Prematür overyan yetmezlikli (POY) bireylerde FMR1 geni CAG tekrar dizi analizi, kromozomal mikroarray ve multigenetik panel analizi verilerinin değerlendirilmesi ile genetik etiyolojinin retrospektif olarak araştırılması
Retrospective investigation of genetic etiology by evalution of FMR1 gene CAG repeat sequence analysis chromosomal microarray and multigenetic panel analysis data individuals with premature ovarian insuffiency (POY)
- Tez No: 752175
- Danışmanlar: PROF. DR. NURAY BOZKURT
- Tez Türü: Tıpta Uzmanlık
- Konular: Kadın Hastalıkları ve Doğum, Obstetrics and Gynecology
- Anahtar Kelimeler: POY, FMR1 premutasyonu, Mikroarray, Karyotip analizi, Yeni nesil dizileme, POY, FMR1 premutation, Microarray, Karyotype analysis, New generation sequencing
- Yıl: 2022
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Gazi Üniversitesi
- Enstitü: Tıp Fakültesi
- Ana Bilim Dalı: Kadın Hastalıkları ve Doğum Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 116
Özet
Prematür Overyan Yetmezlikli (POY) Bireylerde FMR1 Geni CAG Tekrar Dizi Analizi, Kromozomal Mikroarray ve Multigenik Panel Analizi Verilerinin Değerlendirilmesi ile Genetik Etiyolojinin Retrospektif Olarak Araştırılması Çalışmamızın amacı Mikroarray, FMR1 gen premutasyonu saptanmayan Prematür Overyan Yetmezlikli (POY) Bireylerde Multigenetik Panel Araştırılarak mevcut genetik mutasyonları ortaya koymayı, tedavi metodunu belirlenmesini ve hastaların bilgilendirilmesini amaçlıyor. Prematür Overyan Yetmezlikli (POY) Bireylerde multigenetik panel araştırılarak MikroARRAY, FMR1 geni dışındakı mutasyonları belirleyip istatiksel veriler elde ederek, literature katkıda bulunmaktır. Retrospektif planlanan bu çalışmaya Ocak 2019 ve Ekim 2020 tarihleri arasında Gazi Üniversitesi Tıp Fakültesi Kadın hastalıkları ve doğum polikliniğine başvurup Prematüre Overyan Yetmezlik tanısı alan, Tıbbi Genetik Anabilim dalına refere edilmiş olup , FMR1mutasyon analizi, kromozomal mikroarray (KMA) ve yeni nesil dizileme ile panel analizi yapılmış Prematür Overyan Yetmezlikli (POY) 19 hastanın verilerinin incelenmesi planlanmıştır. Hastaların yaşları, sigara, alkol kullanımları, menarş yaşı, HRT alıp almadıkları, ek hastalıkları, obstetrik öyküleri, dosya bilgilerinden taranmıştır. POF açısından soygeçmişleri- anne, anneanne, teyze, kız kardeş menopoz yaşları, ailede MR'li birey öyküsü kaydedilmiştir. Hastaların laboratuar sonuçları dosya bilgilerinden kaydedilmiştir. FSH, LH, Estradiol, Prolaktin, TSH, fT3, fT4, Anti-TPO, Anti-TG, TRAB, Kortizol, ANA, İnsülin, Açlık Glikoz değeri, LDL, HDL, Trigliserit, Total Kolesterol, Anti Müllerian Hormon değerleri, DEXA ölçümleri ve mamografi sonuçları dosya bilgilerinden kaydedilmiştir. Karyotip, FMR1, ARRAY CGH ve NGS sonuçları dosya bilgilerinden kaydedilmiştir. Çalışmamıza klinik ve genetik değerlendirmeleri yapılan, yaş ortalaması 32,20±7,02 olan, primer amenoresi bulunan 2 olgu ve sekonder amenoresi bulunan 18 olgu toplam 20 POY olgusu dâhil edilmiştir. Hastalardan 1 tanesinde mos 45X(37)/46XY(38) saptanmıştır. Klinik genetik değerlendirme sonrası sendromik olmayan ve normal kromozom dizilimine sahip olan 19 olguda, FMR 1 premutasyon değerlendirmesi için FMR1 geni fragman analizi gerçekleştirilmiştir. 1 olguda CGG tekrar sayısı intermediate aralığında bulunmuştur. Çalışmamızın olgu örneklerinde aCGH analizleri yapılmış, son aşamasında multigenetik panel analizi kullanılmıştır. Güncel veritabanları değerlendirmesine tabi tutulan verilerin analizi sonucunda her olguda en az bir olmak üzere toplam 6 vakada klinikle uyumlu olabilecek genetik varyant saptandı. Değerlendirilen 6 olguda klinik olarak anlamlı olabilecek genetik varyant saptanmadı. POY patogenezinde primer olarak bildirilen 2 olguda kanser yatkınlığına neden olan genler tespit edilmiştir. Sonuç olarak, moleküler etiyolojik tetikleyicilerin önemli ölçüde heterojenlik gösterdiği Prematür overyan yetmezlikte doğru ve etkin tanı için NGS yönteminin sağladığı faydanın yanı sıra, elde edilen verilerin Tıbbi Genetik alanında tanı amaçlı kullanılan ileri test ve yöntemlerle korele edilmesi ve seçilmiş olgularda hasta ve varyantların takibi ve belirli aralıklarla tekrardan değerlendirilmesi, bu doğrultuda genetic danışma planlanmasının yararlı olacağı önerilmiştir. Bütün bunların sonucunda POY'un etyopatogenezinde rol oynayabileceği bildirilen aday genler çalışmamızda ortaya konmuş, bunların yanı sıra ileri analizlerin yapılması gereken yeni genler de literatüre kazandırılmıştır.
