Geri Dön

Türkiye'de yayılış gösteren Arvicola amphibius'un (Mammalia: Rodentia) Orta Anadolu ve Doğu Anadolu'da yayılış gösteren populasyonlarının nükleer DNA (interphotoreceptor retinoid binding protein, IRBP) varyasyonları

Variations of the nuclear DNA (interphotoreceptor retinoid binding protein, IRBP) in the populations of Arvicola amphibius(Mammalia: Rodentia) distrubuted in Central and East Anatolia living in Turkiye

PDF İndir

  1. Tez No: 791310
  2. Yazar: DERYA GÖKÇE BEKTAŞ
  3. Danışmanlar: DR. ÖĞR. ÜYESİ PERİNÇEK SEÇKİNOZAN ŞEKER
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Zooloji, Zoology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2023
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Artvin Çoruh Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 49

Özet

Bu çalışmada, sucul habitatlarda yaşamaya uyum sağlamış bir kemirgen olan Arvicola amphibius'un Orta ve Doğu Anadolu'da yaşayan populasyonlarının nükleer DNA interphotoreceptor retinoid-binding protein (IRBP) gen dizilerindeki varyasyonlar belirlenerek populasyonlar arasındaki filogenetik ilişkiler ve genetik farklılıklar araştırıldı. IRBP gen bölgesi için toplam 12 özgün haplotip belirlendi. Neighbour-Joining (NJ), Maximum Likelihood (ML) ve network analizleri ile incelenen populasyonların Orta Anadolu ve Doğu Anadolu olmak üzere iki farklı coğrafik soy grubu oluşturduğu tespit edildi. IRBP gen dizilimi bakımından her iki coğrafik soy grubunu oluşturan populasyonlar arasında genetik farklılaşmanın yüksek düzeyde olduğu, gen akışının da düşük seviyede olduğu tespit edildi. Kimura 2-parametresi temel alınarak hesaplanan genetik uzaklık değeri, alttür ya da tür düzeyindeki genetik farklılaşmadan ziyade, soy grupları arasında tür içi varyasyon düzeyinde bir genetik farklılaşmanın olduğunu gösterdi. İki farklı coğrafik soy grubunun oluşmasındaki en önemli unsurun, soy grupları arasındaki gen akışını engelleyen Anadolu Diyagonali'ni oluşturan sıradağların olabileceği düşünülmektedir.

Özet (Çeviri)

In this study, phylogenetic relationships and genetic differences between populations were investigated by determining the variations in nuclear DNA interphotoreceptor retinoid-binding protein (IRBP) gene sequences of Arvicola amphibius, a rodent adapted to living in aquatic habitats, living in Central and Eastern Anatolia. A total of 12 specific haplotypes were determined for the IRBP gene region. It was determined that the populations examined by Neighbour-Joining (NJ), Maximum Likelihood (ML) and network analyses formed two different geographical lineages, namely Central Anatolia and East Anatolia. In terms of IRBP gene sequencing, it was determined that the genetic differentiation was at a high level and the gene flow was at a low level between the populations constituting both geographical lineage groups. The genetic distance value calculated according to the Kimura 2-parameter indicated that there was genetic variation at the intraspecific level of variation among lineages rather than at the subspecies or species level. It is believed that the most significant agent in the formation of two different geographical lineage groups may be the mountain ranges forming the Anatolian Diagonal, which prevents gene flow between lineage groups.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    416749

    Türkiye'de yayılış gösteren su sıçanı Arvicola amphibius (Linnaeus, 1758) (Mammalia: Rodentia) populasyonlarının MtDNA (Sitokrom B ve kontrol bölgesi) varyasyonları

    MtDNA (Cytochrome B and control region) variations of water vole Arvicola amphibius (Linnaeus, 1758) (Mammalia: Rodentia) populations distributed in Turkey

    PERİNÇEK SEÇKİNOZAN ŞEKER

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2015

    BiyolojiAnkara Üniversitesi

    Zooloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ERCÜMENT ÇOLAK

  2. Tez No

    233599

    Batı Türkiye'de yayılış gösteren su sıçanı, Arvicola terrestris (Linnaeus, 1758) (Mammalia: Rodentia) populasyonlarının RAPD-PCR analizi

    RAPD-PCR analysis of water vole, Arvicola terrestris (Linnaeus, 1758) (Mammalia: Rodentia) distributed in western Turkey

    SEVİLAY ÜSTÜNBAŞ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2008

    BiyolojiAnkara Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. REYHAN ÇOLAK

  3. Tez No

    258648

    Batı Anadolu'daki su sıçanının (Arvicola terrestris Linneaus, 1758) taksonomik durumu ve allozim varyasyonları

    Taxonomic status and allozyme variation of watervole, (Arvicola terrestris Linneaus, 1758) in Western Anatolia

    BÜLENT GÖZCELİOĞLU

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2009

    BiyolojiAnkara Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ERCÜMENT ÇOLAK

  4. Tez No

    414081

    Türkiye'de yayılış gösteren Macrovipera lebetina (Linnaeus, 1758), Montivipera xanthina (Gray, 1849) ve Vipera ammodytes (Linnaeus, 1758) zehirlerinin karşılaştırmalı proteomik karakterizasyonu, koagülasyon üzerindeki etkilerinin ve sitotoksisitelerinin belirlenmesi

    Comparative proteomic characterization of the venom of Macrovipera lebetina (Linnaeus, 1758), Montivipera xanthina (Gray, 1849) and Vipera ammodytes (Linnaeus, 1758) distributed in Turkey and determination of their effects on coagulation and cytotoxicity

    NAŞİT İĞCİ

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2015

    BiyokimyaAnkara Üniversitesi

    Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. FATMA DUYGU ÖZEL DEMİRALP

    PROF. DR. BAYRAM GÖÇMEN

  5. Tez No

    416930

    Türkiye'de yayılış gösteren Ramalina (Ach.) cinsine ait bazı türlerin morfo-anatomik karakterleri ve multilokus moleküler sekans analizleri ile modern revizyonu

    Modern revision of the genus Ramalina (Ach.) in Turkey using morpho-anatomical characters and multilocus molecular sequence analyses

    BETÜL PATAT

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2016

    BiyolojiErciyes Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. MEHMET GÖKHAN HALICI

Geri Dön