Integrated analyses of Emodin in breast cancer cell lines
Meme kanseri hücre hatlarında Emodin'in entegre analizi
- Tez No: 810508
- Danışmanlar: PROF. DR. NÜLÜFER TÜLÜN GÜRAY, DOÇ. DR. BALA GÜR DEDEOĞLU
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Biyoteknoloji, Biotechnology
- Anahtar Kelimeler: Gen ifadesi regülasyonu, Hücresel yolaklar, Mikro RNA, Mikrodizilim analizi, Sistem biyolojisi, Tümör hücreleri-kültürü yapılmış, mRNA, Gene expression regulation, Cellular pathways, Micro RNA, Microarray analysis, Systems biology, Tumor cells-cultured, mRNA
- Yıl: 2023
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Orta Doğu Teknik Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Fen Bilimleri Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Biyoteknoloji Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Meme kanseri, yüksek insidans ve mortalite oranları ile en önde gelen kanserler arasında yer almaktadır. Şu anda tedavi için sunulan terapötiklerin çoğunun toksik olması nedeniyle, daha az toksik terapötik müdahale gerekmektedir. Bu çalışmada, kapsamlı bir ağ değerlendirmesi yaparak bir fitoöstrojen olan Emodin'in östrojen reseptör pozitif MCF-7 ve negatif MDA-MB-231 hücreleri üzerindeki etkisinin moleküler mekanizmalarını inceledik. Diferansiyel olarak eksprese edilen mikroRNA'lar, diferansiyel olarak eksprese edilen tanımlanmış mRNA'ları ile birlikte, entegre sistem biyolojisi yaklaşımı kullanılarak mikrodiziler aracılığıyla analiz edildi. Her hücre dizisi için miRNA-hedef gen ağları oluşturuldu, gen ontolojisi ve yolak zenginleşme analizleri yapıldı, zenginleşme haritaları oluşturuldu ve potansiyel anahtar genler, mikroRNA'lar ve mikroRNA-gen etkileşimleri incelendi.
Özet (Çeviri)
Breast cancer has been among the most prominent cancers with high incidence rates and mortality. Currently most of the offered therapeutics for treatment are toxic; hence, less toxic therapeutic intervention is required. Here, we studied the molecular mechanisms of the effect of a phytoestrogen Emodin on estrogen receptor positive MCF-7 and negative MDA-MB-231 cells by carrying out a comprehensive network assessment. Differentially expressed microRNAs along with their identified differentially expressed mRNAs were analyzed through microarrays by using integrative systems biology approach. For each cell line miRNA-target gene networks were built, gene ontology and pathway enrichment analyses were performed, enrichment maps were constructed and the potential key genes, microRNAs and microRNA-gene interactions were studied.
Benzer Tezler
- Exergoeconomic analyses of a novel solar organic rankine cycle integrated with cascaded vapor absorption-compression refrigeration system
Kademeli buhar soğurma-sıkıştırma soğutma sistemi ile entegre yeni bir güneş enerjili organik rankin çevriminin ekonomik analizi
SHAWQI HUSSEIN KRAIN AL-GAWWAM
Yüksek Lisans
İngilizce
2024
Makine MühendisliğiKarabük ÜniversitesiMakine Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ ABDULRAZZAK AHMED SALEH AKROOT
- Analyses and assessments of three renewable energy based integrated systems for multigeneration
Çoklu üretim için yenilenebilir enerji kaynaklı üç entegre sistemin analiz ve değerlendirilmesi
ARAS KARAPEKMEZ
Yüksek Lisans
İngilizce
2018
EnerjiYıldız Teknik ÜniversitesiMakine Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. İBRAHİM DİNÇER
- Development and thermodynamic analyses of integrated renewable energy based fresh water production systems via reverse osmosis desalination
Ters osmoz su arıtma sistemleri ile bütünleşik yenilenebilir kaynaklı tatlı su üretim sistemlerinin geliştirilmesi ve termodinamik analizi
HAMODA A.H. GNAIFAID
Doktora
İngilizce
2020
Makine MühendisliğiKarabük ÜniversitesiMakine Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. HASAN ÖZCAN
- Performance, economic, and environmental analyses of integrated biomass gasification and solid oxide fuel cell system
Bütünleşik biyokütle gazlaştırma ve katı oksit yakıt pili sistemlerinin performans, ekonomik ve çevresel analizleri
BEYZA DURSUN
Yüksek Lisans
İngilizce
2022
Makine MühendisliğiDokuz Eylül ÜniversitesiMakine Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. CAN ÖZGÜR ÇOLPAN
PROF. DR. AZİZE AYOL
- Glioblastoma multiforme, menenjiyom (birincil) ve metastaz (ikincil) beyin tümörlerine ait fenotiplerin belirlenmesinde kullanılacak bütünleşik omiks analizler için analitik yöntem geliştirilmesi ve uygulanması
Development and implementation analytical methods for integrated omics analyses to be used to identify phenotypes of glioblastoma multiforme, meningioma (primary) and metastasis (secondary) brain tumors
CEMİL CAN EYLEM
Doktora
Türkçe
2022
Moleküler TıpHacettepe ÜniversitesiAnalitik Kimya Ana Bilim Dalı
PROF. DR. NURSABAH ELİF BAŞCI AKDUMAN