Geri Dön

Miyeloproliferatif neoplazilerde JAK2 ve JAK2V617F MRNA hedefli nanopartikül uygulamasının cgas-sting yolağına etkilerinin araştırılması

Effects of JAK2 and JAK2V617F MRNA targeting nanoparticule application on CGAS-sting pathway in myeloproliferative neoplasms

PDF İndir

  1. Tez No: 707597
  2. Yazar: BERKAY TOKCAN
  3. Danışmanlar: DOÇ. DR. SELÇUK SÖZER TOKDEMİR
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Genetik, Genetics
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2021
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: İstanbul Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Genetik Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 84

Özet

Çalışmada miyeloproliferatif neoplaziler ile özdeşleşmiş JAK2V617F mutasyonu varlığında, bir sitozolik DNA tespit sinyal yolağı olan cGAS-STING yolağının etkinliğinin araştırılması amaçlanmıştır. Bu amaçla JAK2V617F mutasyonu taşıyan HEL ve SET2 hücre hatları ile yabani tip JAK2'ye sahip K562 hücre hattında, cGAS-STING yolağı, mutant ve yabani tip JAK2 mRNA'sıyla eşleşerek çift zincirli yapıların oluşmasını sağlayan Nanoflare partikülleriyle uyarıldı. Nanopartiküllerle farklı sürelerde muamele edilmiş hücrelerde, cGAS-STING ve JAK-STAT yolaklarıyla ilişkili genlerin anlatımları gerçek zamanlı kantitatif PZR uygulamasıyla test edildi. Çalışmada cGAS, STING, TBK1, IRF3, TLR9, JAK2, STAT1 ve STAT2 genlerinin anlatımları her üç hücre hattında incelendi. HEL ve SET2 hücrelerine nanopartiküllerle yapılan uyarım sonucu test edilen genlerin anlatımlarında değişimler gözlendi. K562 hücre hattında ise değişimlerin sınırlı olduğu gözlendi. Gen anlatımlarının kısa süreli inkübasyonlarda, yarım saatlik dilimlerde değişkenlik gösterdiği gözlendi. Genel olarak mutant JAK2 mRNA'sına özgü nanopartiküllerin cGAS-STING yolağındaki genlerin anlatımını yabani tipe göre daha yüksek seviyelere çıkardığı gözlendi. Bu sonuçlar nanopartiküller ile mutant JAK2 mRNA'sının bloklanmasının cGAS-STING yolağının aktivasyonunu pozitif yönde etkilediğini göstermiş oldu. Bu durum MPN'lerde sürekli aktif halde olan JAK2 proteinin cGAS-STING yolağında baskılayıcı etkisinin göstergesi olarak yorumlandı.

Özet (Çeviri)

In this study, it was aimed to investigate the activity of cGAS-STING cytosolic DNA detection pathway in presence of JAK2V617F mutation which is one of the indicator mutations of myleproliferative neoplams. With this purpose, HEL and SET2 cell lines carrying JAK2V617F and K562 cell line possessing wild type JAK2, were stimulated with Nanoflare particles that form double stranded structures by matching JAK2 and JAK2V617F mRNAs. The expressions of genes related with cGAS-STING and JAK-STAT pathways were analised with real time PCR in cell lines which were incubated with Nanoflares for various time. The expressions of cGAS, STING, TBK1, IRF3, TLR9, JAK2, STAT1 ve STAT2 genes were investigated all three cell lines. Expression changes were observed for tested genes in HEL and SET2 as result of nanoparticle application. Limited expression changed was observed in K562 cell line. In short termed incubations variable expression values were observed with in half hour periods. In general, the expressions of cGAS-STING pathway genes were reached higher values for mutant nanoparticles than wild type ones. This result showed that the blockage of mutant JAK2 mRNA affected cGAS-STING pathway positively. This situation might be the result of suppresive effect of continuously active JAK2 on cGAS-STING pathway.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    820255

    Miyeloproliferatif neoplazilerde eksozom kompleksinin rolünün incelenmesi

    The investigation of the role of exosome complex in myeloproliferative neoplasms

    ESRA NUR DEMİRTAŞ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    Genetikİstanbul Üniversitesi

    Genetik Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. SELÇUK SÖZER TOKDEMİR

  2. Tez No

    352478

    Miyeloproliferatif neoplazilerde (MPN) JAK2 ve MPL gen mutasyonlarının patoloji arşiv materyalleri kullanılarak saptanmasında yeni nesil dizileme teknolojilerinin yeri

    The role of next generation sequencing technologies of detecting JAK2 and MPL gene mutations with using pathology archieve materials in myeloproliferati ve neoplasms

    ŞENAY BOYACIGİL

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2013

    GenetikAnkara Üniversitesi

    Temel Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. IŞINSU KUZU

  3. Tez No

    789681

    BCR-ABL negatif kronik miyeloproliferatif neoplazi alt tiplerinde edinsel von willebrand hastalığı sıklığı ve alt tiplere göre karşılaştırılması

    Frequency of acquired von willebrand disease in BCR-ABL negative chronic myeloproliferative neoplasia subtypes and comparison by subtypes

    BEYZA SOYLU USLU

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    HematolojiSağlık Bilimleri Üniversitesi

    İç Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ÖMÜR TABAK

    UZMAN DİLEK KESKİN

  4. Tez No

    828454

    Miyeloproliferatif neoplazilerde trombotik yolağın araştırılması

    Miyeloproliferatif neoplazilerde trombotik yolağin araştirilmasi

    İLDENİZ USLU BIÇAK

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    Genetikİstanbul Üniversitesi

    Genetik Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. SELÇUK SÖZER TOKDEMİR

  5. Tez No

    443998

    Miyeloproliferatif neoplazilerde gen ekspresyon değişimleri

    Gene expression changes in myeloproliferative neoplasms

    İLDENİZ USLU

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2016

    Genetikİstanbul Üniversitesi

    Genetik Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. SELÇUK SÖZER TOKDEMİR

Geri Dön