Development of target-activatable smart therapeutics for protein degradation and photo-activatable fluorescent probes for cell imaging
Protein degradasyonu için hedefle aktifleştirilebilir akıllı terapötiklerin ve hücre görüntülemesi için ışıkla aktifleştirilebilir floresan problarının geliştirilmesi
- Tez No: 792252
- Danışmanlar: DR. ÖĞR. ÜYESİ SÜNDÜS ERBAŞ ÇAKMAK
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoteknoloji, Biotechnology
- Anahtar Kelimeler: Degradasyon, Floresan proteinler, Florofor, Proteinler, Tirozinaz, Fluorescent proteins, Fluorophore, Proteins, Tyrosinase
- Yıl: 2023
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Konya Gıda ve Tarım Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Terapötik bir araç olarak seçici protein degradasyonu yaklaşımı, anormal proteinlerin uzaklaştırılması, kanserle ilişkili proteinlerin degradasyonu, ilaç uygulaması yapılamayan proteinlerin hedeflenmesi için önem kazanmaktadır. Geleneksel küçük moleküllü inhibitörler, protein hedefleme ve kanser tedavisinde önemLi rol oynamalarına rağmen, kolay ilaç direnci geliştirmeleri ve yüksek dozların hücrelerde neden olduğu toksik etkiler gibi dezavantajları nedeniyle yeni stratejiler ilgi odağı haline gelmiştir. Proteoliz hedefleme kimeraları (PROTAC) yaklaşımı, seçiciliği ve katalitik etkisi yüksek olan ve hedeflenmemiş proteinlerin tedavisi için umut vaat eden bu stratejilerden biridir. Tez projesinde tüm bu dezavantajların üstesinden gelebilmek için sadece hedef proteininin yıkımını sağlamak için bir PROTAC molekülünün tasarlanmış ve sentezlenmiştir. Sentezlenen PROTAC, tirozinazın aşırı eksprese edildiği B16-F10 melanom hücrelerinde düşük konsantrasyonlarda hedef proteini başarıyla parçalamıştır. Bu anlamda kemoterapötik kanser tedavilerinde büyük bir potansiyele sahip olacak ve ilaçların yüksek dozlara bağlı toksik etkisini ortadan kaldırmasına katkı sunacaktır. Proje 2'de ise, Süper Çözünürlüklü Flüoresan Mikroskopisi (SRFM) için fotokırılım yoluyla emisyon üzerinde kontrol sahibi olan yeni aktive edilebilir florofor geliştirilecektir. Enerji transfer modüllerinin, ışık aracılı bölünme yoluyla ayrıldıklarında MCF-7 hücrelerinde artan donör emisyonu gösterdiği gözlenmiştir.
Özet (Çeviri)
Selective protein degradation approach as a therapeutic tool is becoming important for the removal of abnormal proteins, degradation of cancer-associated proteins, targeting undruggable proteins. Although traditional small molecule inhibitors play an important role in protein targeting and cancer treatment, new strategies have become the focus of attention due to their disadvantages such as easy drug resistance development and toxic effects caused by high doses in cells. Proteolysis targeting chimera (PROTAC) approach is one of these strategies, which has high selectivity and catalytic effect, and is promising for the treatment of untargeted proteins. In thesis project, a PROTAC molecule is designed that is specifically degrading target protein. The synthesized PROTAC was able to degrade the target protein at low concentrations in B16-F10 melanoma cells where tyrosinase was overexpressed. In this sense, it will have a great potential in chemotherapeutic cancer therapies and will contribute to biotechnological drug technologies due to the elimination of the toxic effect of drugs due to high doses and their effectiveness only in the desired tissue. As a second thesis project, novel activatable fluorophores having control over emission through photocleavage is developed for future Super-Resolution Fluorescence Microscopy (SRFM). Energy transfer modules are shown to display enhanced donor emission in MCF-7 cells, when separated through light mediated cleavage.
Benzer Tezler
- Development of new low pH activatable hydrazone-based, near-infrared region absorbable photodynamic threapy agents
Düşük pH ile aktifleşebilen hidrazon temelli yakın kızılötesi bölgede absorplayabilen yeni fotodinamik terapi ajanlarının geliştirilmesi
AYŞE İLAYDA BOYACI
Yüksek Lisans
İngilizce
2025
Moleküler TıpNecmettin Erbakan ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ TUĞBA NUR ASLAN
DOÇ. DR. YUSUF ÇAKMAK
- Mikroçevre duyarlı G4 ligandlarının geliştirilmesi, kanser metabolizmasının ve immun tepkinin düzenlenmesi
Development of microenvironment responsive G4 ligands, regulation of cancer metabolism and immune response
NEZAHAT GÖKÇE ÖZSAMUR
Doktora
Türkçe
2026
BiyokimyaNecmettin Erbakan ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. SÜNDÜS ERBAŞ ÇAKMAK
- Development of versatile and reusable target surfaces for matrix-assisted laser desorption/ıonization-mass spectrometry
Matriks-yardimli lazer desorpsiyon/iyonlaşmali-kütle spektrometrisi için çok amaçli ve yeniden kullanilabilir hedef yüzeylerin geliştirilmesi
ÖMÜR ÇELİKBIÇAK
- Development of a selection protocol for target nucleic acids based on nanoparticles
Nükleik asit hedeflerinde nanopartikul tabanlı seçim protokolü geliştirilmesi
AYŞE PINAR AKALIN
Doktora
İngilizce
2024
Biyoteknolojiİstanbul Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. AYTEN YAZGAN KARATAŞ
- Development of an electronic attack (EA) system in multi-target tracking
Çoklu hedef izlemede elektronik taarruz (ET) sisteminin geliştirilmesi
ÖZLEM TÜRKÇÜ
Yüksek Lisans
İngilizce
2007
Elektrik ve Elektronik MühendisliğiOrta Doğu Teknik ÜniversitesiElektrik-Elektronik Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF.DR. M. KEMAL LEBLEBİCİOĞLU