Geri Dön

HPV pozitif bireylerde miR-519d, HPV16-miR-H1 ve DVL-1 ifadelerinin RT-PCR ile araştırılması

Investigation of miR-519d, HPV16-miR-H1 and DVL-1 expressions in HPV positive individuals by RT-PCR

PDF İndir

  1. Tez No: 705511
  2. Yazar: ASLIHAN ESRA BİLDİRİCİ
  3. Danışmanlar: DOÇ. DR. NİLGÜN ÇEKİN
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Tıbbi Biyoloji, Medical Biology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2021
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Sivas Cumhuriyet Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Tıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Tıbbi Biyoloji Bilim Dalı
  13. Sayfa Sayısı: 86

Özet

Rahim ağzı kanseri ya da servikal kanser, kadınlarda en sık görülen dördüncü kanser türü olup 2018'deki 570.000 yeni vakayla birlikte tüm kadın kanserlerinin %6,6'sını oluşturduğu tahmin edilmektedir. İnsan papilloma virüsü (human papillomavirus, HPV) enfeksiyonları, rahim ağzı kanserinin yerleşik nedenidir ve kadın ve erkeklerin çeşitli anatomik bölgelerindeki diğer kanserlerle de ilişkilidir. Ülkemizde HPV enfeksiyonuyla ilgili çalışmalar belirli gruplarda ve sınırlı popülasyonlarda yapıldığından gerçek prevelansı belirlemek zordur, ancak %2-6 arasında olduğu tahmin edilmektedir. Epigenetik mekanizmalardan miRNA'ların, virüs-konak ilişkisinde ve virüs patogenezinde etkili olduğu bilinmektedir. HPV ile insan ve virüs-kodlu miRNA'lar, bu miRNA'ların hedef genleri ve yer aldıkları sinyalizasyon yolakları arasındaki ilişkilerin aydınlatılması hastalığın tanı ve tedavisine yönelik yenilikçi yaklaşımlar getirebilir. Kromozom 19 kümesinde yer alan miR-519d, çeşitli kanserlerde farklı genleri hedefleyerek hem tümör baskılayıcı hem de onkogenik özellikler gösterir. Bununla birlikte, rahim ağzı kanseri gelişiminde ve ilerlemesindeki desteği ve HPV suşlarıyla olan etkileşimi yapılan bazı çalışmalara rağmen hala bilinmezliğini korumaktadır. Hem DNA hem de RNA virüsleri, viral yaşam döngülerinin lehine, hücresel miRNA'ları degrade edecek, azaltacak ya da artıracak mekanizmalar geliştirmiştir. Bu mekanizmalardan biri de virüs kodlu miRNA'lardır. HPV-kodlu miRNA'ların işlevine dair araştırmalar hala devam etmektedir. Kalıcı yüksek riskli HPV enfeksiyonu hücresel dönüşümde çok önemli bir olaydır, ancak malign fenotipi tamamlamak için çoklu hücresel sinyalizasyon yolaklarının da dahil olduğu ek olaylar gerekir. Bazı çalışmalarda HPV'nin transformasyon aktivitesinden sorumlu olan proteinlerin Wnt/β- katenin yolağının düzenlenmesine dahil olduğu gösterilmiştir. Wnt/β-katenin yolağının ana elemanlarından biri olan Dvl-1, Wnt sinyallerinin β-katenine dönüştürülmesine katılır ve daha sonra down-stream efektör genleri aktive eder. Hem kan hem de servikal hücrelerde karşılaştırılabilir bir ifadeye sahip güvenilir bir miRNA ve mRNA panelinin belirlenmesi, yüksek riskli grupların etkin bir şekilde izlenmesini sağlayacaktır. Bu nedenle bu çalışmada, farklı servikal lezyonları olan kadınlardan alınan sitolojik örneklerde, konağa ve virüse ait miRNA'ların ve Wnt/β-katenin yolağı elemanlarından birinin mRNA seviyesinde ekspresyonlarının karakterize edilmesi ve bunların servikal kanser ve HPV enfeksiyonları için tanı/tedavi biyomarkerları olarak etkisinin değerlendirilmesi hedeflenmiştir. Örneklerden total RNA izolasyonu yapılmış ve daha sonra Real Time-PCR kullanılarak bu miRNA'ların ifade düzeylerine bakılmıştır. Yapılan son ifade analizleri ve istatistiksel değerlendirmeler sonucunda hem kan hem de smear örneklerinde, hasta grubunun kontrol grubu ile kıyaslanması sonucu, miR-519d ifadesi azalırken (fold change sırasıyla; 0,07 kat ve 0,024 kat) Dvl-1 ifadesinde artış (fold change sırasıyla; 1,76 kat ve 2,09 kat) gözlenmiştir. Hem kan hem de smear örnekleri için miR-519d ifadesindeki azalış istatistiksel olarak anlamlıyken (sırasıyla; p=0,0125 ve p=0,04), Dvl-1 ifadesindeki artış istatistiksel öneme sahip değildir (sırasıyla; p=0,51 ve p=0.31). Aynı genler, HPV-pozitif bireyden alınan hasta-sağlıklı doku örneklerinde de karşılaştırılmıştır ve hem miR-519d hem de Dvl-1 geni, hasta dokularda sağlıklı doku örneklerine göre azalış göstermiştir (fold change sırasıyla; 0,79 kat ve 0,41 kat). Her iki gen için de bu azalma miktarları istatistiksel olarak anlamlı bulunmamıştır (sırasıyla; p=0,99 ve p=0.05). HPV kodlu miRNA ekspresyonu için hasta grubunun Cq değerleri kendi içinde; HPV tipine ve CIN seviyelerine göre değerlendirilmiştir. Karşılaştırma sonuçlarına göre; HPV16-miR-H1'in kan örneklerindeki ortalama Cq değerleri smear örneklerine göre daha yüksektir, yani HPV16-miR-H1 kan örneklerinde daha düşük ekspresyon göstermektedir. Kan ve smear örnekleri arasındaki bu farklılık istatistiksel olarak da anlamlı bulunmuştur (p=0.009). Hasta ve sağlıklı dokular arasında yapılan kıyaslamaya göre ise Cq değerleri hasta doku örneklerinde istatistiksel olarak anlamlı derecede düşük gözlenmiştir (p

