Geri Dön

Characterization of human babesiosis otu like protein

İnsan babesioz otu protein karakterizasyonu

PDF İndir

  1. Tez No: 759470
  2. Yazar: BETÜL YUSUF
  3. Danışmanlar: DOÇ. DR. FATİH KOCABAŞ
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyoteknoloji, Biotechnology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2022
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: Yeditepe Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 86

Özet

Sıtma benzeri semptomlara neden olan bir parazit olan Babesia microti, kırmızı kan hücrelerinin bir protozoan paraziti olan Babesiosis'in etken ajanıdır. İnsan Babesiosis, asemptomatik ve hafif ila orta şiddette olmaktan ölüm veya sürekli nüksetme ile sonuçlanabilecek ciddi bir hastalık olmaya kadar değişen bir şiddet yelpazesinde kendini gösterebilir. B. microti, terapötik ilaçlara karşı giderek artan bir direnç kazanmıştır. B. microti'nin hayatta kalması için gerekli proteazları hedeflemek, özellikle ubikuitin proteazom yolunu hedeflemek muhtemelen terapötik bir yaklaşım olabilir. Babesia microti'yi içeren Apicomplexan patojenleri hücreler arası parazitlerdir ve Kırım Kongo Kanamalı Ateş Virüsü (CCHFV) ile karşılaştırılabilir özelliklere sahiptir. Birkaç Viral OTU ile ilgili protein rapor edilmiştir ve bu proteinlerin, ubiquitination sürecini değiştirme ve enfekte olmuş hücrelerde ISG15 bölgesini parçalama yeteneğine sahip olduğunu gösterilmiştir ve hücreler istila edildiğinde CCHFV'nin OTU de-ubiquitination aktivitesine sahip olduğu kanıtlanmıştır. Ek olarak, OTU deubiquitinase Y89-W99 ceplerinin, hastalıkların tedavisi için küçük molekül inhibitörlerinin geliştirilmesinde önemli bir role sahip olduğu belirlendi. Bilinmeyen bir protein ürünü olan Babesia Microti'nin OTU benzeri sistein proteazından olduğu belirledik. Mevcut çalışmanın sonuçları şu hipotezi desteklemektedir; CCHFV, hücreleri istila etmek için deubikuitinaz cebini kullanabilirse, babesia microti (B.microti) OTU proteini, CCHFV ve Viral OTU benzeri proteazlar arasında benzerlik olduğundan, OTU de-ubiquitination aktivitesine de sahip olabilir. Bu çalışmada, babesia microti OTU proteininin ilk kez tanımlanması ve karakterize edilmesi hedeflenmiştir. Bu çalışmanın amacı, yeni bm-OTU benzeri proteini in vitro ve in vivo ve esas olarak deubikitinasyon aktivitesini karakterize etmekti. Çalışma, mono-poli-UB seviyesinde hücre içi çoğalma ve hücresel bağışıklık yollarında bm-OTU proteaz etkilerinin ilk doğrudan gösterimini temsil etmektedir. Babesiosis hastalığının tedavisi için yeni yaklaşımlar geliştirmek için bu çalışmada bu proteaz aktivitesinin inhibisyonu planlandı. Sonuç olarak, bu çalışma, bm-OTU rekombinant proteininin in vitro olarak protein yanlış katlanması ve deubiquitination aktivitesinin zorluğunu vurgulayan sonuçlara ulaşılmıştır ve yapılması gereken çalışmaların gereğini ortaya koymuştur.

Özet (Çeviri)

Babesia microti, a parasite that causes malaria-like symptoms, is the causative agent of Babesiosis, a protozoan parasite of red blood cells. Human Babesiosis can manifest on a spectrum of severity, ranging from being asymptomatic, and mild-to-moderate severity to being a severe illness that could result in death or incessant relapse. B. microti has increasingly gained resistance against therapeutic drugs. Other than the research mentioned earlier, targeting proteases necessary for the survival of B. microti can be possibly therapeutic, especially the ubiquitin proteasome pathway. The Apicomplexan pathogens that include babesia microti are intercellular parasites, and they are comparable to Crimean Congo Haemorrhagic Fever Virus (CCHFV). Several Viral OTU-related proteins were reported and showed that these proteins have the ability to alter the ubiquitination process and cleave the region of the ISG15 in the infected cells and it was proved that CCHFV has OTU de-ubiquitination activity when cells are invaded. In addition, the OTU deubiquitinase Y89-W99 pockets were determined as having a significant role in developing small molecule inhibitors for treating the diseases. Babesia Microti, an unnamed protein product, was predicted to be from the OTU-like cysteine protease. The results of the present study support the hypothesis that; if the CCHFV can use the deubiquitinase pocket to invade the cells, babesia microti (B.microti) OTU protein can also has the OTU de-ubiquitination activity since there are similarity between CCHFV and Viral OTU-like proteases. This is the first time that babesia microti OTU protein has been identified and characterized. The purpose of this study was to characterize the novel bm-OTU-like protein in vitro and in vivo and mainly its deubiquitination activity. The study represents the first direct demonstration of bm-OTU protease effects on the intracellular ubiquitination at the mono-poly-UB level and cellular immune pathways. Inhibition of this protease activity was planned in this study to develop new approaches for treating babesiosis disease. In conclusion, this study highlights the challenge of protein misfolding and deubiquitination activity of the bm-OTU recombinant protein in vitro and accredits any improvements in different conditions. It can be drawn from all the results shown in this study that the studied recombinant protein has been identified and characterized for any future work in order to develop any new approaches in the field of treatments.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    68731

    Characterization of human erythroyte GST TI-I and polymorphic distribution in a Turkish population

    İnsan eritrositinde GST TI-1 enziminin karakterizasyonu ve Türk populasyonundaki polymorfizmi

    AZRA BOZCAARMUTLU

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    1997

    BiyokimyaOrta Doğu Teknik Üniversitesi

    Biyokimya Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MESUDE İŞCAN

  2. Tez No

    44812

    İnsan trombosit gamma-glutamil transferazın karakterizasyonu

    Characterization of human platelet gamma-glutamyl transferase

    AZİZE ŞENER YAMAN

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    1995

    BiyokimyaMarmara Üniversitesi

    Biyokimya Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. TURAY YARDIMCI

  3. Tez No

    49702

    Normal ve aterosklerozlu olguların trombositlerinde glukoz-6-fosfat dehidrogenaz (G-6-PD) karakterizasyonu

    Characterization of human platelet G-6-PD in normal in atherosclerotic cases

    RABİA OBA

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    1996

    BiyokimyaMarmara Üniversitesi

    PROF.DR. K. TURAY YARDIMCI

  4. Tez No

    531406

    Kemikli balıklarda RNA'ya bağlanan LARP6 proteinlerinin n-terminal alanının karakterizasyonu

    Characterization of the n-terminal domain of the RNA-binding LARP6 proteins from teleost fish

    HATİCE KÜLKÖYLÜOĞLU

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2018

    BiyokimyaOndokuz Mayıs Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ARİF GÖNÜLOL

    YRD. DOÇ. DR. KAREN ADELL LEWIS

  5. Tez No

    392941

    Yenikapı kazı buluntularındaki Neolitik ve Erken Bizans Dönemi insan kemiklerinin X-ışını floresans yöntemi ile karakterizasyonu

    Characterization of Neolithic and Early Byzantine human bones from Yenikapi excavations by X-ray fluorescence method

    RÜVEYDA KÜBRA İLERİ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2015

    Arkeometriİstanbul Teknik Üniversitesi

    Nükleer Araştırmalar Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. SEVİLAY HACIYAKUPOĞLU

Geri Dön