Irak'in al-anbar şehri'nde ıdrar örneklerinden izole edilen geniş spektrumlu β-laktamaz (ESBL) üreten E. coli suşlarının antibiyotiğe direnç özelliklerinin fenotiplendirilmesi ve genotiplenmesi
Study the phenotyping and genotyping of antibiotic resistance of the extended-spectrum β-lactamase (ESBL) of E.coli isolated from urine samples in al-anbar province/Iraq.
- Tez No: 788886
- Danışmanlar: DOÇ. DR. ÖZGÜR KUZUKIRAN
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Moleküler Tıp, Biology, Molecular Medicine
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2021
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Çankırı Karatekin Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: 85
Özet
Bu çalışma, geniş spektrumlu beta-laktamaz (ESBL) üreten üropatojenik Escherichia coli'de (blaCTX-M, blaTEM ve blaOXA) genlerinin görülme sıklığını ve Al-Anbar/Irak Hastaneleri arasında antibiyotik direnç modellerini belirlemek için tasarlanmıştır. Analiz edilen 65 üropatojenik E. coli izolatından 52 izolatın, kombinasyon disk testi ve VITEK sistemi kullanılarak ESBL üreticisi olduğu belirlendi. E. coli içerisinde beta-laktamaz (bla) genlerinin (TEM, CTX-M ve OXA) frekansı, Polimeraz Zincir Reaksiyonu (PCR) Tekniği ile genetik olarak belirlendi. Bunlardan 29 (%55,76) ESBL üreten üropatojenik E. coli'den tamamı blaTEM ve, blaCTX-M yönünden pozitif, blaOXA geni yönünden negatif çıkmıştır. Aynı örneklerin hem blaTEM hem de blaCTX-M genlerini barındırdığı görülmüştür. TEM ve CTX-M genlerinin en yaygın genler olduğu tespit edilmiştir. Bu çalışmada izolatlar, Ticarcillin'e (%91), Piperacillin'e (%91), Seftazidime (%91), Cefepime'ye ve (%12.13) Imipenem'e direnç göstermiştir. İzole edilen E. coli, Piperacillin / tazobactam'a duyarlılık gösterirken (%69.69). Bu çalışma, Al-Anbar eyaleti / Irak'ta üropatojenik E. coli suşlarında CTX-M ve TEM genlerinin görülme sıklığını gösterirken, Irak'ta ilk kez blaOXA geni (%0) negatif sonuç ile karşılaşıldı.
Özet (Çeviri)
The present study was designed to determine the occurrence frequency of (blaCTX-M, blaTEM and blaOXA) genes in extended-spectrum beta-lactamase (ESBL)-producing uropathogenic Escherichia coli, and their antibiotic resistance patterns among the Hospitals of Al-Anbar province/Iraq. Out of the 65 uropathogenic E.coli isolates analyzed, 52 isolates were identified to be ESBL producers by using combination disc test and VITEK system. The frequency of beta-lactamase (bla) genes (TEM, CTX-M and OXA) among E. coli was genetically determined by Polymerase Chain Reaction (PCR) Technique. Out of 29 (55.76%) ESBL-producing uropathogenic E. coli, 29 (100%) were positive for blaTEM, 29 (100%) were positive for blaCTX-M while recorded 29/29 (0%) negative result of blaOXA gene. And well 29 (100%) harbored both blaTEM and blaCTX-M genes. TEM and CTX-M genes were the most prevalent gene. In this study Isolates were resistance (91%) toward Ticarcillin, (91%) to Piperacillin, (91%) to Ceftazidime, (91%) to Cefepime, and (12.13%) to Imipenem. While the isolated E. coli showed susceptibility to Piperacillin/ tazobactam (69.69%). This study demonstrated the occurrence frequency of CTX-M and TEM genes in uropathogenic E. coli strains in Al-Anbar province/Iraq. while blaOXA gene first time studied in Iraq with (0%) negative result. Even though molecular techniques are more reliable in the detection of ESBL production, routine clinical screening for ESBL-producing uropathogens using phenotypic method should be introduced and encouraged in clinical settings as they are less expensive.
Benzer Tezler
- The current state of broiler chicken production in Ramadi city, Al Anbar province, Iraq
Irak'ın Al Anbar ilindeki Ramadi şehrinde etlik piliç üretiminin mevcut durumu
MALIK SAMEER DELI DELI
Yüksek Lisans
İngilizce
2022
ZiraatNiğde Ömer Halisdemir ÜniversitesiHayvansal Üretim ve Teknolojisi Ana Bilim Dalı
PROF. DR. AHMET ŞEKEROĞLU
- Evaluation and association of some biochemical parameters in patients with renal diseases in fallujah city in Iraq
Irak fellujah şehrinde böbrek hastalıklı hastalarda bazı biyokimyasal parametrelerin değerlendirilmesi ve ilişkilendirilmesi
MOHAMMED DAHHAM MOHAMMED AL-ALWANI
Yüksek Lisans
İngilizce
2022
BiyokimyaÇankırı Karatekin ÜniversitesiKimya Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ŞEVKİ ADEM
- Correlation between COVID-19 and biochemical laboratory markers: Serum ferritin, procalcitonin, troponine and some enzymes for Iraqi patients
COVİD-19 ve biyokimyasal laboratuvar belirteçleri arasındaki korelasyon: Iraklı hastalar için serum ferritin, prokalsitonin, troponin ve bazı enzimler
KHALID ZAITER KHALAF
Yüksek Lisans
İngilizce
2023
BiyokimyaKırşehir Ahi Evran ÜniversitesiKimya Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ASLIHAN GÜNEL
DOÇ. DR. MUHAMMAD HAMMAD ALAJEELY
- İbn Irâk (Arrâk)'ın Tenzîhü'ş-Şerîa adlı eserinin tahkik ve değerlendirmesi
An analysis and examination on Ibn Irâq (Arrâq)'s work named Tanzeeh Al-Sherîa
MAHMUT SAMİ GÜLCÜ
Doktora
Türkçe
2023
DinFatih Sultan Mehmet Vakıf ÜniversitesiTemel İslam Bilimleri Ana Bilim Dalı
PROF. DR. HALİL İBRAHİM KUTLAY
- Investigation of clinical significance of AMH, IL10 and IL-6 and some biochemical tests as prognostic factors in patients with prostate cancer in Al-Anbar city, Iraq
Irak'ın Al-Anbar şehrindeki prostat kanserli hastalarda prognostik faktör olarak bazı biyokimyasal testlerle AMH, IL10 ve IL-6 ve klinik önemi
FOUAD KHALAF KHUDHUR AL-KHULAIFAWI
Yüksek Lisans
İngilizce
2023
BiyokimyaÇankırı Karatekin ÜniversitesiKimya Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SALİHA ALYAR