Özet (Çeviri)

Cervical cancer is the fourth most common cancer in women and is estimated to account for 6.6% of all female cancers, with 570.000 new cases in 2018. Human papillomavirus (HPV) infections are an established cause of cervical cancer and are also associated with other cancers in various anatomical regions of men and women. Since studies on HPV infection in our country are carried out in certain groups and limited populations, it is difficult to determine the true prevalence, but it is predicted to be between 2-6%. It is known that miRNAs, one of the epigenetic mechanisms, are effective in virus-host relationship and virus pathogenesis. Clarifying the relationships between HPV and human- and virus-encoded miRNAs, the target genes of these miRNAs and the signaling pathways in which they are involved may bring innovative approaches to the diagnosis and treatment of the disease. MiR-519d, located in the chromosome 19 cluster, displays both tumor supressör and oncogenic properties by targeting different genes in various cancers. However, its support in the development and progression of cervical cancer and its interaction with HPV strains still rmain unknown despite some studies. Both DNA and RNA viruses have evolved mechanisms to degrade, decrase or increase cellular miRNAs in favor of their viral life cycle. One of these mechanisms is virus-encoded miRNAs. Research into the function of HPV-encoded miRNAs is still ongoing. Persistent high-risk HPV infection is a pivotal event in cellular transformation, but additional events, including multiple cellular signaling pathways, are required to complement the malignant phenotype. In some studies, it has been shown that the proteins responsible for the transformation activity of HPV are involved in the regulation of the Wnt/β-catenin pathway. One of the key elements of the Wnt/β-catenin pathway, Dvl-1, participate in the conversion of Wnt signals to β-catenin and then activates down-stream effector genes. Identifying a relibale panel of miRNA and mRNA with comparable expression in both blood and cervical cells will enable effective monitoring of high-risk groups. Therefore, in this study, levels of host and viral miRNA and one of the Wnt/β-catenin pathway elements and their effects as diagnostic/therapeutic biomarkers for cervical cancer and HPV infections were evaluated in cytological samples from women with different cervical lesions. Total RNA was isolated from the samples and then the expression levels of these miRNAs were examined using Real Time-PCR. As a result of the final expression analyzes and statistical evaluations, in both blood and smear samples, when the patient group was compared with the control group, the expression of miR-519d decreased (fold change; 0.07-fold and 0.024-fold, respectively) and Dvl-1 expression increased (fold change; 1.76-fold and 2.09-fold). For both blood and smear samples, while the decrase in miR-519d expression was statistically significant (p=0,0125 and p=0.04, respectively) the increase in Dvl-1 expression was not statistically significant (p=0.51 and p=0.31, respectively). The same genes were also compared in patient and healthy tissue samples from HPV-positive individuals, and both miR-519d and Dvl-1 genes were decreased in patient tissues compared to healthy tissue samples (fold change; 0.79-fold and 0.41-fold, respectively). These reduction were not statistically significant for both genes (p=0.99 and p=0.05, respectively). For HPV-encoded miRNA expression, Cq values of the patinet group evaluated according to HPV type and CIN levels. According to the comparison results; the mean Cq values of HPV16-miR-H1 in blood samples are higher than in smear samples, that is HPV16-miR-H1 shows lower expression in blood samples. This difference between blood and smear samples was also statistically significant (p=0.009). According to the comparison made between patient and healthy tissues, Cq values were found to be statistically significantly lower in patient tissue samples (p

