Halofillerin adaptasyonunda ekstrasellüler veziküllerin rolü
The role of extracellular vesicles in the adaptation of halophiles
- Tez No: 773643
- Danışmanlar: DOÇ. DR. PINAR AYTAR ÇELİK, DOÇ. DR. BURAK DERKUŞ
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoteknoloji, Mikrobiyoloji, Biotechnology, Microbiology
- Anahtar Kelimeler: Ekstrasellüler vezikül, Halofilik mikroorganizma, Adaptasyon, Gram negatif bakteriler, Halofilik bakteriler, Uyum, Vezikül, Extracellular vesicles, Halophilic microorganism, Adaptation, Gram negative bacteria, Halophilic bacteria, Blister
- Yıl: 2022
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Eskişehir Osmangazi Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoteknoloji ve Biyogüvenlik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Ekstrasellüler veziküller, farklı hücre tiplerinden salgılanan lipit çift katmanlı nanometrik yapılardır. Veziküllerin salgılandıkları bakteri hücrelerinin patogenezi ve çevreye adaptasyonu ile ilgili işlevlerde rolleri olduğu bilinmektedir. Bunun yanında veziküllerin biyoteknolojik kullanımları da hız kazanmıştır. Ekstremofilik mikroorganizmaların ürettikleri metabolitler ve adaptasyon mekanizmaları da biyoteknolojik öneme sahiptir. Bu tez çalışmasında sunulan araştırma, halofilik bakterilerin vezikül karakterizasyonuna ve adaptasyondaki rolüne odaklanmıştır. Halomonas caseinilytica farklı tuz konsantrasyonlarında geliştirilip her bir gruptan vezikül izolasyonu yapılmıştır. Aynı zamanda kontrol grubu olarak mezofilik bakteri olan Escherichia coli'den de vezikül izolasyonu yapılmıştır. Veziküllerin morfolojik yapıları karakterize edilmiştir ve protein bileşimleri tespit edilip adaptasyon mekanizmasına dair bir farklılık taranmıştır. Yapılan analizler sonucunda farklı tuz konsantrasyonlarına ait veziküllerde genel olarak benzer protein profilleri olduğu bulunmuştur ancak temel bileşen analizi sonucunda farklı kümelenen protein profilleri olarak OmpA-OmpF porinleri, Uzama faktörü Tu, şaperonin ve TolB tespit edilmiştir. Bu proteinlerin vezikül oluşumu ve adaptasyon mekanizmasında rolleri olabileceği düşünülmektedir.
Özet (Çeviri)
Extracellular vesicles are nanometric lipid bilayer particles released by several cell types. The vesicles are known to have a function in the pathogenicity and adaptability of the bacterial cells they produce to the environment. Furthermore, the biotechnological use of vesicles has gained traction. Extremophilic bacteria metabolites and adaption processes are also important in biotechnology. The research presented in this thesis study focused on the vesicle characterisation of halophilic bacteria and its involvement in adaptation. Halomonas caseinilytica was cultivated at various salt concentrations, and vesicles from each group were isolated. Simultaneously, vesicle isolation from Escherichia coli, a mesophilic bacteria, was performed as a control group. The morphological features of the vesicles were studied, their protein composition was identified, and several adaption mechanisms were investigated. The investigation showed that there were usually comparable protein profiles in the vesicles of different salt concentrations, however the main component analysis revealed that OmpA-OmpF porins, Elongation factor Tu, chaperonin, and TolB were distinct aggregating protein profiles. These proteins are hypothesized to play roles in vesicle production and adaption mechanisms.
Benzer Tezler
- Ayvalık tuzlası (Balıkesir)'ndan halofilik bakterilerin izolasyonu ve biyoteknolojik enzim potansiyellerinin araştırılması
Isolation of halophilic bacteria from Balıkesir/Ayvalık saltern and determination theirs biotechnological enzyme potential
MEVLÜT MERT YILMAZ
Yüksek Lisans
Türkçe
2019
BiyoteknolojiManisa Celal Bayar ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MUSTAFA OSKAY
- Saros Körfezi Keşan Bölgesinden toplanan bazı halofit türlerinin etnobotanik özelliklerinin araştırılması
Investigation of ethnobotanical characteristics of some halophyte species collected from Keşan Region of Saros Bay
SHUAIB WAHEEB IBRAHIM ALBOBDRI
Yüksek Lisans
Türkçe
2024
Botanikİstanbul ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ FADİME ERYILMAZ PEHLİVAN
- Investigation of microbial diversity of Lake Acigol, a hypersaline lake in Southern Turkey, and their influence on biomineralization in the lake
Acıgöl'deki mikrobiyal çeşitliliğin ve bu türlerin biyomineralizasyon üzerindeki etkilerinin belirlenmesi
MERYEM MENEKŞE
Yüksek Lisans
İngilizce
2012
Biyolojiİstanbul Teknik Üniversitesiİleri Teknolojiler Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. NEVİN GÜL KARAGÜLER
DOÇ. DR. NURGÜL ÇELİK BALCI
- Өсүмдүктөрдүн өсүшүнө автоморфтуу туздуу топурактын таасири
Otomorfik tuzlu toprakların bitki büyümesi üzerindeki etkisi
NURGÜL CUMABEKOVA
Yüksek Lisans
Kırgızca
2024
BiyolojiKırgızistan-Türkiye Manas ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. NAZGUL IMANBERDİYEVA