Geri Dön

Bazı biyolojik aktif moleküllerin yapılarının araştırılması

Investigation on molecular structures of some biologically active molecules

PDF İndir

  1. Tez No: 796374
  2. Yazar: ERSİN DURGUT
  3. Danışmanlar: PROF. DR. AYHAN ÖZMEN, PROF. DR. ÖMER DERELİ
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Fizik ve Fizik Mühendisliği, Physics and Physics Engineering
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2023
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Selçuk Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Fizik Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 132

Özet

Biyolojik aktif maddeler olarak bilinen (R)-2-Methylamino-1-Phenylethanol (Halostachine), Cyanidin-3-glucoside-chloride,“3-Chloro-4-fluorobenzaldehyde”,“2-Chloro-6-fluorobenzaldehyde”ve“3,5-Dichlorosalicylaldehyde”molekülerinin kararlı yapıları ilk olarak Moleküler Mekanik (MMF) yöntemle teorik olarak araştırılmıştır. Bu maddelerin kararlı yapıları belirlenirken Spartan programı ile konformasyon analizi yapılmıştır. Üst üste binen konformasyonlar ayıklanarak“(R)-2-Methylamino-1-Phenylethanol (Halostachine)'nin on dokuz, ”Cyanidin-3-glucoside-chloride“nin doksan sekiz, ”3-Chloro-4-fluorobenzaldehyde“in iki, ”2-Chloro-6-fluorobenzaldehyde“in iki ve ”3,5-Dichlorosalicylaldehyde"in üç kararlı konformasyonu olduğu tespit edilmiştir. Moleküllerin enerjileri, titreşim frekansları ve geometrik parametreleri Gaussian 03 paket programı kullanılarak, yoğunluk fonksiyonu kuramı (DFT) yöntemi ile B3LYP/6-311++G(d,p) düzeyinde taban durumunda hesaplanmıştır ve elde edilen enerjiler karşılaştırılarak en kararlı yapı elde edilmiştir. FT-IR spektrumu 4000-500 cm-1 ve Raman spektrumu 4500-120 cm-1 dalga sayısı aralığında kaydedilmiştir. Hesaplanan titreşim frekansları elde edilen deneysel değerler ile karşılaştırılmıştır. Teorik hesaplama yöntemleriyle elde ettiğimiz titreşim frekanslarının deneysel yöntemlerle elde edilen verilerle uyum içinde olduğu görülmüştür.

Özet (Çeviri)

Stable structures of (R)-2-Methylamino-1-Phenylethanol (Halostachine), Cyanidin-3-glucoside-chloride,“3-Chloro-4-fluorobenzaldehyde”,“2-Chloro-6-fluorobenzaldehyde”and“3,5-Dichlorosalicylaldehyde”molecules were investigated theoretically by Molecular Mechanics (MMF) method, firstly. By removing the overlapping conformations, it was determined that“(R)-2-Methylamino-1-Phenylethanol (Halostachine)”has nineteen,“Cyanidin-3-glucoside-chloride”has ninety eight,“3-Chloro-4-fluorobenzaldehyde”has two,“2-Chloro-6-fluorobenzaldehyde”two and“3,5-Dichlorosalicylaldehyde”three stable conformations. The energies, vibrational frequencies and geometric parameters of the molecules were calculated in the ground state at the B3LYP/6-311++G(d,p) level using the Gaussian 03 package program, using the density function theory (DFT) method, and the most stable structure was obtained by comparing the obtained energies. The FT-IR spectrum was recorded in the wavenumber range of 4000-500 cm-1 and the Raman spectrum in the wavenumber range of 4500-120 cm-1. The calculated vibration frequencies were compared with the experimental values measured. It has been observed that the vibration frequencies obtained by theoretical calculation methods are in harmony with the data obtained by experimental methods.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    879699

    Machine learning assisted force field development for nucleic acids

    Nükleik asitler için makine öğrenimi destekli kuvvet alanı geliştirilmesi

    GÖZDE İNİŞ DEMİR

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2024

    Bilgisayar Mühendisliği Bilimleri-Bilgisayar ve Kontrolİstanbul Teknik Üniversitesi

    Hesaplamalı Bilimler ve Mühendislik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ADEM TEKİN

  2. Tez No

    724201

    Development and structural determination of antiangiogenic recombinant antibody structures for cancer treatment

    Kanser tedavisine yönelik antianjiogenik rekombinant antikor yapılarının geliştirilmesi ve yapısal tayini

    MELİS DENİZCİ ÖNCÜ

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2022

    Biyomühendislikİstanbul Teknik Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. GİZEM DİNLER DOĞANAY

    DR. AYLİN ÖZDEMİR BAHADIR

  3. Tez No

    471614

    Bazı 2-sübstitüebenzimidazol türevi bileşiklerin antitüberküloz aktivitelerinin agar proporsiyon yöntemi ile araştırılması

    Investigation of antituberculosis activity of some 2-sübstitüebenzimidazol derivative compounds with agar proportion method

    EMEL SÖNMEZ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2016

    MikrobiyolojiMersin Üniversitesi

    Farmasötik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. MAHMUT ÜLGER

  4. Tez No

    755495

    Bir grup heterosiklik bileşiğin hidrazit ve hidroksamik asit türevlerinin sentezi ve biyolojik aktivitelerinin araştırılması

    Synthesis and biological activity studies of hydrazide and hydroxamic acid derivatives of a group of heterocyclic compounds

    İREM TATAR

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    BiyokimyaEge Üniversitesi

    Farmasötik Kimya Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MEHMET VAROL PABUÇÇUOĞLU

  5. Tez No

    435052

    Bazı 1-Tiyazolil-3-benzimidazolilpirazol Türevlerinin Sentezlenmesi, Yapılarının Aydınlatılması ve Lepidium sativum L. Tohumları Üzerinde Herbisit Etkilerinin Araştırılması

    Synthesis and Characterization of Some Novel 1-Thiazolyl-3-benzimidazolylpyrazole Derivatives and Investigation of Their Herbicide Effects on The Seeds of Lepidium sativum L.

    TUĞBA KEÇİ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2016

    KimyaMehmet Akif Ersoy Üniversitesi

    Kimya Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. İSMAİL KAYAĞİL

Geri Dön