SARS-CoV-2 PCR negatif hastalarda diğer solunum yolu viruslarının retrospektif değerlendirilmesi
Retrospective evaluation of other respiratory tract viruses in SARS-CoV-2 PCR negative patients
- Tez No: 751664
- Danışmanlar: PROF. DR. ALİ AĞAÇFİDAN
- Tez Türü: Tıpta Uzmanlık
- Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2022
- Dil: Türkçe
- Üniversite: İstanbul Üniversitesi
- Enstitü: Tıp Fakültesi
- Ana Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Viroloji ve Temel İmmünoloji Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: 44
Özet
Amaç: Mart 2020-Mart 2021 tarihleri arasında COVID-19 klinik ön tanısı ile İstanbul Üniversitesi (İÜ), İstanbul Tıp Fakültesi Viroloji ve Temel İmmunoloji Bilim Dalı laboratuvarına gönderilen, SARS-CoV-2 PCR testi negatif çıkan klinik örneklerde moleküler tanı yöntemi gerçek zamanlı RT-PCR kullanılarak diğer solunum yolu viruslarının araştırılması amaçlanmıştır. Gereç ve yöntemler: COVID-19 tanısı, İstanbul Üniversitesi (İÜ), İstanbul Tıp Fakültesi Viroloji ve Temel İmmunoloji Bilim Dalı COVID-19 laboratuvarında Bio-Speedy Viral Nükleik Asit İzolasyon kiti ve Bio-Speedy COVID-19 RT-qPCR Tespit Kiti kullanılarak konmuştur. COVID-19 negatif örneklerde diğer solunum yolu virusları, İÜ. İstanbul Tıp Fakültesi Viroloji ve Temel İmmunoloji Bilim Dalı Moleküler Biyoloji Laboratuvarında multipleks gerçek zamanlı RT-PCR yöntemi ile Fast Track FTD Respiratory pathogens 21 kiti kullanılarak Rotor Gene Q Real-Time PCR (Qiagen, Hilden, Germany) cihazında yapılmıştır. Bulgular: SARS-CoV-2 PCR testi negatif 397 hastadan 52'sinde diğer solunum yolu virusları pozitif bulunmuştur. Diğer solunum yolu virusları pozitif 52 hastadan 35'i (%67) rinovirus (RV) pozitif, 6'sı (%11) koronovirus (Cov) OC43, NL63, 229E, HKU1 pozitif, 2'si (%4) adenovirus (AV) pozitif, 2'si (%4) respiratuvar sinsitiyel virus (RSV) pozitif, 1'i (%2) enterovirus (EV) pozitif, 1'i (%2) insan metapnömovirus (İMPV) pozitif, 1'i (%2) parainfluenza-4 (PİV-4) pozitif, 4'ü (%8) koenfeksiyon (RV+RSV, RV+AV, RV+ insan bokavirusu (İBoV), RSV+CoV 229E) pozitif olarak saptanmıştır. İnfluenza virus (İV), PİV-1, PİV-2, PİV-3, insan parechovirus (İpeV) saptanmamıştır. Sonuç: Maske, mesafe, el yıkama, izolasyon gibi koruyucu önlemlerin solunum yolu viruslarının yayılımını önemli ölçüde azalttığı sonucuna varılmıştır.
