Geri Dön

Patolojik tanısı 'belirsiz sitoloji' olan tiroit nodüllerinde yeni nesil dizi analizi tabanlı hedefe yönelik somatik mutasyon analizi

Next generation sequence-based targeted somatic mutation analysis in thyroid nodules with pathologically diagnosed as 'indeterminate cytology'

PDF İndir

  1. Tez No: 746855
  2. Yazar: GİZEM KÖK KILIÇ
  3. Danışmanlar: DOÇ. DR. EMİN KARACA
  4. Tez Türü: Tıpta Uzmanlık
  5. Konular: Endokrinoloji ve Metabolizma Hastalıkları, Genetik, Onkoloji, Endocrinology and Metabolic Diseases, Genetics, Oncology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2022
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Ege Üniversitesi
  10. Enstitü: Tıp Fakültesi
  11. Ana Bilim Dalı: Tıbbi Genetik Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 130

Özet

Amaç: Tiroit nodülleri toplumda yaygın görülen bir sorunu temsil eder. Saptanan tiroit nodüllerine yaklaşımda en önemli aşama malignite riskinin tespitidir. Bunun için hastaya ait risk faktörleri, fizik muayene, ultrasonografi gibi nodüle ait ipuçlarının toplanması gereklidir. İİAB, nodüllerin sitopatolojik incelemesine olanak sağlar. Sitopatolojik olarak belirsiz grupta kalan nodüllere yaklaşım klinik pratikteki önemli zorluklardan birini oluşturur. Bu örneklerin moleküler profillemesi son dönemde öne çıkan seçeneklerdendir. Çalışmamızda belirsiz sitolojiye sahip nodüllerin moleküler analizi yapılarak; klinik pratikte malign-benign ayrımına katkı sağlaması ve klinik yönetime yardımcı olacak belirteçlerin araştırılması hedeflenmiştir. Gereç ve Yöntem: Çalışmamıza 20 adet belirsiz sitolojiye sahip tiroit nodül aspirasyon örneği dahil edildi. Örnekler ameliyat kararı verilmiş hastalara aitti ve cerrahi patoloji sonucu mevcuttu. Örneklerin moleküler profillemesinde, 67 geni içeren bir yeni nesil dizileme paneli kullanıldı. Analiz sonuçları cerrahi patolojik veriler altın standart kabul edilerek kıyaslandı. Kullanılan yöntemin sensitivite, spesivite, PPV ve NPV değerleri belirlendi. Bulgular: Analiz sonucunda 20 örnekten 10 tanesinde 6 farklı gene (BRAF, NRAS, PTEN, TERT, PIK3CA, TP53) ait Tier 1 veya Tier 2 varyant saptandı. Çalışmaya dahil edilen 15 örneğin cerrahi patoloji sonucu malign, 5 örneğin ise benigndi. Malign patolojiye sahip örneklerin 10 tanesi tiroidin papiller karsinomu, 5 tanesi ise tiroidin papiller mikrokarsinomu idi. Bir hastaya lenf nodu metastazı eşlik etmekteydi (Evre IVA), bir hastanın tümör çapı 4 cm'den büyüktü (Evre III) ve bir hastanın ise 2.2 cm idi (Evre II). Varyant saptanan 9 hastanın patoloji sonucu malign, bir hastanın ise benigndi. Varyant saptanan hastaların yaş ortalaması 56 iken, varyant saptanmayan grubun 46 idi. Testte NPV: %40, PPV: %90, Spesivite: %60, Sensitivite: %80 olarak hesaplanmıştır. Sonuç: Tüm örneklere ait aspirasyon materyalinden elde edilen DNA çalışma için yeterli olmuştur. Elde edilen moleküler belirteçler ile en az 9 hastada İİAB girişimi tekrarı gerekmeden yönetim doğru şekilde yapılabilirdi. Çalışmada kullanılan test dahil etme testi (rule-in) olarak, özellikle 45 yaş üstü hastalarda, yararlı olabilir. Çalışma belirsiz sitolojiye sahip nodüllerin yönetiminde giderek geçerlilik kazanan moleküler testlerin, klinik pratikteki faydasının altını çizmektedir. Ülkemizdeki ilk çalışma olarak sonraki çalışmalara öncülük etmesi hedeflenmiştir.

