Bazı ftalonitril bileşiklerinin yapısal ve spektral özelliklerinin DFT yöntemiyle analizi ve doking çalışmaları
DFT analysis of structural and spectral properties of some phthalonitrile compounds and docking studies
- Tez No: 706798
- Danışmanlar: DR. ÖĞR. ÜYESİ ÜMİT YILDIKO
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyokimya, Biyomühendislik, Biyoteknoloji, Biochemistry, Bioengineering, Biotechnology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2022
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Kafkas Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyomühendislik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 75
Özet
Fitalonitril bileşiklerinin son zamanlarda popüler olmasından ötürü bu bileşiklerin araştırılması gerektiği fikrine odaklanıldı. İki farklı fitalonitril bileşiği seçildi ve literatüre kazandırılmak üzere bu bileşikler üzerinde moleküler modelleme çalışmaları gerçekleştirildi. İlk olarak, Gaussian 09 programında DFT ve TD-DFT hesaplamaları için her bir molekül ChemBioDraw'da çizildi ve Chem3D programı ile SYBL2 (mol2) yöntemi ile minimize edildi. Minimize edilmiş moleküller Gaussian 09 programına verilmiş ve her yapı için DFT hesaplamaları (Geometri optimizasyonu, HOMO-LUMO, dipol moment hesaplamaları, MEPS haritaları, mulliken atomik yükleri ve NBO analizi) yapıldı. Ayrıca bu bölümde ftalonitril grubuna ait iki bileşik için ADME analizi gerçekleştirildi ve renk bölgeleri ayrı ayrı sunuldu. Son olarak moleküler doking çalışmaları iki bileşik için ayrı ayrı üç farklı enzimle (AchE, BchE, α-GLY) gerçekleştirildi ve doking puanları ile reseptör modellemeleri sunuldu.
Özet (Çeviri)
Since phthalonitrile compounds have become popular lately, the focus has been on the idea that these compounds should be investigated. Two different phthalonitrile compounds were selected and molecular modeling studies were carried out on these compounds to be brought to the literature. First, for the DFT and TD-DFT calculations in Gaussian 09 program, each molecule was drawn in ChemBioDraw and minimized with the SYBL2 (mol2) method with the Chem3D program. Minimized molecules were given to the Gaussian 09 program and DFT calculations (Geometry optimization, HOMO-LUMO, dipole moment calculations, MEPS maps, mulliken atomic charges and NBO analysis) were performed for each structure. In addition, in this section, ADME analysis was performed for two compounds belonging to the phthalonitrile group and the color regions were presented separately. Finally, molecular docking studies were performed for two compounds separately with three different enzymes (AchE, BchE, α-GLY), and docking scores and receptor models were presented.
Benzer Tezler
- Alkil ftalodinitril türevlerinin sentezi ve ftalosiyaninlerinin hazırlanması
Synthesis of the alkylphthalodinitrile derivatives and phthalocyanines
HATİCE AKIN DİNÇER
Doktora
Türkçe
2005
Kimyaİstanbul Teknik ÜniversitesiDOÇ.DR. ESİN HAMURYUDAN
PROF.DR. MAKBULE BURKUT KOÇAK
- Yeni sübstitüe ftalosiyaninlerin sentezi ve özelliklerinin incelenmesi
The Synthesis and properties of new substituded pathalocyanines
SÜLEYMAN GÜRSOY
- Yeni tip periferal ve nonperiferal tiyazol sübstitüye metaloftalosiyaninler
A new type peripherally and nonperipherally thiazol substituted soluable phthalocyanines
EMİNE GÜLRUH DURUK
- Carborane and metallocarborane functionalized phthalocyanines
Karboran ve metalokarboran fonksiyonlu ftalosyaninler
ILGIN NAR
- Suda çözünür kuaterner amin türevli tetra sübstitüe metalli ftalosiyaninlerin sentezi
Synthesis of water-soluble tetra substituted metallophthalocyanines derived with quaternary amine
BETÜL HİKMETUMUT
Yüksek Lisans
Türkçe
2017
Kimyaİstanbul Teknik ÜniversitesiKimya Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ESİN HAMURYUDAN
