Liriomyza sativae Blanchard, 1938 (Diptera: Agromyzidae)'nin DNA barkodlaması
DNA barcoding of Liriomyza sativae Blanchard agromyzidae, 1938 (Diptera: Agromyzidae)
- Tez No: 709229
- Danışmanlar: PROF. DR. EYYÜP MENNAN YILDIRIM
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoteknoloji, Ziraat, Biotechnology, Agriculture
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2022
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Aydın Adnan Menderes Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Tarımsal Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 51
Özet
Amaç: Bu çalışmada Aydın ilinin Koçarlı ve İncirliova ilçelerinden toplanan Agromyzidae familyasına ait Liriomyza sativae'nin erginlerinden DNA dizisi elde edilerek barkodlamasının yapılması amaçlanmıştır. Materyal ve Yöntem: Çalışma alanından toplanan galerili yapraklar laboratuvarda kültüre alınarak ergin çıkışı sağlanmıştır. Daha sonra örneklerin tür teşhisi yapıldıktan sonra laboratuvarda DNA izolasyonu yapılmıştır. Örneklerin COI gen bölgesinin çoğaltılması için HCO ve LCO evrensel primerleri kullanılmıştır. Çoğaltılan bölgenin DNA dizilimi elde edildikten sonra filogenetik analiz Mega 10 programı vasıtasıyla yapılmıştır. Sonuç: Çalışmanın sonucunda toplamda 612 bç COI bölgesi elde edilmiştir. Çalışmadaki her bir örneğe ait COI DNA dizileri ayrı ayrı NCBI Blast'a girilerek veri tabanına kayıtlı Liriomyza spp. ile benzerlik oranları karşılaştırılmıştır. İnceleme sonucu türlerin L. sativae ve L. trifolii olduğu saptanmıştır. Tarama sonuçları incelendiğinde; L. sativae'de %99-100 arasında sonuç verdiği, L. trifolii'de ise %97-99 arasında sonuç verdiği gözlemlenmiştir. Her bir örnek için NCBI kod numarası alınarak yükleme işlemi gerçekleştirilmiştir. Diziler Mega10 programına aktarılarak filogenetik ilişkileri belirlenmiştir.
Özet (Çeviri)
Objective: In this study, it was aimed to obtain the DNA sequence from the adults of Liriomyza sativae belonging to the Agromyzidae family collected from Koçarlı and Incirliova districts of Aydın province and to barcode them. Material and Methods: The leaves with galleries collected from the field were brought culture in the laboratory and the adult emergence was achieved. Then, after the species identification of the samples was made, DNA isolation was made in the laboratory. Universal primers HCO and LCO were used for amplification of the COI gene region of the samples. After obtaining the DNA sequence of the replicated region, phylogenetic analysis was performed by the Mega 10 program. Results: As a result of the study, a total of 612 bp COI regions were obtained. The COI DNA sequences of each sample in the study were entered into the NCBI Blast separately and the similarity rates were compared with the Liriomyza spp. registered in the database. As a result of the examination, it was determined that the species were L. sativae and L. trifolii. When the scan results are examined; It was observed that it gave results between 99-100% in L. sativae, and between 97-99% in L. trifolii. The loading process was performed by taking the NCBI GenBank code number for each sample. The sequences were transferred to the Mega10 program and their phylogenetic relationships were determined.
Benzer Tezler
- Antakya ve çevresinde bulunan yaprak galeri sineklerinin (Diptera: Agromyzidae) morfolojileri, sistematikleri ve kısa biyolojileri
The Morphology, systematics and biology of leaf miner fly (Diptera: Agromyzidae) found in Antakya and its vicinity
ERSİN DEMİREL
Yüksek Lisans
Türkçe
2002
BiyolojiMustafa Kemal ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF.DR. MİKTAT DOĞANLAR
- Seferihisar ilçesinde organik üretimi yapılan şevketi bostan (Scolymus hispanicus L.) bitkisinde görülen zararlılar üzerine bir araştırma
A research on pests which are observed on organic producted blessed thistle (Scolymus hispanicus L.) in Seferihisar
BİLGE KARADAĞ
- Agromyzidae (Diptera) familyasına bağlı ekonomik öneme sahip türlerin Türkiye'deki dağılışları üzerine araştırmalar
Surveys on the economical important species belonging to family Agromyzidae (Diptera) in Turkey
OKTAY DURSUN
Yüksek Lisans
Türkçe
2008
BiyolojiMuğla ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. HASAN SUNGUR CİVELEK
- İzmir İlinde bulunan agromyzidae (Diptera) familyasına bağlı türler üzerinde sistematik araştırmalar
Systematic studies on the species of the family agromyzidae (Diptera) in İzmir Province
HASAN SUNGUR CİVELEK
- Yaprak galerisineği, liriomyza trifolii (burgess) (dip.; agromyzidae)'nin parazitoiti diglyphus isaea (walker) (hym.; eulophidae)'nın biyolojisi, konukçu-parazitoit ilişkileri ve sera koşullarında etkinliği üzerind..
Investigation on biology, parasitoid-host relationship and efficacy of releasing greenhouse conditions of diglyphus isaea (walker) (hym.; eulophidae), parasitoid of leafminer liriomyza trifolii (burgess) ...
ASUMAN ULUBİLİR