Özet (Çeviri)
Retrospective Investigation of Genetic Etiology by Evaluation of FMR1 Gene CAG Repeat Sequence Analysis, Chromosomal Microarray and Multigenic Panel Analysis Data in Individuals with Premature Ovarian Insufficiency (POY) The aim of our study is to investigate the Multigenetic Panel in Individuals with Premature Ovarian Insufficiency (POY) without Microarray, FMR1 gene premutation, to reveal the existing genetic mutations, to determine the treatment method and to inform the patients. To contribute to the literature by investigating the multigenetic panel in individuals with premature ovarian failure (POY), determining the mutations other than the MicroARRAY, FMR1 gene and obtaining statistical data. In this retrospective study is planned to analyze the data of 19 patients with Premature Ovarian Failure (POY) who were referred to the Department of Medical Genetics, diagnosed with Premature Ovarian Failure, and panel analysis was performed with FMR1 mutation analysis, chromosomal microarray (CMA) and next generation sequencing at Gazi University Faculty of Medicine, Gynecology and Obstetrics Clinic between January 2019 and October 2020. Patients' age, smoking, alcohol use, age at menarche, whether they took HRT, additional diseases, obstetric histories, file information were scanned. Family histories in terms of POF. The menopause ages of the mother, grandmother, aunt, sister, and the history of an individual with MR in the family were recorded. The laboratory results of the patients were recorded from the file information. FSH, LH, Estradiol, Prolactin, TSH, fT3, fT4, Anti-TPO, Anti-TG, TRAB, Cortisol, ANA, Insulin, Fasting Glucose value, LDL, HDL, Triglyceride, Total Cholesterol, Anti Müllerian Hormone values, DEXA measurements and mammography results were recorded from the file information. Karyotype ,FMR1, ARRAY CGH and NGS results are recorded from the file information. A total of 20 POI cases, whose clinical and genetic evaluations were made, mean age 32.20±7.02, 2 cases with primary amenorrhea and 18 cases with secondary amenorrhea were included in our study. In one of the patients, mos 45X(37)/46XY(38) was detected. FMR1 gene fragment analysis was performed for the evaluation of FMR 1 premutation in 19 cases with non-syndromic and normal chromosome sequences after clinical genetic evaluation. In 1 case, the number of CGG repeats was found to be in the intermediate range. In the case samples of our study, aCGH analyzes were performed, and in the final stage, multigenetic panel analysis was used. As a result of the analysis of the data subject to the evaluation of current databases, at least one in each case, a total of 6 cases, genetic variants that may be compatible with the clinic were detected. No clinically significant genetic variant was detected in 6 evaluated cases. Genes causing cancer susceptibility were detected in 2 cases reported as primary in the pathogenesis of POI. As a result, in addition to the benefit of NGS method for accurate and effective diagnosis in premature ovarian failure, where molecular etiological triggers are significantly heterogeneous, it has been suggested that the obtained data should be correlated with advanced tests and methods used for diagnostic purposes in the field of Medical Genetics, and the follow-up of patients and variants in selected cases and their re-evaluation at regular intervals, and in this direction, it would be beneficial to plan genetic counseling. As a result of all these, candidate genes that have been reported to play a role in the etiopathogenesis of POI have been revealed in our study, as well as new genes that require further analysis have been brought to the literature.
Benzer Tezler
- Prematür over yetmezliği olgularında genomik kopya sayısı değişikliklerinin array CGH yöntemi ile değerlendirilmesi
Assessing copy number variations by array CGH in cases with premature ovarian failure
HALİME KÜÇÜK
Doktora
Türkçe
2015
GenetikEskişehir Osmangazi ÜniversitesiTıbbi Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SEVİLHAN ARTAN
- GNRH agonist leuprolide acetate does not confer any protection against ovarian damage induced BY chemotherapy and radiation in vitro
GNRH agonisti löprolid asetat in vitroda kemoterapi ve radyasyona bağlı over hasarına karşı koruyuculuk sağlamıyor
GAMZE BİLDİK
- Prematür overyan yetmezliği olan kadınların yaşadıkları sorunlar ve baş etme deneyimleri
Problems and coping experiences of women with premature ovarian failure
GÜLSEREN SALLIO
Yüksek Lisans
Türkçe
2023
HemşirelikPamukkale ÜniversitesiDoğum, Kadın Sağlığı ve Hastalıkları Hemşireliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. PINAR SERÇEKUŞ AK
- Prematür ovaryan yetmezliği olan hastalarda inflamasyon belirteci olan serum endokan seviyelerinin tespit edilmesi
Determination of serum endocan levels which is inflammation marker in patients with premature ovaryan failure
MELİKE GÜLER
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2019
Kadın Hastalıkları ve DoğumSağlık Bilimleri ÜniversitesiKadın Hastalıkları ve Doğum Ana Bilim Dalı
PROF. DR. NAFİYE YILMAZ
- Ratlarda siklofosfamid kaynaklı erken ovaryen yetmezlik modelinde anjiotensin reseptör blokerleri kullanımının overe etkisi
The effect of the use of anjiotensin receptor blockers on the model of early ovarian failure caused by cyclophosphamide in rats.
EZGİ DOĞAN TEKBAŞ
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2022
Kadın Hastalıkları ve DoğumMaltepe ÜniversitesiKadın Hastalıkları ve Doğum Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ ALİ GÜRSOY
