SARS-CoV-2 enfeksiyonunda SERINC3 ve SERINC5 gen bölgelerinin antiviral rolleri ve moleküler analizleri
Antiviral roles and molecular analysis of SERINC3 and SERINC5 gene regions in SARS-CoV-2 infection
- Tez No: 784577
- Danışmanlar: DR. ÖĞR. ÜYESİ FERİT CAN YAZDIÇ
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoteknoloji, Biotechnology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2023
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Munzur Üniversitesi
- Enstitü: Lisansüstü Eğitim Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 60
Özet
SERINC genleri tüm ökaryotlarda bulunmakla birlikte bilinen moleküler fonksiyonları transmembran proteinlerini kodlamalarıdır. İnsan genomunda, transmembran topolojisine sahip homolog proteinleri kodlayan beş SERINC geni mevcuttur. SERINC3, poliomavirüs karşı etkinken, SERINC5'in antiretroviral aktivitesi göstermektedir. Yukarıda bahsedilen bilgiler ışığında dünya'da ve ülkemizde insan sağlığındaki yıkıcı etkilerinin belirlenmesi için covid-19 ile ilgili yapılacak bu tez çalışması ülkemizde SERINC bölgeleri ile yapılan ilk çalışma özelliğine sahiptir. Bu açıdan önemli bir yerde bulunmakla beraber gelecekteki yapılacak çalışmalara basamak niteliğindedir. SERINC3 ve SERINC5 genlerinin ekspresyon seviyelerinin belirlemek için, DNA ve cDNA sekans analizlerinden elde edilen veriler kullanılmıştır. Dizi çalışmaları sonunda, kullanılan hasta örneklerin de Serin3 için 671 mutasyonun 301 amaino asit değişikliğine neden olurken, Serin5 için 333 mutasyonun 105amaino asit değişikliğine neden olduğu belirlenmiştir. Gen ekspresyon çalışmaları sonunda elde edilen Ct değerleri Gene Globe program ile analiz edilmiştir. Çalışmada kullanılan genlerin verileri GAPDH geniyle normalize edilip 2-ΔΔCt formülünden çıkan verilerle istatistiksel analiz gerçekleştirilmiştir. Ekspresyon kat değişimi analizi için gruplar parametrik olmayan Mann-Whitney testi (p < 0.05) kullanılmıştır. Her iki gen içinde farklı genotipler ve hastalığın seyrini değiştirebilecek genetik özellikler belirlenmiştir.
Özet (Çeviri)
SERINC genes are ubiquitous in all eukaryotes, but their only known molecular function is to encode transmembrane proteins. The human genome has five SERINC genes, which encode homologous proteins with a transmembrane structure. SERINC3 has antiretroviral activity, whereas SERINC5 is anti-polyomavirus. In view of the foregoing information, this thesis study on covid-19 to assess its disastrous impacts on human health in the globe and in our country has the distinction of being the first study undertaken in our country with SERINC areas. In this regard, while it has an important place, it is merely a stepping stone for future research. The expression levels of the SERINC3 and SERINC5 genes were determined using data from DNA and cDNA sequence analyses. In the patient samples analyzed, sequence analysis showed that 333 serine5 mutations caused 105 amino acid changes while 671 serine3 mutations caused 301 amino acid changes. The Gene Globe program was used to assess the Ct values received at the end of gene expression studies. The data from the genes used in the study were normalized using the GAPDH gene, and statistical analysis was performed using the 2-ΔΔCt formula data. The non-parametric Mann-Whitney test (p 0.05) was used to compare groups for expression fold change analysis. In both genes, different genotypes and genetic characteristics that can alter the course of the disease have been identified.
Benzer Tezler
- SARS-CoV 2 enfeksiyonunda yüksek doz C vitamini tedavisinin prognoz üzerine etkinliğinin karşılaştırılması
Comparison of the effectiveness of high dose vitamin C therapy in SARS-CoV2 infection
GÖZDE ÖZTÜRK ALTUNYURT
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2021
Klinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon HastalıklarıSağlık Bilimleri ÜniversitesiEnfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. AYŞE BATIREL
- Sars cov-2 enfeksiyonunda otofaji ve apopitozun karşılıklı ilişkisinin öneminin analizi
Analyzing the importance of the interrelationship of autophagy and apoptosis in Sars Cov-2 infection
SENEM KOÇAK
Doktora
Türkçe
2024
Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik MikrobiyolojiGazi Üniversitesiİmmünoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. RESUL KARAKUŞ
- COVID 19 hastalarında perfüzyon indekslerinin hastalık şiddeti ile korelasyonunun değerlendirilmesi
Evaluation of the correlation of perfusion indexes with disease severity in COVID 19 patients
EREN YALÇIN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2022
Acil TıpSağlık Bilimleri ÜniversitesiAcil Tıp Ana Bilim Dalı
PROF. DR. EMİNE EMEKTAR
- SARS-COV-2 enfeksiyonu olan hastalarda lökosit sayısı, lenfosit ve nötrofil sayısı, nötrofil/lenfosit oranı, c-reaktif protein değerlerinin pentraxin-3 değerleri ile prognozu belirlemedeki yeri açısından karşılaştırılması
The relation between pentraxin-3 levels and leukocyte, lymphocyte, neutrophi̇l count, neutrophi̇l/lymphocyte ratio, and c-reacti̇ve protein in determination of prognosis patients with SARS-COV-2 infection
DİDEM ÖCAL TOPCU
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2021
Çocuk Sağlığı ve HastalıklarıSağlık Bilimleri ÜniversitesiÇocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MURAT ELEVLİ
- Koronavirüs hastalığı (COVID-19) ile Glutatyon S-transferaz T1 genindeki delesyon polimorfizmi arasındaki ilişkinin araştırılması
Thesis title investigation of the relationship between coronavirus disease (COVID-19) and deletion polymorphism in the Glutathione S-transferase T1 gene
HÜSEYİN KIRMIZITOPRAK
Yüksek Lisans
Türkçe
2024
MikrobiyolojiMersin ÜniversitesiMoleküler Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. NURCAN ARAS