Yaşlanma mikrobiyom ilişkisinin uzun ömürlü spalax leucodon yer altı köstebeği modelinde 16s rrna amplikon sekanslama metodu ile araştırılması
Investigation of the relationship between aging and microbiome in long-lived subterranean mammalian model spalax leucodon by utilizing 16s rrna amplicon sequencing method
- Tez No: 679732
- Danışmanlar: PROF. DR. REŞAT ÜNAL, DR. ÖĞR. ÜYESİ TURAN DEMİRCAN
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Biology
- Anahtar Kelimeler: Spalax leucodon, Mikrobiyom, 16S rRNA Sekanslama, Uzun ömürlülük, Yaşlanma, Spalax leucodon, Microbiome, 16S rRNA Sequencing, Longevity, Aging
- Yıl: 2021
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Muğla Sıtkı Koçman Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 191
Özet
Bu tez çalışması, yaşlanma ile mikrobiyal çeşitlilik ve kompozisyon arasında bir ilişki olduğu hipotezi üzerine inşa edilmiştir. Bu amaçla uzun yaşam süreleri ile bilinen Spalax Leucodon model organizma olarak seçilmiş ve doğada ve laboratuvar ortamında yaşam süresi değişiklik gösteren canlılardan deri ve fekal örnekleri toplanmıştır. Elde edilen deri ve fekal örneklerine ait 16S rRNA V3-V4 gen bölgeleri çoğaltılmış ve ilk kez S. Leucodon için 16S rRNA amplikon dizilemesi gerçekleştirilmiştir. Elde edilen veri seti ile alfa ve beta çeşitlilik analizleri gerçekleştirilmiş olup, canlının sahip olduğu mikrobiyal çeşitliliğin esaret koşulları altında değişime uğradığı gösterilmiştir. In silico analizler doğrultusunda uzun yaşam ile ilişkili Muribaculacea bakteri ailesinin S. Leucodon bağırsak mikrobiyomu için belirteç tür olduğu sonucuna varılmıştır. Ayrıca S. Leucodon mikrobiyomu ile uzun yaşamlı diğer canlıların mikrobiyomunun benzeştiği hipotezi de bu tez çalışması kapsamında sınanmıştır.
Özet (Çeviri)
This study found upon the hypothesis that there is a relationship between aging and microbial diversity and composition. For that purpose, Spalax, known for its long life span, was selected as a model organism. Skin and fecal samples were collected from Spalax Leucodon whose life span differs in nature and laboratory environment under wild and captivity conditions. 16S rRNA V3-V4 gene regions of the obtained skin and fecal samples were copied and 16S rRNA amplicon sequencing was performed for S. Leucodon for the first time. Alpha and beta diversity analyses were performed with the obtained data set and it was shown that the microbial diversity of S. Leucodon underwent changes under captivity conditions. In-silico analyses concluded that the Muribaculacea bacteria family associated with longevity is the indicator species for the gut microbiome of S. Leucodon. In addition, the hypothesis that the S. Leucodon microbiome and the microbiome of other long-lived creatures are similar has also been tested within the scope of this thesis study.
Benzer Tezler
- Yıllık aşılamanın senyör köpeklerde kaygı, bilişsel fonksiyon bozukluğu ve fekal mikrobiyota üzerine etkilerinin incelenmesi
Investigation of the effects of annual vaccination on anxiety, canine cognitive dysfunction and fecal microbiota in senior dogs
BEGÜM SARAL
Doktora
Türkçe
2023
FizyolojiAnkara ÜniversitesiFizyoloji (Veterinerlik) Ana Bilim Dalı
PROF. DR. YASEMİN SALGIRLI DEMİRBAŞ
- Endüstriyel açıdan önemli olan karotenoid üreticisi Exiguobacterium cinsi bakterilerin gelişimlerinin ve pigment üretimlerinin optimizasyonu
Optimization of growth and pigment production in industrially important carotenoid pigment producing bacteria from genus Exiguobacterium
GAYE EKİN GÜRSOY
Yüksek Lisans
Türkçe
2021
BiyolojiAnkara ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ARZU ÇÖLERİ CİHAN
- Age-associated changes in innate immunity and their impacts on inflammatory diseases
Doğuştan gelen bağişiklikta yaşa bağli değişiklikler ve enflamatuar hastalıklar üzerindeki etkileri
MEHMET AKİF EŞKAN
Doktora
İngilizce
2011
Diş HekimliğiUniversity of Louisvilleİmmünoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. GEORGE HAJİSHENGALLİS
- Fungal biotransformation of novel 20(27)-octanor cycloastragenol and biological activities of the purified metabolites
Özgün 20(27)-oktanor sikloastragenol'ün fungal biyotransformasyonu ve saflaştırılmış metobolitlerinin biyolojik aktiviteleri
SEDA DUMAN
Yüksek Lisans
İngilizce
2019
Biyomühendislikİzmir Yüksek Teknoloji EnstitüsüBiyoteknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ERDAL BEDİR
PROF. DR. ALİ ÇAĞIR
- Nörotoksisiteye karşı probiyotik ve D vitamininin nöroprotektif etkisinin in vitro araştırılması
In vitro investigation of the neuroprotective effect of probiotics and vitamin D against neurotoxicity
FATMA HAZAN GÜL
Doktora
Türkçe
2023
Beslenme ve DiyetetikErciyes ÜniversitesiBeslenme ve Diyetetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. NALAN HAKİME NOĞAY
DOÇ. DR. GÖKHAN ÜNAL