Kist nematodu populasyonları arasındakı genetik farklılıkların farklı moleküler yöntemlerle araştırılması
Investıgatıon of genetıc varıatıon among cyst nematode populatıons usıng molecular tools
- Tez No: 764308
- Danışmanlar: PROF. MUSTAFA İMREN
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Ziraat, Agriculture
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2022
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Bolu Abant İzzet Baysal Üniversitesi
- Enstitü: Lisansüstü Eğitim Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Bitki Koruma Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 45
Özet
Tahıl kist nematodu (TKN), Heterodera spp. dünyada ve ülkemizde buğday üretim alanlarında ürün kayıplarına neden olabilen ana zaralılardan biridir. Bu çalışmada, Doğu Akdeniz (Adana, Osmaniye, Hatay, Kahramanmaraş) ve Güneydoğu Anadolu (Gaziantep, Kilis ve Mardin) Bölgesi buğday üretim alanlarından elde edilen 24 adet Tahıl kist TKN popülasyonunun morfolojik ve moleküler olarak tanımlanması ve popülasyonlar arasındaki farklılıkların araştırılması amaçlanmıştır. Çalışmada, TKN popülasyonlarına ait ikinci dönem larva (vücut uzunluğu, stylet uzunluğu, kuyruk uzunluğu, hyaline uzunluğu) ve dişi bireylerin (fenestral uzunluk, semi fenestral genişlik, vulval bridge genişlik ve vulval slit uzunluk) karakterleri esas alınarak klasik teşhis yapılmıştır. RFLP yönteminde Alul, PstI, BsuRI (HaeIII) ve Rsal olmak üzere dört farklı endonükleaz enzimi, türe özgü AvenF-COI/AvenR-COI, HfF/HfR ve H-LatF/H-LatR SCAR primerler ve rDNA-ITS gen bölgesi dizileri kullanılarak TKN popülasyonları moleküler düzeyde teşhis edilmiş ve genetik farklılıkları belirlenmiştir. Çalışma sonucunda, klasik ve moleküler teşhis sonuçlar birbirini teyit etmiş olup, Adana, Osmaniye, Hatay ve Gaziantep popülasyonları Heterodera avenae, Kahramanmaraş ve Bolu popülasyonları H. filipjevi ve Kilis ve Mardin popülasyonları ise H. latipons olarak tanımlanmıştır. Ayrıca, moleküler teknikler (SCAR primers, RFLP, rDNA-ITS sekansı) ile TKN popülasyonlarının teşhisinde hızlı ve güvenilir sonuç alınabileceği kanaatine varılmıştır.
Özet (Çeviri)
Cereal cyst nematode (CCN), Heterodera spp. is one of the main pests that can cause crop losses in wheat production areas in the world and in our country. In this study, it was aimed to identify 24 Cereal cyst nematode populations on morphologically and molecularly obtained from wheat production areas of Eastern Mediterranean (Adana, Osmaniye, Hatay, Kahramanmaraş) and Southeastern Anatolia (Gaziantep, Kilis and Mardin) regions and to investigate the differences between populations. In the study, classical diagnosis was achieved based on the characteristics of the second stage juveniles (body length, stylet length, tail length, hyaline length) and female individuals (fenestral length, semi fenestral width, vulval bridge width and vulval slit length) of CCN populations. In the RFLP method, CCN populations were identified at the molecular level and their genetic differences were determined using four different endonuclease enzymes, specifically Alul, PstI, BsuRI (HaeIII) and Rsal, species-specific AvenF-COI/AvenR-COI, HfF/HfR and H-LatF/H-LatR SCAR primers and the sequences of rDNA-ITS gene region. As a result of the study, classical and molecular diagnostic results confirmed each other, Adana, Osmaniye, Hatay and Gaziantep populations were identified as Heterodera avenae, Kahramanmaraş and Bolu populations were identified as H. filipjevi, and Kilis and Mardin populations were defined as H. latipons. In addition, it was concluded that molecular techniques (SCAR primers, RFLP, rDNA-ITS sequence) are rapid and reliable method to diagnose CCN populations.
Benzer Tezler
- Doğu Akdeniz ve Güneydoğu Anadolu bölgeleri buğday alanlarında tahıl kist nematodu türlerinin (Heterodera avenae group) belirlenmesi ve bazı buğday genotiplerinin heterodera avenae (wollenweber, 1924)'ye karşı dayanıklılığının araştırılması
Determination of cereal cyst nematodes (Heterodera avenae group.) on cereal fields in eastern mediterranean and southeast anatolaian regions and investigation of some wheat genotypes resistance aganist to heterodera avenae (wollenweber, 1924)
MUSTAFA İMREN
- Orta Anadolu kışlık buğday üretim alanlarında hububat kist nematodu Heterodera filipjevi(Madzihidov, 1981) Steiner&Stelter, 1984 (Nematoda: Heteroderidae)'nin popülasyon yoğunluğu ile hassas ve dayanıklı buğday çeşitlerinde popülasyon değişimi üzerine çalışmalar
Studies on population densities of Heterodera filipjevi (Madzihidov, 1981) Steiner&Stelter, 1984 (Nematoda: Heteroderidae) in winter wheat production areas in the Central Anatolia Plateau and on population development on resistant and susceptible wheat varieties
HAYRİYE DİDEM SAĞLAM
- Patates altın kist nematodu, Globodera rostochiensis'in patates verimine etkisinin araştırılması
Investigation of the effect of potato golden cyst nematode, Globodera rostochiensis on potato yield
AHMET ALTAŞ
Yüksek Lisans
Türkçe
2021
ZiraatBolu Abant İzzet Baysal ÜniversitesiBitki Koruma Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MUSTAFA İMREN
- Akdeniz tahıl kist nematodu, Heterodera latipons (Franklin)'un biyo-tipleri ile bazı buğday ve arpa çeşitlerinin bu biyo-tipe reaksiyonu
Determination of the bio-type of mediterranean cereal cyst nematode, Heterodera latipons (Franklin) and the reaction of some wheat and barley varieties
NAGİHAN DUMAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2018
ZiraatAbant İzzet Baysal ÜniversitesiBitki Koruma Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. MUSTAFA İMREN
- Erzurum ili patates üretim alanlarında bulunan bitki paraziti nematod türlerinin tespiti ve popülasyon yoğunluklarının araştırılması
Determination of plant parasitic nematode species in potato production areas of Erzurum province and investigation of their population densities
AYŞENUR ASLAN
Doktora
Türkçe
2024
ZiraatAtatürk ÜniversitesiBitki Koruma Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ÖNDER ÇALMAŞUR
PROF. DR. İBRAHİM HALİL ELEKCİOĞLU