Geri Dön

Pseudomonas aeruginosa'yı inhibe eden bakteriyofajların izole ve karakterize edilmesi ve tavuk etinde biyokoruyucu olarak kullanılma potansiyellerinin belirlenmesi

Isolation and characterization of bacteriophages inhibiting pseudomonas aeruginosa and determining their potential of utilization as bioprotective in chicken meat

  1. Tez No: 698466
  2. Yazar: NAZİFE YILMAZ
  3. Danışmanlar: PROF. DR. ZELİHA YILDIRIM
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Biyoteknoloji, Gıda Mühendisliği, Mikrobiyoloji, Biotechnology, Food Engineering, Microbiology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2021
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Niğde Ömer Halisdemir Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Gıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Gıda Mühendisliği Bilim Dalı
  13. Sayfa Sayısı: 158

Özet

Bu tez kapsamında, farklı illerden toplanan gıda örneklerinden Pseudomonas aeruginosa suşları izole edilmiş ve bu izolatlardan P. aeruginosa'ya özgü karakteristikler sergileyen 10 izolat, 16S rRNA bölgelerine göre tanımlanmıştır. Bakteriyofaj izolasyonu için farklı yerlerden örnekler toplanmış ve bakteriyofaj taraması yapılmıştır. Tarama sonucunda, 35 adet litik faj izole edilmiş ve konak hücre aralığı geniş olan iki tanesi seçilip karakteristik özellikleri belirlenmiştir. Taramalı elektron mikroskobuyla yapılan incelenme sonucunda, vB_Pae-K10 ve vB_Pae-K13 fajlarının Caudovirales takımından Siphoviridae familyasına ait oldukları belirlenmiştir. vB_PaeS-K10 fajının genom büyüklüğü, MOI değeri, latent periyodu, patlama süresi ve patlama büyüklüğünün sırasıyla 54,20 kb, 10, 75 dk, 30 dk ve 34,86 olduğu, vB_PaeS-K13 fajının ise 44,06 kb, 0,01, 20 dk, 35 dk ve 35,95 olduğu belirlenmiştir. Bu fajların her ikisinin de pH 3-12 değerleri arasında aktivitelerini tamamen koruduğu ve Ca+2 iyonlarının, her iki fajın konakçısına karşı absorbiyon oranını arttırdığı bulunmuştur. Litik aktivite testi, her iki fajın konak hücre yoğunluğunu 4 ve 37°C'de azalttığını göstermiştir. Faj vB_PaeS-K10 95°C'de 5, faj vB_PaeS-K13 ise 70°C'de 30 dakikalık ısıl işlem sonucunda aktivitesini tamamen kaybetmiştir. Ayrıca, vB_PaeS-K10 ve vB_PaeS-K13 fajlarının 4°C'de tavuk etinde P. aeruginosa'ya karşı çok kuvvetli enfektif etki gösterdiği ve dolayısıyla tavuk etinde biyokoruyucu olarak kullanma potansiyeline sahip olduğu belirlenmiştir.

Özet (Çeviri)

In this study, Pseudomonas aeruginosa strains were isolated from food samples collected from different provinces, and ten of these isolates exhibiting P. aeruginosa-specific characteristics were identified according to their 16S rRNA regions. For bacteriophage isolation, samples were collected from different places and bacteriophage screening was performed. 35 lytic phages were isolated and two of them with a wide host cell range were selected and their characteristics were determined. As a result of the examination with scanning electron microscopy, it was determined that vB_Pae-K10 and vB_Pae-K13 phages belong to the family Siphoviridae from the order Caudovirales. The genome size, MOI value, latent period, burst time, burst size of vB_PaeS-K10 phage are 54.20 kb, 10, 75 min, 30 min and 34.86 respectively, whereas those of vB_PaeS-K13 phage are 44.06 kb, 0.01, 20 min, 35 min and 35.95. Both of these phages completely preserved their activities between pH 3-12, and Ca2+ ions increased absorption rate of the phages against their hosts. Lytic activity test showed that both phages reduced host cell density at 4 and 37°C vB_PaeS-K10 and vB_PaeS-K13 phages lost completely their activities at 95°C after 5 min, and at 70°C after 30 min of heat treatment, respectively. In addition, it has been determined that vB_PaeS-K10 and vB_PaeS-K13 phages have a very strong infective effect against P. aeruginosa in chicken meat at 4°C and therefore have the potential to be used as bioprotective in chicken meat.

Benzer Tezler

  1. Pseudomonas ekzotoksin A ile ökaryotik elongasyon faktörü 2'nin (eEF-2) ADP-ribozilasyon mekanizmasının incelenmesi

    Investigation ADP-ribosylation mechanism of eukaryotic elongation factor 2 (eEF-2) with pseudomonas exotoxin A

    GKIOULSOUM ACHMET

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    BiyofizikTrakya Üniversitesi

    Biyofizik Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. AYHAN ÜNLÜ

  2. Novel biological materials for food and environmental applications

    Gıda ve çevre uygulamaları için yeni biyolojik malzemeler

    ÖZGÜN CANDAN ONARMAN UMU

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2012

    Biyoteknolojiİhsan Doğramacı Bilkent Üniversitesi

    Malzeme Bilimi ve Nanoteknoloji Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. TURGAY TEKİNAY

  3. Bazı Hypericum ve Achillea türlerinin antimikrobiyal ve antioksidant özelliklerinin araştırılması

    The antimicrobial and antioxidant activities of some Hypericum and Achillea species

    DENİZ BARIŞ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2004

    KimyaDicle Üniversitesi

    Kimya Ana Bilim Dalı

    PROF.DR. ÇETİN AYTEKİN

  4. Irak'ın Babylon kentindeki yanıklardan, yaralardan ve idrar yolu enfeksiyonu hastalarından izole edilen pseudomonas aeruginosa'nın moleküler tanımlanması ve virülans analizi

    Molecular identification and virulence analysis of pseudomonas aeruginosa isolated from burns, wounds and uti patients in Babylon, Iraq

    ZAINAB MOHAMMED NAJI AL-SHAMMARI

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2024

    BiyolojiÇankırı Karatekin Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. TARKAN YORULMAZ

  5. Farklı enfeksiyon kaynaklarından izole edilen pseudomonas aerugınosa izolatları arasındakı virülans genlerin moleküler ve biyokimyasal yöntemlerle tanımlanması

    Molecular and biochemical study of identification and detection of virulence genes among pseudomonas aeruginosa isolated from different infectious origins

    ABDULRAZZAQ JUMAAH HAMMAD HAMMAD

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    BiyolojiÇankırı Karatekin Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ İLKAY ÇORAK ÖCAL