The use of inter-specific complementation approach to understand the role of localised replication in plant virus cell-to-cell transport through plasmodesmata
Plamodesmata yoluyla hücreden hücreye bitki virüs taşınmasında lokalize replikasyonun rolünün anlaşılması için türler arası protein tamamlama stratejisinin kullanımı
- Tez No: 771652
- Danışmanlar: DOÇ. DR. MUHARREM ARAP KAMBEROĞLU
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Ziraat, Agriculture
- Anahtar Kelimeler: PVX, konfokal mikroskopi, tamamlama, Hücreden hücreye hareket, PVX, Confocal microscopy, Complementation, Cell-to-cell movement
- Yıl: 2022
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Çukurova Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Bitki Koruma Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 181
Özet
Bitki virüslerinin konukçuda yayılmasının tek yolu, plamodesmata (PD)'yı hedefleyebilen ve açabilen ve nükleik asitleri bağlayabilen virüs kodlu hareket proteinleri (MP) yardımıyla viral genomların PD'dan geçiş yaparak taşınmasıdır. Bu taşınma tipik olarak, hücre dışı otonom savunma sinyalizasyonu ve mobil RNA susturma işleminden kaçmak için viral genomların henüz bol olmadığı enfeksiyonun erken döneminde gerçekleşir. Bununla birlikte, bugüne kadar karakterize edilen MP'lerin hiçbiri herhangi bir dizi özgüllüğü göstermemekte, bu da taşımanın seçici olup olmadığı ve nasıl olduğu sorusunu gündeme getirmektedir. Genomu RNA olan virüsler arasında yer alan Patates X virüsü, replikasyon alanlarından bazılarını, yeni sentezlenmiş viral RNA'yı doğrudan kanallara yerleştirebilecekleri plazmodesmata girişlerine yöneltmektedir (eş replikasyonal-hareket). Ektopik MP'ler tarafından hareketin tamamlanması bitki virüsleri arasında yaygın bir olaydır ve lokalize replikasyonun mekanizmasını ve önemini incelemek için bir yol sağlar. Bu çalışmada, PVX'in hücreden hücreye taşınmasından sorumlu olan üçlü gen bloğu (TGB) yerine, Tütün mozayik virüsü'nün 30K hareket proteinini ifade etmek üzere modifiye edilen PVX-temelli plasmid vektör oluşturulmuştur. PD içindeki viral genomları takip edebilen yüksek afiniteli RNA bağlayıcı protein Csy4'e dayanan yeni, oldukça hassas bir RNA görüntüleme sistemi kullanılarak, PVX in PD-ilişkili replikasyon yerleri oluşturduğu gösterilmiştir. Bu sonuç, MP'lerin, aynı RNA molekülü/molekülleri veya konukçu proteinler ile karşılıklı etkileşimler yoluyla viral replikazları spesifik olmayan bir şekilde bir araya getirdiğini düşündürmüştür.
Özet (Çeviri)
The only way for plant viruses to spread through their hosts is transport of viral genomes through plasmodesmata (PD) with the aid of virus-encoded movement proteins (MPs), which can target and open PD and bind nucleic acids. This transport typically happens early during infection, when viral genomes are not yet abundant, in order to escape non-cell-autonomous defence signalling and mobile RNA silencing. However, none of the MPs characterised to date show any sequence specificity, raising the question whether transport is selective and how this occurs. The RNA virus, Potato virus X targets some of its replication sites to the entrances of plasmodesmata (PD), where it may insert newly synthesized viral RNA directly into the channels (co-replicational movement). Complementation of movement by ectopic MPs is widespread amongst plant viruses and provides a way to dissect the mechanism and significance of localised replication. In this study, PVX-based plasmid vector is constructed by modifying it to express the 30K MP of Tobacco mosaic virus, instead of its cognate triple gene block (TGB) proteins, which are responsible for cell to cell transport of PVX. Using a new, highly sensitive RNA imaging system based on the high-affinity RNA binding protein Csy4 which can track viral genomes within PD, it is shown that PVX with in cis movement complmentation, nonetheless, is still capable of forming PD-associated replication sites, suggesting that MPs may recruit viral replicases non-specifically through mutual interactions with the same RNA molecule(s) or host proteins.
Benzer Tezler
- Cumhuriyet dönemi Türk edebiyatında romandan tiyatroya uyarlamalar
Adaptation of novels to theatre in Turkish literature: A comparative analysis
EDANUR UZUNCA
Yüksek Lisans
Türkçe
2024
Türk Dili ve EdebiyatıTrakya ÜniversitesiTürk Dili ve Edebiyatı Ana Bilim Dalı
PROF. DR. YÜKSEL TOPALOĞLU
- Karıştırma saldırılarında OFDM-IM tekniğinin performansı
Performance of OFDM-IM Under jamming attacks
AHMET KAPLAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2020
Elektrik ve Elektronik Mühendisliğiİstanbul Teknik ÜniversitesiElektronik ve Haberleşme Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. İBRAHİM ALTUNBAŞ
- Nanosilika katkılı geleneksel betonların mekanik ve elastik özelliklerinin incelenmesi
Investigation of mechanical and elastic properties of traditional concrete nanosilica
ESEN ÖNDER
Yüksek Lisans
Türkçe
2019
İnşaat Mühendisliğiİstanbul Teknik Üniversitesiİnşaat Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. HAKAN NURİ ATAHAN
- Çocuk bilgi yarışma programlarında kültürel göstergelerin karşılaştırmalı analizi
Comparative analysis of cultural indicators in children's quiz shows
KHANİM MUKHTAROVA
Yüksek Lisans
Türkçe
2019
Radyo-TelevizyonKocaeli ÜniversitesiRadyo Televizyon ve Sinema Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ MERT GÜRER
- Afet koordinasyonu kapsamında 2023 Kahramanmaraş merkezli depremlerde Hatay ve Osmaniye illerinde görev alan Aksaray umke personellerinin deneyimleri
Disaster coordination experiences of Türkiye national medical rescue teams (UMKE) from aksaray deployed to Hatay and Osmaniye during the 2023 Kahramanmaras earthquakes
MISRA YILDIRIM
Yüksek Lisans
Türkçe
2025
İlk ve Acil YardımAksaray ÜniversitesiAcil Yardım ve Afet Yönetimi Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ABBAS MOL