Geri Dön

Phylogeographic Study of Ctenosaura similis

Ctenosaura similis'in Filocoğrafik Çalışması

  1. Tez No: 786653
  2. Yazar: HASRET ÖZTÜRK
  3. Danışmanlar: DOÇ. DR. LARRY BUCKLEY
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyoloji, Biology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2015
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: Rochester Instıtute Of Technology
  10. Enstitü: Yurtdışı Enstitü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Biyoenformatik Bilim Dalı
  13. Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.

Özet

Ctenosaura cinsi (dikenli kuyruklu iguanalar), diğer iguana cinsleri arasında en çeşitli grubu temsil eder. Bu cinsin şu ana kadar tanınan 18 türü vadir. Ctenosaura similis en yaygın yaşam alanı aralığına sahip türdür ve yaşam alanları güney Meksika'dan Panama'ya kadar uzanır. Bu çalışmanın amacı, C. similis tür içi genetik çeşitliliği anlamak ve türün yayılışı ile ilgili biyoceografik modeller ve genetik akrabalık arasında korelasyon olup olmadığını araştırmaktır. Bu çalışmada, 159 bireyin sitokrom b (cytb-1140 bp) gen bölgesi ile 127 bireyin rodopsin (847-878 bp) gen bölgesi dizilendi. Toplamda 71 mtDNA ve 40 nükleer haplotip tespit edildi. Haplotipler üzerinden gen ağaçları ve ağlar oluşturuldu. C.similis, Orta Amerika ve Güney Meksika'da en az 2-3 milyon yıllık bir tarihe sahip başarılı bir şekilde işgal etmiş ve dağılmıştır. Kosta Rika ve Panama bölgesi, yüksek haplotip çeşitliliği nedeniyle bu türün kökeni olabilir ve mevcut haplotipler arasındaki daha derin bölünmeler hem gen ağaçlarında hem de ağlarda görülmektedir. Pasifik Kıyısı'nda daha az haplotip çeşitliliği gözlenmiştir. Çoğu durumda, özellikle Atlantik kıyısında, Güney'den (Kosta Rika-Panama) Kuzey'e (Meksika'nın Kıstağı) her iki kıyıda da devam eden gen akışı, göç vardır. Belirli bölgelerdeki küçük kladlar için son zamanlardaki dağılım dışında, coğrafi dağılıma dayalı net bir ayrım yoktur. Gen ağaçları ve ağlar her lokus için birbiriyle tutarlıdır. Bununla birlikte, rodopsin ve cytb gen ağaçlarının/ağlarının genel modeli birbiriyle tam olarak uyuşmamaktadır. Genetik uzaklık ile haplotip sayısı arasında bir tutarlılık vardır (cytb: %3.7, 71 haplotip; rhodopsin: %1.85, 40 haplotip). C. similis türünün dağılımı Orta Amerikadaki iguanaların yayılımı ile ilgili önemli bilgiler ortaya koymaktadır. Bu çalışmada kullanılan moleküler belirteçler, C.similis bireylerinin Orta Ammerikadaki evrimsel ve tarihsel genişlemesi hakkında önemli bilgiler ortaya sunmuşdür. Düşük gen çeşitliliği ortaya koyan bu turun öncelikle izlenmesi ve mevcut habitatlarda korunması gerekmektedir. Aynı zamanda yeni habitatlarda istilacı potansiyelin olduğu gözlemlenmektedir (or. Florida ve Güney Amerikanın Kuzey bölgelerinde)

Özet (Çeviri)

