Hücre selex yöntemiyle intraselüler adhezyon molekülü-1 (ICAM-1)'e özgü DNA aptamerlerinin belirlenmesi
Development of DNA aptamers against ICAM-1
- Tez No: 707241
- Danışmanlar: DR. ÖĞR. ÜYESİ CEREN BAYRAÇ
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Biyomühendislik, Bioengineering
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2021
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Karamanoğlu Mehmetbey Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyomühendislik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Biyomühendislik Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: 136
Özet
Kanser dünyada ve ülkemizde ölüm nedenleri arasında ikinci sıradadır. Birçok kanser bağlantılı ölüm ise metastaz kaynaklıdır. Birçok kanser hücresi tipinin yüzeyinde ifade edilen hücrelerarası tutunma molekülü-1'in (ICAM-1) tümör hücrelerinin tutunması, invazyonu ve göçünde rol oynadığı gösterilmiştir. Bu çalışmada, hücre SELEX yöntemi ile ICAM-1(+) CHO-ICAM-1 hücreleri kullanılarak ICAM-1'e karşı DNA aptamerleri geliştirilmiştir. Onuncu SELEX döngüsü sonunda elde edilen SELEX havuzu dizilenmiş ve içlerinden en çok zenginleşen beş dizi seçilmiştir. Bu beş dizi sekanslanıp ICAM-1(+) CHO-ICAM-1, ICAM-1(−) MIA PaCa-2 ve ICAM-1(+) MCF 7 hücrelerine bağlanma davranışları ve afiniteleri bakımından karakterize edilmiştir. Bunun yanında, dizilerin göç ve invazyonu engelleyebilme yetenekleri de test edilmiştir. Beş potansiyel aptamer dizisinin hem CHO ICAM-1 hem de MCF 7 hücrelerine özgün olarak bağlandığı görülmüş olup CHO ICAM-1 hücrelerine 18,2 ile 38,2 nM aralığındaki yüksek Kd değerleri ile bağlandığı tespit edilmiştir. Bunların arasından 3 aptamer dizisi ise CHO ICAM-1 hücrelerinin hem göç hem de invazyonunda en az %61 oranında inhibisyon sağlamıştır. Sonuçlar göstermektedir ki seçilen aptamer dizileri yüzeyinde ICAM-1 ifade eden kanser hücrelerini spesifik olarak tanıyıp bağlanabilmekte ve ICAM-1 bağıntılı etkileşimleri engelleyerek dolaşımdaki kanser hücrelerinin göç ve invazyonunu engelleyebilme potansiyeli sağlamaktadır.
Özet (Çeviri)
Cancer is the second leading cause of death worldwide and in Turkey. Most of the cancer-related deaths result from metastasis. As expressed on the surface of various cancer cell types, intercellular adhesion molecule-1 (ICAM-1) has been shown to play a role in the attachment, invasion and migration of tumor cells. In this study, DNA aptamers were generated against ICAM-1 by cell-SELEX method using ICAM-1(+) CHO-ICAM-1 cells. The pool obtained at the end of the 10th round of SELEX was sequenced and the most enriched sequences were characterized for their binding behaviors and affinities to ICAM-1(+) CHO-ICAM-1, ICAM-1(−) MIA PaCa-2 and ICAM-1(+) MCF 7 cells. Moreover, the inhibition abilities of sequences on migration and invasion were measured. The five aptamer sequences were obtained selectively binding to both CHO-ICAM-1 cells and MCF 7 cells. Binding to CHO ICAM-1 cells resulted with high Kd values ranging from 18.2 to 38.2 nM. Three of these aptamers showed inhibition in both migration and invasion of CHO-ICAM-1 cells at least 61%. All these results suggested that these aptamers have potential to detect specifically ICAM-1 expressing tumor cells and inhibit migration and invasion by blocking ICAM-1 related interactions of circulating tumor cells.
Benzer Tezler
- Synthesis of copper zinc tin sulfide CZT(S,Se) with solution based method and formation and characterization of CZT(S,Se) thin films for photovoltaic application
Solüsyon yöntemiyle CZTS sentezi ve fotovoltaik devreler için CZTS ince film oluşturma ve film özelliklerini inceleme
RIDVAN ERĞUN
Yüksek Lisans
İngilizce
2015
Enerjiİstanbul Teknik ÜniversitesiNanobilim ve Nanomühendislik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ELİF ÜLKÜ ARICI
- Dexpanthenol'ün prostat kanseri üzerindeki apoptotik etkilerinin araştırılması
Investigation of apoptotic effects of dexpanthenol on prostate cancer
SELEN SOYTORUN YETKİNEL
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
Eczacılık ve FarmakolojiÇukurova ÜniversitesiTıbbi Farmakoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. FATMA PEYMAN ERTUĞ
- Aronia melanocarpa uygulamasının epiteliyal ovaryum kanseri hücre hattı skov-3 üzerine immünositokimyasal ve apoptotik etkilerinin incelenmesi
Investigation of immunocytochemical and apoptotic effects of aronia melanocarpa application on epithelial ovarian cancer cell line skov-3
SİNEM KARA
Yüksek Lisans
Türkçe
2019
Histoloji ve Embriyolojiİzmir Katip Çelebi ÜniversitesiHistoloji ve Embriyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. SELEN BAHÇECİ
- İdiyopatik trombositopenik purpura (itp)'lı hastalarda serum ıl-17 ve mononükleer dna hasarının araştırılması
Investigation of serum il-17 and mononuclear dna damage in patients with idiopathic trombocytopenic purpura (itp)
İSMAİL DUSAK
Yüksek Lisans
Türkçe
2014
BiyokimyaHarran ÜniversitesiBiyokimya Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ŞAHBETTİN SELEK
PROF. DR. NURTEN AKSOY
- Büyüme hormonu salgılatıcı hormona [GHRH (1-44)] özgü X-aptamerlerin sentezlenmesi, karakterizasyonu ve anti-karsinojenik etkilerinin araştırılması
Synthesis, characterisation and investigation of anti-carcinogenic effects of x-aptamers against growth hormone releasing hormone [GHRH (1-44)]
BURCU AYHAN ŞAHİN
Doktora
Türkçe
2021
Biyolojiİstanbul Kültür ÜniversitesiMoleküler Biyokimya ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. AJDA ÇOKER GÜRKAN