Kan kültürlerinden izole edilen çoğul dirençli gram negatif çomaklarda farklı yöntemlerle kolistin direncinin saptanması
Detecting of colistin resistance via different methods in multi-drug resistant gram negative bacilli isolated from blood cultures
- Tez No: 671432
- Danışmanlar: DOÇ. DR. LÜTFİYE ÖKSÜZ
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Klinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon Hastalıkları, Mikrobiyoloji, Sağlık Eğitimi, Clinical Microbiology and Infectious Diseases, Microbiology, Health Education
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2021
- Dil: Türkçe
- Üniversite: İstanbul Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: 110
Özet
Son yıllarda kan kültürlerinden izole edilen çoğul dirençli bakteriler artmaya ve tedavi seçeneklerini kısıtlamaya başlamıştır. Çoğul dirençli suşların etken olduğu enfeksiyonlarda kolistinin kombinasyon şeklinde kullanılması tercih edilebilmektedir. Kolistin direncinin saptanması için sıvı mikrodilüsyon yöntemi altın standart olarak tavsiye edilmiş yöntemdir. Ancak bu yöntem emek yoğun ve zaman alıcı olması nedeniyle rutin laboratuvarlarda uygulanamadığından yeni ve kolay uygulanabilen yöntemlerin geliştirilmesi ihtiyacı ortaya çıkmıştır. Bu çalışmada 2019 -2020 yıllarında çeşitli kliniklerden gönderilen kan kültürlerinden izole edilen 102 çoğul dirençli Gram negatif çomaklarının kolistine duyarlılığı, dört farklı yöntem (makrodilüsyon, buyyonda disk elüsyon, ticari mikrodilüsyon ve hızlı polimiksin NP testi) ile yapılarak referans yöntem olan sıvı mikrodilüsyon (BMD) yöntemi ile karşılaştırılmıştır. Ardından kolistine dirençli izolatlarda kolistin-tigesiklin ve kolistin-meropenem kombinasyonları arasında sinerji olup olmadığı dama tahtası yöntemiyle araştırılmıştır. Ayrıca kolistine dirençli izolatlarda PCR ile mcr-1 direnç geni araştırılmıştır. BMD yöntemi ile 15 (%15) izolatta kolistin direnci, MİK50 ve MİK90 ≤0.25 μg/ml ve 16 g/ml olarak saptanmıştır. Denenen tüm yöntemlerde kategorik uyumun çok iyi (%100) olduğu bulunmuştur. Bu yöntemlerle çok büyük hataya rastlanmamasına rağmen makrodilüsyon ve ticari mikrodilüsyon yöntemi en fazla küçük hata veren yöntemlerdir. En iyi esansiyel uyum oranı veren yöntemin disk elüsyon yöntemi olduğu bulunmuştur. Kolistine dirençli izolatlarda kolistin-meropenem kombinasyonu %100 ve kolistin-tigesiklin kombinasyonu %80 oranda sinerjik etki göstermiştir. Kolistine dirençli suşlar arasında mcr-1 geni saptanmamıştır. Son zamanlarda kullanılmaya başlanan yöntemler olan disk elüsyon ve HPNP testlerinin, kolistin direncini saptamada en verimli, en kolay, en düşük maliyetli ve en iyi performans gösteren testler olduğu ve rutin kulanıma uygun olduğu saptanmıştır. Çoğul dirençli bakteriyemi/sepsis enfeksiyonlarında kolistin-meropenem kombinasyonunun iyi bir tedavi seçeneği olduğu düşünülmektedir.