The genus Ctenosaura (spiny-tailed iguanas) represents the most diverse group of iguanas with 18 currently recognized species. Ctenosaura similis has the most widespread ranges of all the Ctenosaura species, and extends from southern Mexico to Panama including many coastal islands. The purpose of this study is to explore the genetic diversity within C. similis and look for correlations between genetic relationships and biogeographicpatterns related to the spread of the species. This study sequenced and aligned 1140 bp from the cytochrome b (cytb) locus for 159 individuals and 847-878 bp from the rhodopsin locus for 127 individuals. A total of 71 mtDNA and 40 nuclear haplotypes were detected. C.similis has successfully occupied and dispersed in Central America and Southern Mexico with at least 2-3 million-year history. Costa Rica and Panama region can be the origin of this species due to high haplotype diversity, and deeper splits between existing haplotypes are visible on both gene trees and networks. Less haplotype diversity is observed on the Pacific Coast. In most cases, there is still ongoing gene flow, migration on both coasts from South (Costa Rica-Panama) to North (The Isthmus of Mexico) especially on the Atlantic coast. There is no clear separation based on geographical distribution except recent dispersal for small clades in certain areas. Gene trees and networks are consistent to each other for each locus. However, the general pattern of the rod and cytb gene trees/networks does not exactly match each other. There is a consistency between the genetic distance and number of haplotypes (cytb: 3.7%, 71 haplotypes; rhodopsin: 1.85%, 40 haplotypes). The geographic distribution of C. similis has provided valuable information about the spread of iguanas in Central America. These two molecular markers offered important information about the evolutionary historical expansion of C.similis individuals in Central America. Monitoring Ctenosaura similis is necessary for (1) conservation in existing habitats, and (2) invasive potential in new habitats (e.g.Florida and Northern SA).

Benzer Tezler

  1. Tez No

    678423

    Global phylogeographic comparisons and dietary analyses of gray wolf and red fox from Sarıkamış and Yenice in Turkey using genetics and genomics approaches

    Genetik ve genomik yaklaşımlar kullanılarak Sarıkamış ve Yenice / Türkiye'deki Gri Kurt ve Kızıl Tilki'nin global filogenetik karşılaştırmaları ve diyet analizleri

    İLKAY CİVELEK

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2018

    GenetikBoğaziçi Üniversitesi

    Çevre Bilimleri Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. İBRAHİM RAŞİT BİLGİN

  2. Tez No

    1004244

    Phylogeographic resolution of botrylloides affinis leachii (savigny, 1816) from the North-Eastern Mediterranean Sea

    Kuzey-Doğu Akdeniz'den botrylloides affinis leachii'nin filocoğrafik çözümlenmesi

    BERİVAN TEMİZ

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2019

    BiyolojiOrta Doğu Teknik Üniversitesi

    Deniz Biyolojisi ve Balıkçılık Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. ARZU KARAHAN

  3. Tez No

    527918

    Global phylogeographic comparisons and dietaryanalyses of gray wolf and red fox from Sarıkamış andYenice in Turkey using genetics and genomics approaches

    Genetik ve genomik yaklaşımlar kullanılarak Sarıkamış ve Yenice / Türkiye'deki Gri Kurt ve Kızıl Tilki'nin global filogenetik karşılaştırmaları ve diyet analizleri

    İLKAY CİVELEK

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2018

    GenetikBoğaziçi Üniversitesi

    Çevre Bilimleri Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. İBRAHİM RAŞİT BİLGİN

  4. Tez No

    510566

    The phylogeographic history, taxonomy and conservation of two cave-dwelling bat species: Miniopterus schreibersii and Myotis capaccinii (Chiroptera: Vespertilionidae)

    Mağarada yaşayan iki yarasa türünün, Miniopterus schreibersii ve Myotis capaccinii (Chiroptera: Vespertilionidae) filocoğrafi tarihi, taksonomisi ve korunması

    KANAT GÜRÜN

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2018

    BiyolojiBoğaziçi Üniversitesi

    Çevre Bilimleri Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. İBRAHİM RAŞİT BİLGİN

  5. Tez No

    333130

    DNA barcoding of seven hermit crab species(Crustacea:Decapoda) from Turkey with phylogeographic comparisons

    Türkiye denizlerinde bulunan yedi keşiş yengeci (Crustacea:Decapoda) türünün genetik kataloğunun oluşturulması ve filocoğrafik karşılaştırması

    SELEN ÖZSİNAN

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2011

    Çevre MühendisliğiBoğaziçi Üniversitesi

    Çevre Bilimleri Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. RAŞİT BİLGİN

Geri Dön