Benzer Tezler

  1. Tez No

    863070

    Servikal intraepitelyal neoplazi tanılı hastalarda yüksek riskli HPV persistansı olan ve olmayan gruplarda farklı mikroRNA değerlerinin karşılaştırılması

    Comparison of different micrRNA levels in patientsdiagnosed with cervical ntraepithelial neoplasia (CIN)with and without high-risk HPV persistence

    AYŞENUR AKKOÇ

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2024

    GenetikPamukkale Üniversitesi

    Kadın Hastalıkları ve Doğum Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. DERYA KILIÇ

  2. Tez No

    194213

    Human papıllomavırus (HPV) pozitif bireylerde dna onarım kapasitesinin ve genotoksik etkinin araştırılması

    Investigation of dna repair capacity and genotoxic effects in human papillomavirus (HPV) positive individuals

    EREN (CİVELEK) ÖZÇAĞLI

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2007

    Eczacılık ve FarmakolojiGazi Üniversitesi

    Farmasötik Toksikoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. SEMRA ŞARDAŞ

  3. Tez No

    453821

    Kronik bor etkisinde kalan ve kalmayan kadınların eksfoliye serviks hücrelerinde mikronükleus sıklığının karşılaştırılması

    Comparing frequency of micronucleus in women exfoli̇ate cervi̇cal cells affecti̇ng and unaffecti̇ng from chroni̇c boron

    HATİCE YILDIRIM

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2014

    Tıbbi BiyolojiCelal Bayar Üniversitesi

    Tıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MEHMET KORKMAZ

  4. Tez No

    805005

    Servikal smear örneklerinden tespit edilen human papilloma virüs genotiplerinin sitolojik bulgularla birlikte değerlendirilmesi

    Evaluation of human papilloma virus genotypes detected from cervical smear samples with cytological findings

    ZEYNEP SAY

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    MikrobiyolojiAtatürk Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MUHAMMET HAMİDULLAH UYANIK

  5. Tez No

    617211

    İnsan bağışıklık eksikliği virusu (HIV) ile infekte kişilerde insan pegiviruslarının (HPgV) sıklığının ve genotip çeşitliliğinin araştırılması

    Investigation of frequency and genotype diversity of human pegiviruses (HPgV) in people infected with human immunodeficiency virus (HIV)

    EBRU YÜCEBAĞ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2020

    Mikrobiyolojiİstanbul Üniversitesi-Cerrahpaşa

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. KENAN MİDİLLİ

Geri Dön