Geri Dön

DNA spesifik probların kullanımı ile yapılan seks kromozom anomalilerinin araştırılması

Detection of structural sex chromosome aberrations by DNA specific probes

  1. Tez No: 69930
  2. Yazar: BİRSEN KARAMAN
  3. Danışmanlar: PROF. DR. SEHER BAŞARAN
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Tıbbi Biyoloji, Medical Biology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 1998
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: İstanbul Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Tıbbi Genetik Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 235

Özet

V. ÖZET Moleküler tekniklerle elde edilen belli DNA dizilerinin fluoresanlı maddelerle işaretlenerek kromozomlarla hibridizasyona sokulması esasına dayanan FISH tekniği, sitogenetik ile moleküler biyoloji arasında bir köprü oluşturmuştur. İnterfazda aneuploidilerin ve X'e bağlı hastalıklarda cinsiyetin hızlı tanınmasında, metafaz kromozomlarında ise, rutin bantlama yöntemlerinin yetersiz kaldığı durumlarda son derece faydalı ve güçlü bir yöntem olarak uygulanmakta, problann ve tekniklerin çeşitlenmesiyle klinik kullanım alam genişlemektedir. Bu çalışmada, çeşitli problann kullanımıyla FISH tekniği ile ilgili deneyimlerimizin artırılması ve bu tekniğin de novo yapısal anomalilerin aydınlatılmasındaki etkinliğinin araştırılması planlandı. Bu amaçla teknik, biyolojik özellikleri nedeniyle olası yapısal kromozom anomali çeşitlerinin tümünün görülebilir olması ve moleküler açıdan daha iyi incelenmiş olmalarına bağlı olarak ticari kullanıma sunulmuş prop çeşidinin çok oluşu nedenleriyle ilk aşamada X ve Y kromozomlarının de novo yapısal anomalilerinde uygulandı. Lichter ve Pinkel'in geliştirdiği FISH protokolü laboratuar koşullarına göre modifiye edildi ve Oncor ve Cytocell firmalarına ait işaretli hazır satellit, kozmid ve painting problar, çeşitli endikasyonlarla kromozom analizi yapılan ve X veya Y kromozomunda yapısal anomali saptanan 38 olguda kullanıldı. 199Bu çalışma kapsamında sentromerik DXZ1, Kallmann kozmid ve X painting probları kullanılarak 13 olguda görülmüş olan halka kromozomların X kromozomu kökenli olduğu saptandı. Dört olguda klasik bantlama yöntemleri ile saptanan X/otozom translokasyonu X kromozomuna ve ilgili otozom kromozoma özgü painting ve kozmid problar kullanılarak tanı doğrulandı. Bu çalışmada, multiprobların kullanımı ile dengesiz X/7 translokasyonu ve yine dengesiz olarak oluşan Y/9 translokasyonu taşıyan olgularda çok kısa sürüde tanı koyulmuş olması bu tekniğe yeni bir boyut kazandırmıştır. De novo yapısal kromozom anomalilerinde bu yöntem ile çok kısa sürede sonuca gidilebileceği görülmüştür. X p delesyonu olan 3 olguda ve X q delesyonu saptanan 5 olgudan 3'ünde FISH tekniği ile GTG bant analiz sonuçları doğrulandı. İki olguda ise, GTG analizlerinden farklı sonuçlar elde edildi. Bunlardan birisinde,X kromozomunun 9. kromozoma ait segmlent de içerdiği ( dengesiz X/9 translokasyonu), diğerinde ise X kromozomunda inversiyon - delesyon saptandı. Bu iki bulgunun da klasik bantlama yöntemleri ile tanınması olası değildi. Üç olguda X kromozomunun q kolunda görülen uzamaların 2 olguda izodisentrik kromozom Xq ve bir olguda Xq duplikasyonu, bir olgudaki X p kolu uzamasının ise, izodisentrik Xp olduğu belirlendi. 200İki olguda klasik bantlama yöntemleri ile 45,X'li hücrelerle birlikte görülen marker kromozomların Y kökenli izodisentrik kromozomlar olduğu belirlendi ve olgular mixed gonadal disgenezi tanısı aldı. Y kromozomunda inversiyon düşünülen 2 olgu ve Yp delesyonundan kuşkulanılan 2 olguda FISH uygulamaları ile bunların polimorfik bulgular olduğu saptandı. Bu çalışma, diagnostik amaçlı çalışan bütün sitogenetik laboratuarlarında klasik yöntemlerin yanısıra FISH tekniğinin de sitogenetik tanıda rutin olarak kullanılması gerektiğini göstermiştir. 'C YUKSOW, ın.u 201

