Farklı armut (Pyrus communis) çeşit ve genotiplerinde genetik çeşitliliğin SSR markırları ile belirlenmesi
Determination of genetic diversity in different pear (Pyrus communis) varieties and genotypes with SSR markers
- Tez No: 774437
- Danışmanlar: PROF. DR. YASEMİN EVRENOSOĞLU, PROF. DR. EMEL SÖZEN
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoteknoloji, Biotechnology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2022
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Eskişehir Osmangazi Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Bahçe Bitkileri Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Meyve Yetiştirme ve Islahı Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: 84
Özet
Ülkemiz, birçok türde olduğu gibi, armut için de çeşit zenginliği bakımından geniş bir gen kaynağına sahiptir. Genetik kaynak özelliğindeki çeşitlerin, zamanla yok olmasını engellemek amacıyla genetik materyal ya da kontrollü yetiştiriciliğin koruma altına alınması gerekmektedir. Bu çalışmada moleküler markırlardan SSR tekniği kullanılarak 18 farklı armut çeşidini temsil eden 32 armut genotipi arasındaki genetik çeşitlilik ve akrabalık seviyelerinin ortaya koyulması amaçlanmıştır. Fluoresan işaretli 12 farklı SSR primeri ile PCR reaksiyonları gerçekleştirilmiştir. Bu primerlerden 9 tanesinden (CHO4e03-F, CHO5c06-F, EMPc11-F, CHO1D09-F, CHO3G07-F, CHO1d08-F, CHO1f07a-F, CHO2B10-F, EMPc117-F) sonuç alınmış ve agaroz jellerde yürütülerek ürün varlığı teyit edilmiştir. Bu PCR ürünlerinin allel büyüklükleri kapiller elektroforez yoluyla belirlenmiştir. Bu veriler kullanılarak 1 0 veri matrisi oluşturularak ve çeşitler arasındaki genetik benzerlik değerleri NTSYS Pc programında Dice eşitliği kullanılarak analiz edilmiş; yine aynı programda UPGMA analizi ile dendrogram hazırlanmıştır. Ayrıca SSR PCR sonuçlarından elde edilen genotiplere ait allel büyüklükleri de kaydedilerek çeşitleri tanımlayan DNA barkod sistemi oluşturulmuştur. Yapılan analizler sonucunda, en yüksek benzerlik gösteren 2 çeşidin %78 benzerlik oranıyla ile Margarit Marillat ve Kieffer arasında olduğu belirlenmiştir. Bunu takiben %38,5 benzerlik yüzdesiyle Santa Maria ve Kaiser Alexandre-1, Conference-1 ve Kaiser Alexandre-2 arasında olduğu tespit edilmiştir. 3. en yüksek benzerlik %37 ile Kaiser Alexandre-2 ve Magness-2 iken %35,7 ile Ekşi-2 ve Akça-1 arasında en yüksek 4. benzerlik yüzdesi belirlenmiştir. Elde edilen verilerin ileride yapılacak armut ıslah çalışmalarında yol gösterici olması planlanmaktadır.
Özet (Çeviri)
Our country has a wide genetic resource for pear, as well as for many species, in terms of variety. Genetic material or controlled breeding should be taken under protection in order to prevent the varieties with genetic source characteristics from disappearing over time. In this study, it was aimed to reveal the genetic diversity and relatedness levels among 32 pear genotypes representing 18 different pear cultivars by using the SSR technique, one of the molecular markers. PCR reactions were performed with 12 different fluorescently labeled SSR primers. Results were obtained from 9 of these primers (CHO4e03-F, CHO5c06-F, EMPc11-F, CHO1D09-F, CHO3G07-F, CHO1d08-F, CHO1f07a-F, CHO2B10-F, EMPc117-F). Allelic sizes of these PCR products were determined by capillary electrophoresis. The peak values read in capillary electrophoresis will give information about whether the relevant PCR product is homozygous or heterozygous and the allele size. Using these data, genetic similarity values between cultivars was analyzed using Dice equation in NTSYS PC program and dendrogram was prepared with UPGMA analysis. It was determined that the 2 cultivars with the highest similarity were between Margarit Marillat and Kieffer with a similarity rate of 78%. Following this, it was found to be between Santa Maria and Kaiser Alexandre-1, Conference-1 and Kaiser Alexandre-2 with 38.5% similarity percentage. Kaiser Alexandre-2 and Magness-2 had the 3rd highest similarity with 37%, while the 4th highest similarity percentage was determined between Ekşi-2 and Akça-1 with 35.7%. It is planned that the data to be obtained will guide the pear breeding studies in the future.
Benzer Tezler
- Armut (Pyrus communis L.) çeşitlerinde Erwinia amylovora enfeksiyonu sonrası katalaz ve askorbat peroksidaz enzim seviyelerinin belirlenmesi
Determination of catalase and ascorbate peroxidase enzyme levels after Erwinia amylovora infection in pear (Pyrus communis L.) cultivars
AYNUR TÜRKAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2019
ZiraatIğdır ÜniversitesiBitki Koruma Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ MESUDE FİGEN DÖNMEZ
PROF. DR. İRFAN ÇORUH
- Karyağdı armut (Pyrus communis L.) çeşidinde yapraktan protein ve kalsiyum uygulamalarının hasat önü dökümü ve meyve kalitesine etkilerinin belirlenmesi
Determination of the effects of leaf protein and calciumapplications on pre-harvest and fruit quality in karyagdı pear (Pyrus communis L.) cultivar
RÜVEYDA BASIM
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
ZiraatAkdeniz ÜniversitesiBahçe Bitkileri Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SADİYE GÖZLEKÇİ
- Armut yıkım fitoplazması Candidatus phytoplasma pyri hastalığının aşıyla taşınma etkinliğinin araştırılması ve farklı anaç-çeşit kombinasyonlarının reaksiyonları
Investigation on transmission efficiency of pear decline phytoplasma Candidatus phytoplasma pyri by grafting and reactions of different rootstock-scion combinations
ŞEFİKA YAVUZ
Yüksek Lisans
Türkçe
2011
ZiraatMustafa Kemal ÜniversitesiBitki Koruma Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. MONA GAZEL
- Derim sonrası 1-metilsiklopropen uygulamalarının 'Ankara' armut çeşidinin muhafazası üzerine etkisi
The effect of postharvest 1-methylcyclopropane treatments on storage of 'Ankara' pear cultivar
NALAN BAKOĞLU
Yüksek Lisans
Türkçe
2014
ZiraatAnkara ÜniversitesiBahçe Bitkileri Ana Bilim Dalı
PROF. DR. NURDAN TUNA GÜNEŞ
- Karyağdı armut (Pyrus communis L.) çeşidinde gibberellik asit (GA3) ve oksalik asit (OA) uygulamalarının meyve kalitesi üzerine etkileri
Effects of gibberellic acid (GA3) and oxalic acid (OA) applications on fruit quality in Karyağdı pear (Pyrus communis L.) cultivar
VOLKAN COŞKUN
Yüksek Lisans
Türkçe
2024
ZiraatAkdeniz ÜniversitesiBahçe Bitkileri Ana Bilim Dalı
PROF. DR. NİLDA ERSOY