Development of a bioanalytical method for rapid and efficient N-glycan analysis of therapeutic proteins by mass spectrometric methods
Kütle spektrometrik yöntemlerle terapötik proteinlerin hızlı ve etkili N-glikan analizi için biyoanalitik bir yöntemin geliştirilmesi
- Tez No: 752011
- Danışmanlar: Assist. Prof. Dr. HACI MEHMET KAYILI, PROF. DR. BEKİR SALİH
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyokimya, Biyomühendislik, Biyoteknoloji, Biochemistry, Bioengineering, Biotechnology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2022
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Karabük Üniversitesi
- Enstitü: Lisansüstü Eğitim Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyomedikal Mühendisliği Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Biyomedikal Mühendisliği Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: 59
Özet
Glikozilasyon, birçok hücresel olayda aktif rol oynayan translasyon sonrası bir modifikasyondur. Aynı zamanda proteinlerin birçok fonksiyonunu da düzenler. Monoklonal antikor (mAb) türevi ilaçlar birçok hastalığın tedavisinde kullanılmaktadır ve glikosilasyon, geliştirilen bu tür ilaçların aktivitesini etkiler. Öte yandan, bazı hastalıklarda N-glikanlar değişebilir. Bu nedenle, N-glikosilasyon profillemesi için hızlı ve verimli biyoanalitik yöntemlere ihtiyaç vardır. Çalışmada, glikoproteinlerin basit ve hızlı N-glikosilasyon profillemesi için entegre bir aşamalı uç uygulaması geliştirilmiştir. Tüm glikoproteomik ve glikomik numune hazırlama adımlarını bir aşama ucuna entegre ederek, hızlı ve ucuz bir N-glikosilasyon profili oluşturması sağlandı. Entegre kademeli ucun glikomik yaklaşımı, N-glikan profil oluşturma süresini 2 günden yaklaşık 2,5 saate düşürür. Ayrıca, immünoglobulin G (IgG) N-glikopeptidlerin doğrudan insan plazmasından profilinin çıkarılmasına da izin verir. Ek olarak, N-glikozilasyon profili, glikopeptit seviyesinde güçlü katyon değişimi (SCX) gibi sorbentler C18 veya diğerleri olmadan geliştirilen yöntemde yapılabilir.
Özet (Çeviri)
Glycosylation process is a post-translational modification, which plays an active critical role in many cellular events. It also regulates many functions of proteins. Monoclonal antibody (mAb)-derived drugs are used in the treatment of many diseases, and glycosylation affects the activity of such drugs developed. On the other hand, N-glycans may change in certain diseases. Therefore, rapid and efficient bioanalytical methods are needed for N-glycosylation profiling. In the study, an integrated stage-tip application was developed for simple and rapid N-glycosylation profiling of glycoproteins. By integrating all glycoproteomic and glycomic sample preparation steps into a stage-tip, a fast and inexpensive N-glycosylation profiling was ensured. The glycomic Approach of integrated stage-tip reduces the N-glycan profiling time from 2 days to Approximately 2.5 hours. It also allows profiling of immunoglobulin G (IgG) N-glycopeptides directly from human plasma. In addition, N-glycosylation profiling can be done in the developed method without sorbents C18 or others, such as strong-cation exchange (SCX) at the glycopeptide level.
Benzer Tezler
- Tiyazol-ferrosen ile modifiye edilmiş kromenilyum-siyanin tabanlı ve çok kanallı yeni bir cıva (II) sensörün geliştirilmesi
Development of a novel multi-channel mercury (II) sensor based on chromenylium-cyanine modified with thiazole-ferrocene
ELİF YILMAZ
- Antikanser ilaçlar ile DNA etkileşiminin tayinine yönelik metal oksit esaslı yeni nanobiyosensörlerin tasarımı
Development of metal oxide based new nanobiosensors for determination of DNA interaction with anticancer drugs
ELİFCAN EMİROĞLU BÖLÜKBAŞ
Doktora
Türkçe
2025
BiyoteknolojiEge ÜniversitesiAnalitik Kimya Ana Bilim Dalı
PROF. DR. DİLŞAT ARIKSOYSAL
- DNA functionalized nanoparticles in nanobiosensor and sensor array development for molecular diagnostics and in vitro identification of biomolecules
Başlık çevirisi yok
MUSTAFA SALİH HIZIR
Doktora
İngilizce
2018
BiyolojiUniversity at Albany, State University of New YorkProf. Dr. MEHMET YİĞİT
- Glikopeptitlerin kütle spektrometrik analizleri için yeni bir biyoanalitik yöntem geliştirilmesi ve insan C1-inhibitör proteininin ayrıntılı bölgeye özgü glikozilasyon analizinin gerçekleştirilmesi
Development of a novel bioanalytical method for mass spectrometric analysis of glycopeptides and achieving in-depth site specific glycosylation analysis of human C1-inhibitor
HACI MEHMET KAYILI
- Development of a new bioanalytical method for mass spectrometric analysis of glycopeptides using hydrophilic interaction-based sorbents
Hidrofilik etkileşime dayalı sorbentler kullanılarak glikopeptitlerin kütle spektrometrik analizi için yeni bir biyoanalitik yöntemin geliştirilmesi
ABDULBASİT RAMADAN ALMAHDİ ALTOUMİ
Yüksek Lisans
İngilizce
2022
BiyokimyaKarabük ÜniversitesiBiyomedikal Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. HACI MEHMET KAYILI
PROF. DR. BEKİR SALİH