Geri Dön

Türkiye'de yayılış gösteren Conringia Heist. ex. Fabr. (Brassicaceae) cinsinin çekirdek (nrDNA) ıts ve kloroplast (cpDNA) trnL-F dizilerine dayalı moleküler sistematik analizi

Molecular systematic analysis of the genus Conringia Heist. ex. Fabr. (Brassicaceae) distributed in Turkey using (nrDNA) and (cpDNA) trnL-F sequences

  1. Tez No: 670865
  2. Yazar: MELİKE AYDOĞAN
  3. Danışmanlar: DOÇ. DR. EMRE SEVİNDİK
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Ziraat, Agriculture
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2021
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Aydın Adnan Menderes Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Tarımsal Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 77

Özet

Bu çalışma ile ülkemizde yayılış gösteren Conringia cinsine ait türlerin çekirdek (nrDNA) ITS ve kloroplast (cpDNA) trnL-F bölgelerinin moleküler sistematik analizi yapılarak filogenetik ilişkileri değerlendirilmiştir. Çalışma sonucunda, Conringia türlerine ait ITS bölgelerinin Adenin + Timin bazının en çok olduğu türde oranı % 49.05 iken, en az olduğu türde ise % 40.39'dur. Guanin + Sitozin bazının en çok olduğu türde oran % 59.61 iken, en az olduğu türde % 50.95'dir. trnL-F bölgelerinin Adenin + Timin bazının en çok olduğu türde oran % 68.31 ve en az olduğu türse ise bu oran % 57.54 çıkmıştır. Guanin + Sitozin bazının en çok olduğu türde oran % 42.26 iken en az olduğu tüde ise % 31.69'dur. Türler arası genetik uzaklık matrisleri incelendiğinde, ITS verilerinde birbirine en yakın mesafede olan türlerin değeri 0.00 iken, birbirine en uzak mesafede olan türlerin değeri ise 0.17'dir. trnL-F verilerinde birbirine en yakın mesafede olan türlerin değeri 0.00, birbirine en uzak mesafede olan türlerin değerinin ise 0.90 olduğu gözlemlenmiştir. ITS ve trnL-F bölgelerinin yapılan Neighbor-Joining analizi sonucu oluşan ağaçları 2 bütün grupdan oluşmuştur. Oluşan filogenetik ağaçların sonuçları birbirini desteklemiştir.

Özet (Çeviri)

In this study, phylogenetic analysis of Turkish Conringia (Brassicaceae) species was conducted based on nuclear ribosomal DNA (nrITS) and chloroplast DNA (trnL-F) sequences. As a result of the study, the rate of ITS regions belonging to Conringia species is 49.05 % in the species with the highest A + T base, while it is 40.39 % in the species with the least. While the rate of G + C base is 59.61 % in the most common species, it is 50.95% in the species with the least. The ratio of trnL-F regions is 68.31% in the species with the highest A + T base and 57.54 % in the species with the lowest. While the rate in the type with the most G + C base is 42.26 %, it is 31.69 % in the least. The divergence values of nrITS sequences differed between 0.177 and 0.00 and divergence values of trnL-F sequences differed between 0.90 and 0.00. Neighbor-Joining tree generated using nrITS and trnL-F sequences consisted of two clades. The results of the phylogenetic trees formed supported each other.

Benzer Tezler

  1. Türkiye'de yayılış gösteren Conringia Heist. Ex Fabr. (Brassicaceae) cinsi üzerinde karşılaştırmalı mikromorfolojik ve anatomik araştırmalar

    Comparative micromorphological and anatomical investigations on Conringia Heist. Ex Fabr.genus in Turkey

    HATİCE İNCİ ALADI

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2016

    BiyolojiBalıkesir Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. SELAMİ SELVİ

  2. Türkiye'de yayılış gösteren Alyssum L. sek. Gamosepalum (Hausskn.) Dudley türleri üzerinde morfolojik, anatomik ve palinolojik araştırmalar

    Morphological, anatomical and palynological investigations on the Alyssum L. sect. Gamosepalum (Hausskn.) Dudley species distributed in Turkey

    AYLİN YILMAZ

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2023

    BiyolojiBursa Uludağ Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. GÜL KUŞAKSIZ

  3. Türkiye'de yayılış gösteren Macrovipera lebetina (Linnaeus, 1758), Montivipera xanthina (Gray, 1849) ve Vipera ammodytes (Linnaeus, 1758) zehirlerinin karşılaştırmalı proteomik karakterizasyonu, koagülasyon üzerindeki etkilerinin ve sitotoksisitelerinin belirlenmesi

    Comparative proteomic characterization of the venom of Macrovipera lebetina (Linnaeus, 1758), Montivipera xanthina (Gray, 1849) and Vipera ammodytes (Linnaeus, 1758) distributed in Turkey and determination of their effects on coagulation and cytotoxicity

    NAŞİT İĞCİ

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2015

    BiyokimyaAnkara Üniversitesi

    Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. FATMA DUYGU ÖZEL DEMİRALP

    PROF. DR. BAYRAM GÖÇMEN

  4. Türkiye'de yayılış gösteren su sıçanı Arvicola amphibius (Linnaeus, 1758) (Mammalia: Rodentia) populasyonlarının MtDNA (Sitokrom B ve kontrol bölgesi) varyasyonları

    MtDNA (Cytochrome B and control region) variations of water vole Arvicola amphibius (Linnaeus, 1758) (Mammalia: Rodentia) populations distributed in Turkey

    PERİNÇEK SEÇKİNOZAN ŞEKER

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2015

    BiyolojiAnkara Üniversitesi

    Zooloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ERCÜMENT ÇOLAK

  5. Türkiye'de yayılış gösteren Ramalina (Ach.) cinsine ait bazı türlerin morfo-anatomik karakterleri ve multilokus moleküler sekans analizleri ile modern revizyonu

    Modern revision of the genus Ramalina (Ach.) in Turkey using morpho-anatomical characters and multilocus molecular sequence analyses

    BETÜL PATAT

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2016

    BiyolojiErciyes Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. MEHMET GÖKHAN HALICI