Özet (Çeviri)

Objective: Thyroid nodules represent a common problem in the population. The most crucial step following the detection of a thyroid nodule is to estimate the malignancy risk. For this, it is essential to collect clues about the nodule by investigating the risk factors of the patient, performing a physical examination, and ultrasonography. FNAB allows the examine the nodule's cytopathological characters. The approach to the nodules with indeterminate cytology is still challenging in daily practice. Molecular profiling has recently become one of the promising options. In our study; somatic mutation analysis was performed on nodules with indeterminate cytology. It aims to help identify nodule characters as malign or benign and search for markers to will help clinical management. Materials and Methods: Aspiration samples from 20 thyroid nodules with indeterminate cytology were included in our study. The specimens belonged to patients who had undergone surgery, and because of that, surgical pathology results were available. A next-generation sequencing panel containing 67 genes was used to molecularly profile the samples. The results were compared with the pathology of surgery material data, which is accepted as the gold standard. Sensitivity, specificity, PPV, and NPV were calculated. Results: The study detected variants of 6 different genes (BRAF, NRAS, PTEN, TERT, PIK3CA, TP53) in 10 of 20 samples. Surgical pathology results of 15 samples were malignant and 5 samples were benign. The malignant pathology consisted of 10 PTCs and 5 PMCs. One patient had lymph node metastasis (Stage IVA), one patient had a tumor of 4.2 cm (Stage III), and one had a tumor of 2.2 cm (Stage II). There were nine malignant and one benign surgical pathology in the patient group with variants. The mean age of the samples with variants was 56, and 46 in the non-variant group. The test was calculated as NPV: 40%, PPV: 90%, specificity: 60%, sensitivity: 80%. Conclusion: All samples were able to obtain a sufficient amount of DNA for the study. According to the detected molecular markers, at least 9 patients could have been managed correctly without the need for a repeat FNAB. This study underlines the practical clinical utility of molecular tests in the management of nodules with indeterminate cytology. Hence it is the first study about the molecular markers in thyroid nodules in our country, it is aimed to lead the following studies.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    702652

    Medüller tiroid karsinomunun erken teşhisine yönelik nodüler tiroid hastalığı olan hastalarda rutin kalsitonin taraması yapılmalı mıdır?

    For early detection of medullary thyroid carcinoma should routine calcitonin screening be performed in patients with nodular thyroid disease?

    RUGIYYA ZEYNALOVA

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2021

    İç HastalıklarıDokuz Eylül Üniversitesi

    İç Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    PROF. TEVFİK DEMİR

  2. Tez No

    571877

    Takip sırasında malignite saptanan benign tiroid nodüllerinde risk faktöleri

    Risk factors in benign thyroid nodules determined withmalignancy during follow-up

    HATİCE SÜMEYRA ÖZÜER GÜNEŞ

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    Aile HekimliğiSağlık Bilimleri Üniversitesi

    Aile Hekimliği Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. SERKAN SARI

    UZMAN KIVILCIM ULUSAN

  3. Tez No

    426491

    Bethesda sistemi temelinde tiroid aspirasyon sitoloji tanıları ile cerrahi tiroidektomilerin histopatolojik tanılarının korelasyonu

    Throid aspiration cytology diagnosis on the basis of Bethesda system and correlation of histopathologic diagnosis with surgical thyroidectomy

    MEHMET BERATİ KALELİOĞLU

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2016

    PatolojiGaziosmanpaşa Üniversitesi

    Tıbbi Patoloji Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. AKGÜL ARICI

  4. Tez No

    556595

    Meme karsinomlu hastalarda saptanan tiroit nodüllerinin sitomorfolojik analizi ve adjuvan tedavi ajanlarının sitolojik etkisinin araştırılması

    Cytomorphological assessment of thyroid nodules in breast cancer patients and analysis of adjuvant treatment options' effects on thyroid nodules

    KEREM ÖZCAN

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    Patolojiİstanbul Üniversitesi-Cerrahpaşa

    Patoloji Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ ŞEBNEM BATUR

  5. Tez No

    881804

    Papiller benzeri nükleer özelliklere sahip non-invaziv foliküler tiroid neoplazmı (NIFTP) tanılı olgularda ince iğne aspirasyon materyallerinin sitomorfolojik analizi ve sitolojik-histopatolojik korelasyonu

    Cytomorphological analysis of fine needle aspiration materials and cytological-histopathological correlation in cases diagnosed with non-invasive follicular thyroid neoplasm with papillary-like nuclear features (NIFTP)

    LAMAN SAMADOVA

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2024

    Patolojiİstanbul Medeniyet Üniversitesi

    Tıbbi Patoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. HATİCE ŞENELDİR

Geri Dön