Geri Dön

Development of a bioanalytical method for rapid and efficient N-glycan analysis of therapeutic proteins by mass spectrometric methods

Kütle spektrometrik yöntemlerle terapötik proteinlerin hızlı ve etkili N-glikan analizi için biyoanalitik bir yöntemin geliştirilmesi

  1. Tez No: 752011
  2. Yazar: ZIDAN MASOUD EMHAMED RAGOUBI
  3. Danışmanlar: Assist. Prof. Dr. HACI MEHMET KAYILI, PROF. DR. BEKİR SALİH
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyokimya, Biyomühendislik, Biyoteknoloji, Biochemistry, Bioengineering, Biotechnology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2022
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: Karabük Üniversitesi
  10. Enstitü: Lisansüstü Eğitim Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyomedikal Mühendisliği Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Biyomedikal Mühendisliği Bilim Dalı
  13. Sayfa Sayısı: 59

Özet

Glikozilasyon, birçok hücresel olayda aktif rol oynayan translasyon sonrası bir modifikasyondur. Aynı zamanda proteinlerin birçok fonksiyonunu da düzenler. Monoklonal antikor (mAb) türevi ilaçlar birçok hastalığın tedavisinde kullanılmaktadır ve glikosilasyon, geliştirilen bu tür ilaçların aktivitesini etkiler. Öte yandan, bazı hastalıklarda N-glikanlar değişebilir. Bu nedenle, N-glikosilasyon profillemesi için hızlı ve verimli biyoanalitik yöntemlere ihtiyaç vardır. Çalışmada, glikoproteinlerin basit ve hızlı N-glikosilasyon profillemesi için entegre bir aşamalı uç uygulaması geliştirilmiştir. Tüm glikoproteomik ve glikomik numune hazırlama adımlarını bir aşama ucuna entegre ederek, hızlı ve ucuz bir N-glikosilasyon profili oluşturması sağlandı. Entegre kademeli ucun glikomik yaklaşımı, N-glikan profil oluşturma süresini 2 günden yaklaşık 2,5 saate düşürür. Ayrıca, immünoglobulin G (IgG) N-glikopeptidlerin doğrudan insan plazmasından profilinin çıkarılmasına da izin verir. Ek olarak, N-glikozilasyon profili, glikopeptit seviyesinde güçlü katyon değişimi (SCX) gibi sorbentler C18 veya diğerleri olmadan geliştirilen yöntemde yapılabilir.

Özet (Çeviri)

Glycosylation process is a post-translational modification, which plays an active critical role in many cellular events. It also regulates many functions of proteins. Monoclonal antibody (mAb)-derived drugs are used in the treatment of many diseases, and glycosylation affects the activity of such drugs developed. On the other hand, N-glycans may change in certain diseases. Therefore, rapid and efficient bioanalytical methods are needed for N-glycosylation profiling. In the study, an integrated stage-tip application was developed for simple and rapid N-glycosylation profiling of glycoproteins. By integrating all glycoproteomic and glycomic sample preparation steps into a stage-tip, a fast and inexpensive N-glycosylation profiling was ensured. The glycomic Approach of integrated stage-tip reduces the N-glycan profiling time from 2 days to Approximately 2.5 hours. It also allows profiling of immunoglobulin G (IgG) N-glycopeptides directly from human plasma. In addition, N-glycosylation profiling can be done in the developed method without sorbents C18 or others, such as strong-cation exchange (SCX) at the glycopeptide level.

Benzer Tezler

  1. Development of a new bioanalytical method for mass spectrometric analysis of glycopeptides using hydrophilic interaction-based sorbents

    Hidrofilik etkileşime dayalı sorbentler kullanılarak glikopeptitlerin kütle spektrometrik analizi için yeni bir biyoanalitik yöntemin geliştirilmesi

    ABDULBASİT RAMADAN ALMAHDİ ALTOUMİ

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2022

    BiyokimyaKarabük Üniversitesi

    Biyomedikal Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. HACI MEHMET KAYILI

    PROF. DR. BEKİR SALİH

  2. Glikopeptitlerin kütle spektrometrik analizleri için yeni bir biyoanalitik yöntem geliştirilmesi ve insan C1-inhibitör proteininin ayrıntılı bölgeye özgü glikozilasyon analizinin gerçekleştirilmesi

    Development of a novel bioanalytical method for mass spectrometric analysis of glycopeptides and achieving in-depth site specific glycosylation analysis of human C1-inhibitor

    HACI MEHMET KAYILI

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2016

    BiyoteknolojiHacettepe Üniversitesi

    Kimya Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. BEKİR SALİH

  3. Development of a sandwich-type dna array platform for the detection of label-free oligonucleotide targets

    İşaretsiz hedef oligonükleotidlerin tayini için sandviç tabanlı DNA dizi platformunun geliştirilmesi

    SENA CANSIZ

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2010

    BiyoteknolojiOrta Doğu Teknik Üniversitesi

    Biyoteknoloji Bölümü

    PROF. DR. HÜSEYİN AVNİ ÖKTEM

    YRD. DOÇ. DR. CAN ÖZEN

  4. HPLC floresan dedektör kullanılarak poliaminlerin serumda saptanması için metot geliştirme ve validasyonlarının yapılması

    Method development and validation for detection of polyamines in serum by using HPLC fluorescence detector

    ORHAN ÇAKAN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2018

    Biyokimyaİstanbul Medipol Üniversitesi

    Tıbbi Biyokimya Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. TÜRKAN YİĞİTBAŞI