in the study. The clinician evaluated 29 of these isolates as infectious agents and 29 of them as contamination-colonization. Patient's hospitalization day, presence of underlying disease (diabetes mellitus, neurological disease, ischemic heart disease, chronic kidney disease, solid tumor), surgery in the last month and previous antibiotic use were examined. Antimicrobial susceptibility tests were performed for 26 isolates, 13 of which were selected from the infection agent group and 13 from the contamination-colonization group. Antimicrobial susceptibility tests were performed by gradient strip method and evaluated according to EUCAST standards. Biofilm formation in all strains included in the study was determined on 96-well microtiter plates on negatively charged polystyrene surfaces. For clonal analysis, isolates were evaluated by PFGE method using Xba1 enzyme. Results: There was no difference in demographic characteristics in the two patient groups included in the study. While C.striatum was observed more frequently as a causative agent in patients with neurological disease (p=0.025), it was observed that other comorbidities were not different between the two groups. It was found that strains isolated from outpatient setting were more frequently accepted as contamination or colonization (p=0.034). Antimicrobial susceptibility testing showed widespread multidrug resistance in both groups. There was no significant difference between the groups in antimicrobial susceptibility. Biofilm production was found to be significantly higher in the infection agent group (p=0.015). In our study, it was found that the strains showed very different PFGE patterns and were not clonally related to each other. Conclusion: Although C. striatum is found in normal flora of skin and mucous membranes, it has been reported to be an increasing cause of infection in recent years. When C. striatum is isolated in culture, it is often important to determine whether there is an infection agent, contamination or colonization for the treatment of this multidrug-resistant microorganism. In this study, it was determined that bacterial virulence factors and patient specific variables were important for infection rather than genotypes and resistance patterns of C.striatum isolates.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    578331

    Yoğun bakım ünitesinden izole edilen corynebacterium cinsi bakterilerin mikrobiyolojik özellikleri, antibiyotik duyarlılığı ve moleküler özellikleri yönünden araştırılması

    Investigation of microbiological characteristics, antibiotic susceptibility and molecular properties of corynebacterium species isolated from intensive care unit

    MEHTAP BİÇER

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    Mikrobiyolojiİstanbul Üniversitesi-Cerrahpaşa

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. GÖKHAN AYGÜN

  2. Tez No

    796578

    Klinik örneklerden izole edilen corynebacterium türlerinde biyofilm oluşumunun, anti-quorum sensing aktivitesinin ve antimikrobiyal direnç durumunun araştırılması

    Başlık çevirisi yok

    BANU HÜMEYRA KESKİN

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    MikrobiyolojiDüzce Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. İDRİS ŞAHİN

  3. Tez No

    830805

    Klinik örneklerden izole edilen difteri dışı korineform bakterilerin identifikasyonu, antibiyotik direnç paterninin ve biyofilm oluşumunun araştırılması

    Identification, research of antibiotic resistance pattern and biofilm formation of non-diphtheria coryneform bacteria isolated from clinical specimens

    HATİCE ER

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    MikrobiyolojiPamukkale Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. İLKNUR KALELİ

  4. Tez No

    781246

    Isolation and molecular identification of some types of soil bacteria, testing its ability to produce silver nanoparticles and investigating their effectiveness against leishmania tropica and molecular analysis of this parasite

    Bazı toprak bakteri türlerinin izolasyonu ve moleküler tanımlanması, gümüş nanopartiküller üretme yeteneklerinin test edilmesi ve leishmania tropica'ya karşı etkinliklerinin incelenmesi ve bu parazitin moleküler çalışması

    MOHAMMED ATIYAH GHANIM AL-MARYANI

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2022

    BiyolojiÇankırı Karatekin Üniversitesi

    Biyolojik Bilimler Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ YAŞAR KEMAL YAZGAN

  5. Tez No

    461092

    Ağız patojenlerine etkili olabilecek bazı uçucu yağların kimyasal bileşimlerinin ve antimikrobiyal aktivitelerinin değerlendirilmesi

    Evaluation of chemical compositions and antimicrobial activities of some essential oils against oral pathogens

    GÖZDE ÖZTÜRK

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2017

    Eczacılık ve FarmakolojiAnadolu Üniversitesi

    Farmakognozi Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. BETÜL DEMİRCİ

Geri Dön