Modeling and analyzing a patch of human red blood cell by coarse-grained particle method
İnsan kırmızı kan hücresinin bir parçasının katı parçacık metoduyla modellenmesi ve analizi
- Tez No: 726013
- Danışmanlar: PROF. DR. YALİNG LİU
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Makine Mühendisliği, Mechanical Engineering
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2019
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Lehigh University
- Enstitü: Yurtdışı Enstitü
- Ana Bilim Dalı: Makine Mühendisliği Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Makine Mühendisliği Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: 58
Özet
Bu tez üç bölümden oluşmaktadır. İlk olarak, kırmızı kan hücresiyle ilgili bazı temel ve teorik bilgiler verilmiştir. Sonrasında ise kırmızı kan hücresi parçaçığının moneküler dinamik katı parçacık modeli oluşturulmuştur. Son olarak, kırmızı kan hücresinin bir parçasının bazı mekanik özellikleri olarak; difüzyon, geçirgenlik, gerginlik, parçalanma ve kayma-gerilimi etkisindeki gözenek alanı değişimi incelenmiştir. Oluşturulan kırmızı kan hücresi parçasının doğrulanması, geçirgenliğin modellenmesi ve difüzyon katsayısının sabit olarak belirlenmesi ile sağlanmıştır. Ardından, kırmızı kan hücresinin katı parçacık modeli eşit oranda uygulanan kuvvet ile parçalanana kadar çekilmiştir. Elde edilen kritik germe/gerilme simülasyon sonuçları, lazer metoduyla optik olarak çekme işlemiyle deneysel olarak sağlanan sonuçlarla eşlenmiştir. Son olarak, kırmızı kan hücresinin yüksek stresli gözenek alanları, bu deformasyon sonucuyla belirlenmiştir. Kırmızı kan hücresi membranının oluşturulmasındaki amaç, hesaplama maliyetini düşürmeyi, istenilen dış kuvvet şartlarında detaylı ve kesin sonuçlar elde etmeyi ve bazı özelliklerin nano-ölçekten makro-ölçeğe taşınmasını zaman ve boyut arasındaki uyuşmazlığı çözerek sağlamaktır.
Özet (Çeviri)
This thesis consists of three sections. First, some background information and theories about the erythrocyte membrane are provided. Second, a coarse-grained molecular dynamics model for a patch of erythrocyte membrane is built up. Third, the mechanical responses of the patch of red blood cells to diffusion and diffusivity, tension, rupture, and shear-induced pore area are analyzed. The patch of erythrocyte membrane is validated by modeling diffusivity and determining the diffusion coefficient constant. Then, the patch of the coarse-grained erythrocyte membrane is stretched uniformly until rupture. The critical stress/strain from simulation match with those obtained in experiments in laser optical tweezers trapping a bead. Lastly, the pore area of the patch of erythrocyte membrane at the high-stress region is determined over a range of deformations. The purpose of creating the patch of erythrocyte membrane is to reduce computational cost, obtain accurate and detailed answers from our interested regime conditions, and transfer some quantities from nanoscale to mesoscale by solving time and length scale gaps.
Benzer Tezler
- Arazi kullanım değişimlerinin peyzaj teori ve modellemesi kapsamında incelenmesi
Investigation of land use-land cover change, and modeling the landscape change
MELİZ AKYOL ALAY
Doktora
Türkçe
2016
Peyzaj Mimarlığıİstanbul Teknik ÜniversitesiPeyzaj Mimarlığı Ana Bilim Dalı
PROF. DR. HAYRİYE EŞBAH TUNÇAY
- Hava kirliliği konusunda çevre bilgi sistemi tasarımı ve gerçekleştirilmesi pilot projesi
Design of an information system about air pollution
HARUN İYİDİKER
- Türk inşaat sektöründe 4 boyutlu (4D) modellemenin uygulanabilirliği
Applicability of 4D modeling in turkish construction industry
EMRE GÖKYİĞİT
Yüksek Lisans
Türkçe
2014
Bilim ve Teknolojiİstanbul Teknik Üniversitesiİnşaat Mühendisliği Ana Bilim Dalı
ÖĞR. GÖR. MURAT KURUOĞLU
- Addressing parametric uncertainties in autonomous cargo ship heading control
Otonom kargo gemisi yön kontrolündeki parametrik belirsizliklerin ele alınması
AHMAD IRHAM JAMBAK
Yüksek Lisans
İngilizce
2023
Mekatronik Mühendisliğiİstanbul Teknik ÜniversitesiMekatronik Mühendisliği Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. İSMAİL BAYEZİT
- Safety based decision support systems for marine structures
Deniz yapıları için güvenlik tabanlı karar destek sistemleri
EMRE KORAY GENÇSOY
Yüksek Lisans
İngilizce
2016
Denizcilikİstanbul Teknik ÜniversitesiGemi İnşaatı ve Gemi Makineleri Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ŞEBNEM HELVACIOĞLU