Özet (Çeviri)

VI. SUMMARY Fluorescent in situ hybridization ( FISH) procedure relies on the complementarity between the 2 strands of the DNA double helix. Directly or indirectly labelled probe DNA molecules are denaturated and hybridized to denatureted nuclear target DNA so that unique sequences, chromosomal subregions or entire genomes are specifically highlighted in metaphase or interphase cells. Application of the FISH techniques to clinical diagnostik laboratories was made possible by the increasing availibility of numerous chromosome specific probes and FISH became an important addition to conventional cytogenetics because it similtaneously provides both molecular and cytogenetic results and bridges the gap between cytogenetic and molecular genetics. FISH has shown to be extremely useful in the analysis of metaphase chromosomes when conventional cytogenetic techniques remained insufficent in the determination of the marker and de novo structural abnormalities. In this study, FISH with centromeric, cosmid and painting probes from Oncor Inc. and Cytocell was applied to confirm and clarify GTG-banded interpretions of thirty-eight cases with X and Y de novo structural abnormalities. The ring chromosomes detected in 13 patients were found to be of X chromosomal origin by in situ hybridization with centromeric DXZ1, Kallmann with DXZ1 control region and X painting probes. 202In four cases, FISH using the X painting probe confirmed the presence of a balanced X-autosome translocation and the definite breakpoints were identified by application of cosmid probes. Two unbalanced X-autosome translocations involving chromosomes 7;X and 9;Y were detected by the hybridization of Multiprobe Chromoprobe to a single microscobe slide per patient which allowed the simultaneus analysis chromosomes. In six cases, FISH confirmed the presence of a deletion at Xp and Xq arms. However, two other cases which were interpretated as a having an Xq deletion according to GTG banding, were identified as an X-autosome translocation and an inversion-deletion. The cytogenetic analysis showed an Xq+ karyotype in three of our cases which were further evaluated by FISH and identified as an isodicentric Xq (n=2) and a duplication (n=l). In two cases, mosaic for 45,X/46,X,+mar cell lines, the origin of the marker chromosomes was identified as Y and these patients were diagnosed as having“mixed gonadal dysgenesis”. FISH studies demonstrated the presence of a polymorphism in four cases suspected with an inversion and a deletion on Yp arm. The present studies illustrates the need for the incorporation of FISH into the standard protocols of all diagnostic cytogenetic laboratories as a routine 203procedure. It is predicted that FISH will soon become a complementary routine procedure as commonplace as banding is today. 204

Benzer Tezler

  1. Tez No

    197582

    Development of QCM based DNA biosensors for detection of genetically modified organisms

    Genetiği değiştirilmiş organizmalar için işaretsiz saptama metodlarının geliştirilmesi

    İREM KARAMOLLAOĞLU

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2007

    BiyolojiOrta Doğu Teknik Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF.DR. HÜSEYİN AVNİ ÖKTEM

  2. Tez No

    866029

    Development of a selection protocol for target nucleic acids based on nanoparticles

    Nükleik asit hedeflerinde nanopartikul tabanlı seçim protokolü geliştirilmesi

    AYŞE PINAR AKALIN

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2024

    Biyoteknolojiİstanbul Teknik Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. AYTEN YAZGAN KARATAŞ

  3. Tez No

    286182

    Application of surface-enhanced raman scattering (SERS) method for genetic analyses

    Yüzeyde-güçlendirilmiş raman saçılması (YGRS) metodunun genetik analizler için uygulaması

    SEHER KARABIÇAK

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2011

    KimyaOrta Doğu Teknik Üniversitesi

    Kimya Bölümü

    PROF. DR. MÜRVET VOLKAN

    PROF. DR. SEMRA KOCABIYIK

  4. Tez No

    867055

    MMP13 ve MMP20 gen polimorfizmleri ile diş çürüğü ilişkisinin incelenmesi

    Evaluation of association between MMP13 and MMP20 gene polymorphisms with dental caries

    FUNDA ÇAĞIRIR DİNDAROĞLU

    Diş Hekimliği Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2016

    Diş HekimliğiEge Üniversitesi

    Çocuk Diş Hekimliği Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. NESRİN ERONAT

  5. Tez No

    387739

    Faktör II, faktör V Leiden ve MTHFR C677T mutasyonlarının tespitine yönelik multipleks real time PCR kit geliştirilmesi

    Developing multiplex real time PCR kit for detectoin of mutations of factor II, factor V and MTHFR C677T

    FUNDA KARATEKE

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2009

    Tıbbi BiyolojiCelal Bayar Üniversitesi

    Tıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. NURAY ALTINTAŞ

Geri Dön