Özet (Çeviri)
Objective: It was aimed to investigate other respiratory tract viruses by molecular diagnosis method real-time RT-PCR in clinical samples with negative SARS-CoV-2 PCR test, which were sent to Istanbul University (IU), Istanbul Medical Faculty, Department of Virology and Basic Immunology laboratory between March 2020 and March 2021 with the clinical pre-diagnosis of COVID-19. Materials and methods: The diagnosis of COVID-19 was made using the Bio-Speedy Viral Nucleic Acid Isolation kit and the Bio-Speedy COVID-19 RT-qPCR Detection Kit in the COVID-19 laboratory of Istanbul University (IU), Istanbul Medical Faculty, Department of Virology and Basic Immunology. Other respiratory tract viruses in COVID-19 negative samples were detected in Rotor Gene Q Real-Time PCR (Qiagen, Hilden, Germany) device using Fast Track FTD Respiratory pathogens 21 kit with multiplex real-time RT-PCR method in Istanbul University (IU), Istanbul Medical Faculty, Department of Virology and Basic Immunology,Molecular Biology Laboratory. Results: Other respiratory tract viruses were detected positive in 52 of 397 patients with negative SARS-CoV-2 PCR test. From 52 patients positive for other respiratory tract viruses, 35 (67%) were rhinovirus (RV) positive, 6 (11%) coronavirus (Cov) OC43, NL63, 229E, HKU1 positive, 2 (4%) adenovirus (AV) positive, 2 (4%) respiratory syncytial virus (RSV) positive, 1 (2%) enterovirus (EV) positive, 1 (2%) human metapneumovirus (HMPV) positive, 1 (2%) parainfluenza virus-4 (PIV-4) positive, 4 (8%) coinfection (RV+RSV, RV+AV, RV + human bocavirus (HboV), RSV+CoV 229E) were positively detected. Influenza (IV), PIV-1, PIV-2, PIV-3, human parechovirus (HpeV) were not detected. Conclusion: It was concluded that protective measures such as masks, distance, hand washing and isolation significantly reduced the spread of respiratory viruses.
Benzer Tezler
- COVİD 19 pandemi döneminde diğer solunum yolu patojenlerinin araştırılması
Investigation of other respiratory tract pathogens in the COVİD 19 pandemic period
MERVE DEMİR ÇEVİK
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2022
MikrobiyolojiSağlık Bilimleri ÜniversitesiMikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. BANU BAYRAKTAR
- COVİD-19 pandemisi döneminde üst solunum yolu enfeksiyonu semptomları olan hastalarda diğer patojenlerin tespitinin önemi ile influenza ve RSV oranları
The importance of detection for other pathogens in patients with upper respiratory infection symptoms and the rate of influenza and RSV during the COVİD-19 pandemic
MAHMUT ALTAŞ
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2021
İlk ve Acil YardımSağlık Bilimleri ÜniversitesiAcil Tıp Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ ÖZLEM TATAROĞLU
- COVİD-19 tanısı ile Hacettepe Üniversitesi erişkin hastanesinde izlenen hastaların hastalık ile ilgili risk algıları ve yaşam tarzı değişikliği planlarının değerlendirilmesi
Evaluation of disease-related risk perceptions and lifestyle change plans of patients followed up at Hacettepe University adult hospital with the diagnosis of COVİD-19
KAMIL ZARNISHANOV
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2021
İç HastalıklarıHacettepe Üniversitesiİç Hastalıkları Ana Bilim Dalı
PROF. DR. GÜLAY SAİN GÜVEN
DR. ÖĞR. ÜYESİ NURSEL ÇALIK BAŞARAN
- 2018-2021 yılları arasında hastanemiz yoğun bakım ünitelerinden gönderilen kan kültürü ve alt solunum yolu örneklerinden izole edilen gram negatif bakterilerin antibiyotik duyarlılık verileri ve direnç profiline COVİD-19 pandemisinin etkisi
The effect of the COVİD-19 pandemic on the antibiotic susceptibility data and resistance profile of gram-negative bacteria isolated from blood cultures and lower respiratory tract samples sent from the intensive care units of OUR hospital between 2018-2021
DİDEM ÖZKAN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2023
MikrobiyolojiSağlık BakanlığıTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. AYFER BAKIR
- COVID-19 hastalarında toraks BT'de tanımlanan vasküler dilatasyon işaretinin hematolojik ve biyokimyasal parametreler ile ilişkisi
Relationship of vascular dilatation sign defined in thoracic CT and hematological and biochemical parameters in COVID-19 patients
KENAN KADİRLİ
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2021
Radyoloji ve Nükleer TıpSağlık Bilimleri ÜniversitesiRadyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. FATMA SİBEL BAYRAMOĞLU