Özet (Çeviri)
The isolation of colistin-resistant bacteria from bloodstream has increased for few years, causing therapy failure. It is recommended to use colistin in combination in infections caused by these bacteria. Broth microdiution method is the recommended as a standard method to detect colistin resistance. However this method could not be used in routin laboratories since it is labor-intensive and time consuming; therefore the requirement for new easy methods has emerged. In this study, susceptibility to colistin of MDR-GNB was studied by macrodilution, disc elution, commercial microdilution, rapid polymyxin NP tests and compared to broth microdiution to evaluate detecting of colistin resistance in MDR-GNB (n=102) isolated from blood cultures sent from different wards in 2019-2020. The combination of colistin with tigecycline and meropenem were then tested by checkerboard method. Additionally mcr-1 gene was investigated by PCR in colistin resistant isolates. Resistance to colistin was found to be 15%, MİK50 and MİK90 were found to be ≤0.25 μg/ml and 16 μg/ml by BMD method. The categorical agreement was very well (100%) in four methods no very major errors. However macrodilution and commerical microdilution (Diagonistics 8011) methods showed the highest minor errors rates amongst the four methods. The best essential agreement rate was detected by disc elution method. Colistin-meropenem combination exhibited 100% synergism and colistin-tigecycline 80%. No mcr-1 genes were detected in colistin resistant isolates. In conclusion, disc elution and HPNP which those newly developed methods for detecting resistance to colistin were the easiest, cheapest, most efficient and best performing methods, so they are convenient to use in routine laboratory. Colistin-meropenem combination is thought to be an excellent choice to treat bacteremia/sepsis caused by colistin-resistant bacteria.
Benzer Tezler
- Çocuk lösemi hastalarının febril nötropeni ataklarının üriner sistem enfeksiyonu ile ilişkisinin değerlendirilmesi
Retrospective evaluation of the relationship of febrile neutropenia attacks and urinary system infection in children with leukemia
HAKAN ARSLAN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2022
Çocuk Sağlığı ve HastalıklarıManisa Celal Bayar ÜniversitesiÇocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı
PROF. DR. HÜSEYİN GÜLEN
- Hastane kökenli infeksiyonlarda kan kültürlerinden izole edilen acinetobacter suşlarında agar dilüsyon yöntemiyle çeşitli antimikrobiyallere duyarlılığın belirlenmesi
Detection of suspectibility to various antimicrobials in acinetobacter subspecies which are from blood cultures at nosocomial infections with agar dilution method
SALİM AKSOY
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2004
Klinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon HastalıklarıSüleyman Demirel ÜniversitesiKlinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon Hastalıkları Ana Bilim Dalı
PROF.DR. GÜLER YAYLI
- Sefaperazon-sulbaktam, imipenem ve sefepimin antibiyoterapi etkinliklerinin çoğul dirençli ve duyarlı acinetobacter baumannii ile oluşturulan deneysel ikili apse modelinde karşılaştırılması
Assesment of efficacies of imipenem, cefoperazone-sulbactam and cefepim in rats with experimental thigh abscess model due to multidrug resistant and sensitive acinetobacter baumannii strains
MUSTAFA İSHAK YILDIRIM
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2006
Klinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon HastalıklarıTrakya ÜniversitesiKlinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon Hastalıkları Ana Bilim Dalı
PROF.DR. HAMDİ MURAT TUĞRUL
- Çoğul dirençli Acinetobacter baumannii ile oluşturulan deneysel pnömoni modelinde tigesiklin ve kolistinin tedavi aktiviteleri ve yan etkileri
Therapeutic activities and side effects of tigecycline and colistin in the experimental model established with multi-resistant Acinetobacter baumannii
MURAT YEŞİLYURT
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2009
Klinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon HastalıklarıTrakya ÜniversitesiEnfeksiyon Hastalıkları Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ÖZLEM TANSEL BOZKURT
- Kan kültürlerinden izole edilen gram pozitif çomakların identifikasyonu ve antibiyotiklere duyarlılıkları
Identification and antibiotic susceptibilities of gram posi̇ti̇ve rods from blood cultures isolated
FERDANE DANIŞMAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2015
BiyolojiMarmara ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. GÜNAY TÜLAY ÇOLAKOĞLU
DOÇ. DR. FATMA KÖKSAL ÇAKIRLAR