Characterization of the SPOC regulatory function of BUD14
BUD14'ün SPOC mekanizmasını kontrol eden görevinin karakterizasyonu
- Tez No: 703442
- Danışmanlar: DR. ÖĞR. ÜYESİ AYŞE KOCA ÇAYDAŞI
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Biology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2021
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Koç Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 113
Özet
Ekmek mayası olarak da adlandırılan Saccharomyces cerevisiae, mitotik iğ ipliği oryantasyonun ve de bu oryantasyonun asimetrik hücre döngüsü üzerindeki etkilerini araştırmak için oldukça ideal bir organizmadır. Anne ve yavru hücrenin her birine eşit birer DNA kopyasının aktarılması için, ekmek mayasının mitotik iğ iplikleri polarite ekseninde hizalanmak zorundadır. İğ ipliği yönü kontrol noktası (SPOC) hücre dögüsünün ilerleyişini iğ ipliklerinin yanlış yönde hizalanmasına bağlı olarak durdurur. Bu mekanizmadaki sorunların hücrenin genomik kararlılığının bozulmasına ve de sonuç olarak poliploidi ve anöploidinin oluşmasına neden olduğu bilinmektedir. Buna bağlı olarak, bu kontrol noktası ploidinin doğru aktarımı için gereklidir. Ancak bu mekanizmanın tam anlamıyla nasıl çalıştığı bu zamana kadar aydınlatılamamıştır. Bu çalışmada, Bud14 proteininin bu mekanizmada görev alan bir protein olduğunu keşfettik. BUD14'ün yokluğunun mitozdan çıkış mekanizması bozulmuş hücrelerde büyümeyi teşvik etmesi bu proteinin mitozdan çıkışı engelleyen bir protein olduğunu göstermektedir. Ayrıca, BUD14'ü eksik olan hücrelerde SPOC mekanizmasının çalışmadığını ve buna bağlı olarak mitotik iğ ipliklerinin yanlış hizalanması durumunda bu kültürlerin çoklu çekirdekli fenotipte hücrelere sahip olduğunu gösterdik. Bulgularımız, Bud14'ün bu görevinin formine bağlı aktin polimerizasyonu görevine bağlı olmadığını kanıtlamaktadır. Bud14'ün mitotik hücre döngüsünü engelleyici görevini yapması için Glc7 ile etkileşmesi gerektiğini gösterdik çünkü Glc7'nin bu etkileşime sahip olmayan versiyonunun (glc7-12) da SPOC mekanizmasının bozulmasına neden olduğunu gözlemledik. Deneysel bulgularımız ışığında, Bud14-Glc7 kompleksinin Bfa1-Bub2 kompleksinin metafaz ve anafazda Mil Pole Gövde (SPB)'ye olan lokalizasyonunu sınırladığını gösterdik. Ayrıca, Bud14'ün iğ ipliklerinin yanlış hizalanması sonucunda yavru hücre korteksinden düştüğünü ve hücre boyunca yayıldığını gözlemledik. Bud14-Glc7 kompleksinin SPOC kinaz olan Kin4 üzerinde bir etkisinin olmadığını, aksine bu iki yolağın iğ ipliği yönüne bağlı olarak hücre döngüsünü engellemek için birbirlerine paralel olarak çalıştığını modelledik.
Özet (Çeviri)
Saccharomyces cerevisiae, also known as the budding yeast, is a commonly used model organism to study the orientation of mitotic spindle and its effects on asymmetric cell division. The mitotic spindle of budding yeast needs to be oriented in the mother-to-daughter polarity axis in order to segregate one copy of its genomic DNA to the daughter cell during the cell cycle. Spindle Position Checkpoint (SPOC) is a surveillance mechanism that inhibits the progression of cell cycle upon spindle mispositioning. Cells with deficient SPOC lose their genomic integrity, eventually resulting in multiploidy and aneuploidy. Therefore, SPOC is necessary for the maintenance of ploidy in budding yeast. However, so far it has not been completely enlightened how the SPOC mechanism functions. In this thesis, we showed that Bud14 is a novel component of SPOC. We showed that deletion of BUD14 promotes the growth of cells with impaired mitotic exit, indicating Bud14 is an inhibitor of mitotic exit. We demonstrated that bud14Δ cells are SPOC deficient, accumulating multinucleated cell populations in the presence of spindle misalignment. Our data showed that SPOC regulatory function of Bud14 is not dependent on its role in formin-dependent actin polymerization regulation. We identified that Bud14-Glc7 interaction is required for the mitotic exit inhibitory function of Bud14 because a temperature sensitive mutant version of Glc7 (glc7-12) that cannot bind to Bud14 resulted in SPOC deficiency in the presence of BUD14 upon spindle misalignment. Our data indicate that Bud14-Glc7 limits the SPB-bound levels of Bfa1-Bub2 complex in metaphase and anaphase. We identified that Bud14 falls off from the bud cortex, spreading through the cell during late anaphase. We showed that phosphatase Bud14-Glc7 and the SPOC kinase Kin4 have different and additive molecular roles in SPOC. We proposed a model in which Bud14-Glc7 complex acts on Bfa1 with a parallel pathway to Kin4 in order to block the cell cycle progression in response to spindle misorientation.
Benzer Tezler
- Characterization of the role of a novel mitotic exit inhibitor in S. cerevisiae
Yeni bir mitozdan çıkış inhibitörünün moleküler rolünün ekmek mayasında karakterizasyonu
DİLARA KOCAKAPLAN
Yüksek Lisans
İngilizce
2020
BiyolojiKoç ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ AYŞE KOCA ÇAYDAŞI
- Borlanmış AISI M35 ve AISI M42 çeliklerinin karakterizasyonu ve aşınma davranışlarının incelenmesi
Characterization of the boronized AISI M35 & M42 steels and investigation of the wear behavior
MEHMET KÜÇÜKKURT
Yüksek Lisans
Türkçe
2015
Metalurji MühendisliğiAfyon Kocatepe ÜniversitesiMetalurji ve Malzeme Mühendisliği Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. HALİL AYTEKİN
- Characterization of the potential smoothness of one-dimensional Dirac operator subject to general boundary conditions and its Riesz basis property
Genel sınır koşulları altındaki Dirac operatörünün potansiyelinin türevlenebilirliğinin ve Riesz bazı özelliğinin karakterizasyonu
İLKER ARSLAN
- Kartal Belediyesi sınırları içerisinde oluşan ambalaj atıklarının karakterizasyonu ve ekonomik analizi
Characterization of the packaging waste and economic analysis in Kartal Municipality borderland
LOKMAN GÜVENÇ
Yüksek Lisans
Türkçe
2016
Çevre Mühendisliğiİstanbul ÜniversitesiÇevre Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. HÜSEYİN KURTULUŞ ÖZCAN
- Seçici lazer ergitme yöntemi kullanılarak farklı üretim parametrelerinde üretilen Ti6Al4V alaşımının yapısal ve tribolojik özelliklerinin karakterizasyonu
Characterization of the structural and tribological properties of Ti6Al4V alloy produced in different production parameters using selective laser melting
GÜRKAN KAYA
Yüksek Lisans
Türkçe
2019
Makine MühendisliğiErzurum Teknik ÜniversitesiMakine Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. FATİH YILDIZ