Geri Dön

Hücre selex yöntemiyle intraselüler adhezyon molekülü-1 (ICAM-1)'e özgü DNA aptamerlerinin belirlenmesi

Development of DNA aptamers against ICAM-1

PDF İndir

  1. Tez No: 707241
  2. Yazar: BERKE BİLGENUR KANDEMİR ŞENER
  3. Danışmanlar: DR. ÖĞR. ÜYESİ CEREN BAYRAÇ
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Biyomühendislik, Bioengineering
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2021
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Karamanoğlu Mehmetbey Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyomühendislik Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Biyomühendislik Bilim Dalı
  13. Sayfa Sayısı: 136

Özet

Kanser dünyada ve ülkemizde ölüm nedenleri arasında ikinci sıradadır. Birçok kanser bağlantılı ölüm ise metastaz kaynaklıdır. Birçok kanser hücresi tipinin yüzeyinde ifade edilen hücrelerarası tutunma molekülü-1'in (ICAM-1) tümör hücrelerinin tutunması, invazyonu ve göçünde rol oynadığı gösterilmiştir. Bu çalışmada, hücre SELEX yöntemi ile ICAM-1(+) CHO-ICAM-1 hücreleri kullanılarak ICAM-1'e karşı DNA aptamerleri geliştirilmiştir. Onuncu SELEX döngüsü sonunda elde edilen SELEX havuzu dizilenmiş ve içlerinden en çok zenginleşen beş dizi seçilmiştir. Bu beş dizi sekanslanıp ICAM-1(+) CHO-ICAM-1, ICAM-1(−) MIA PaCa-2 ve ICAM-1(+) MCF 7 hücrelerine bağlanma davranışları ve afiniteleri bakımından karakterize edilmiştir. Bunun yanında, dizilerin göç ve invazyonu engelleyebilme yetenekleri de test edilmiştir. Beş potansiyel aptamer dizisinin hem CHO ICAM-1 hem de MCF 7 hücrelerine özgün olarak bağlandığı görülmüş olup CHO ICAM-1 hücrelerine 18,2 ile 38,2 nM aralığındaki yüksek Kd değerleri ile bağlandığı tespit edilmiştir. Bunların arasından 3 aptamer dizisi ise CHO ICAM-1 hücrelerinin hem göç hem de invazyonunda en az %61 oranında inhibisyon sağlamıştır. Sonuçlar göstermektedir ki seçilen aptamer dizileri yüzeyinde ICAM-1 ifade eden kanser hücrelerini spesifik olarak tanıyıp bağlanabilmekte ve ICAM-1 bağıntılı etkileşimleri engelleyerek dolaşımdaki kanser hücrelerinin göç ve invazyonunu engelleyebilme potansiyeli sağlamaktadır.

Özet (Çeviri)

Cancer is the second leading cause of death worldwide and in Turkey. Most of the cancer-related deaths result from metastasis. As expressed on the surface of various cancer cell types, intercellular adhesion molecule-1 (ICAM-1) has been shown to play a role in the attachment, invasion and migration of tumor cells. In this study, DNA aptamers were generated against ICAM-1 by cell-SELEX method using ICAM-1(+) CHO-ICAM-1 cells. The pool obtained at the end of the 10th round of SELEX was sequenced and the most enriched sequences were characterized for their binding behaviors and affinities to ICAM-1(+) CHO-ICAM-1, ICAM-1(−) MIA PaCa-2 and ICAM-1(+) MCF 7 cells. Moreover, the inhibition abilities of sequences on migration and invasion were measured. The five aptamer sequences were obtained selectively binding to both CHO-ICAM-1 cells and MCF 7 cells. Binding to CHO ICAM-1 cells resulted with high Kd values ranging from 18.2 to 38.2 nM. Three of these aptamers showed inhibition in both migration and invasion of CHO-ICAM-1 cells at least 61%. All these results suggested that these aptamers have potential to detect specifically ICAM-1 expressing tumor cells and inhibit migration and invasion by blocking ICAM-1 related interactions of circulating tumor cells.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    421103

    Synthesis of copper zinc tin sulfide CZT(S,Se) with solution based method and formation and characterization of CZT(S,Se) thin films for photovoltaic application

    Solüsyon yöntemiyle CZTS sentezi ve fotovoltaik devreler için CZTS ince film oluşturma ve film özelliklerini inceleme

    RIDVAN ERĞUN

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2015

    Enerjiİstanbul Teknik Üniversitesi

    Nanobilim ve Nanomühendislik Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. ELİF ÜLKÜ ARICI

  2. Tez No

    774767

    Dexpanthenol'ün prostat kanseri üzerindeki apoptotik etkilerinin araştırılması

    Investigation of apoptotic effects of dexpanthenol on prostate cancer

    SELEN SOYTORUN YETKİNEL

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    Eczacılık ve FarmakolojiÇukurova Üniversitesi

    Tıbbi Farmakoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. FATMA PEYMAN ERTUĞ

  3. Tez No

    538762

    Aronia melanocarpa uygulamasının epiteliyal ovaryum kanseri hücre hattı skov-3 üzerine immünositokimyasal ve apoptotik etkilerinin incelenmesi

    Investigation of immunocytochemical and apoptotic effects of aronia melanocarpa application on epithelial ovarian cancer cell line skov-3

    SİNEM KARA

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    Histoloji ve Embriyolojiİzmir Katip Çelebi Üniversitesi

    Histoloji ve Embriyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. SELEN BAHÇECİ

  4. Tez No

    448914

    İdiyopatik trombositopenik purpura (itp)'lı hastalarda serum ıl-17 ve mononükleer dna hasarının araştırılması

    Investigation of serum il-17 and mononuclear dna damage in patients with idiopathic trombocytopenic purpura (itp)

    İSMAİL DUSAK

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2014

    BiyokimyaHarran Üniversitesi

    Biyokimya Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. ŞAHBETTİN SELEK

    PROF. DR. NURTEN AKSOY

  5. Tez No

    675776

    Büyüme hormonu salgılatıcı hormona [GHRH (1-44)] özgü X-aptamerlerin sentezlenmesi, karakterizasyonu ve anti-karsinojenik etkilerinin araştırılması

    Synthesis, characterisation and investigation of anti-carcinogenic effects of x-aptamers against growth hormone releasing hormone [GHRH (1-44)]

    BURCU AYHAN ŞAHİN

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2021

    Biyolojiİstanbul Kültür Üniversitesi

    Moleküler Biyokimya ve Genetik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. AJDA ÇOKER GÜRKAN

Geri Dön