Geri Dön

Cannabis sativa bitkisinin fitokannabinoidi olan kannabidiolik asitin antiemetik etkisinin in siliko yöntemlerle araştırılması

Investigation of the antiemetic effects of cannabidiolic acid the phytocannabinoid of Cannabis sativa plant, by in silico methods

PDF İndir

  1. Tez No: 811757
  2. Yazar: MERYEM ALBAYRAK
  3. Danışmanlar: DR. ÖĞR. ÜYESİ SULTAN MEHTAP BÜYÜKER
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyoteknoloji, Biotechnology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2023
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Üsküdar Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Biyoteknoloji Bilim Dalı
  13. Sayfa Sayısı: 120

Özet

Cannabis sativa bitkisi hastalıkların tedavisinde kullanılabilecek önemli sekonder metabolitler içermektedir. Çalışmamızda antiemetik etkinliğe sahip olduğu düşünülen bir fitokannabinoid olan kannabidiolik asit (CBDA)'in antiemetik etkisinin in silico yöntemlerle araştırılması hedeflenmiştir. Emezis (kusma) beyinde bulunan ve birçok reseptörün aracılık ettiği kusma merkezinin uyarılması ile meydana gelmektedir. Literatürde bilinen kusmayı tetikleyen reseptörler şunlardır; Serotonin (5HT3A), Dopamin (D2 ve D3), Nörokinin 1 (NK1), Histamin 1 (H1), Glukokortikoid, γ aminobütirikasit tip A (GABA (A)), Muskarinik asetilkolin reseptörleri (M1, M2, M3, M4, M5), CB1 ve CB2 reseptörleri. Çalışmamızda bu reseptörler ile CBDA'nın kenetleme işlemini AutoDock Vina programı kullanılarak gerçekleştirdik. Yapılan kenetleme çalışması Discovery Studio Visualizer programı kullanılarak görselleştirilmiştir. PubChem veri tabanından elde edilen CBDA'nın moleküler özelliklerini ise SwissADME veri tabanı kullanılarak araştırılmıştır. SwissADME veri tabanında incelenen fizikokimyasal özellikler CBDA'nın Lipinski kurallarına uyduğunu ancak kan-beyin bariyerinden geçmediğini göstermektedir. Yapılan kenetleme çalışmamızın sonuçlarına göre CBDA'nın H1, GABA (A), M1 ve M3 reseptörü üzerinde gösterdiği iyi hidrojen ve hidrofobik etkileşimler kullanılan referans ilaçlardan daha etkin olduğu görülmektedir. Bunun yanında 5HT3A, D2, NK1, M2, M4 ve M5 reseptörlerinde ise referans ilaçlar ile benzer bağlanma afinite değeri ve iyi reseptör-ligand etkileşimleri göstermiştir. Bu sonuç CBDA'nın bu reseptörler üzerinde referans ilaçlar için bir alternatif olabileceğini göstermektedir. Diğer taraftan Glukokortikoid, CB1 ve CB2 reseptörlerinde ise referans ilaçlara kıyasla düşük bağlanma enerjisi ve zayıf bağ etkileşimleri göstermiştir. CB1 ve CB2 reseptörlerine gösterdiği düşük bağ afinitesi ve zayıf etkileşim CBDA'nın psikoaktif etkilerinin minimum düzeyde göstereceğini düşündürmektedir. Bu nedenle CBDA'nın bir ilaç molekülü olarak güvenli bir aday olacağını göstermektedir. Tüm bu sonuçlar göz önüne alındığında CBDA'nın birçok emetik reseptör üzerinde antagonist etki gösterdiği ve antiemetik tedavisi için uygun aday molekül olduğu tespit edilmiştir

Özet (Çeviri)

The Cannabis sativa plant contains important secondary metabolites that can be used to treat diseases. Our study aimed to investigate the antiemetic effect of cannabidiol acid (CBDA), a phytocannabinoid that is thought to have antiemetic activity, by in silico methods. Emesis (vomiting) occurs by stimulating the vomiting center located in the brain and is mediated by many receptors. Serotonin (5HT3A), Dopamine (D2 and D3), Neurokinin 1 (NK1), Histamine 1 (H1), Glucocorticoid, γ aminobutyric acid type A (GABA (A)), Muscarinic acetylcholine receptors (M1, M2, M3, M4, M5), CB1 and CB2 receptors are known receptors that trigger vomiting in the literature. In our study, we performed the clamping process of CBDA with these receptors using the AutoDock Vina program. The clamping work was visualized using the Discovery Studio Visualizer program. The molecular properties of CBDA obtained from the PubChem database were investigated using the SwissADME database. The physical and chemical properties examined in the SwissADME database show that CBDA complies with the Lipinski rules, but does not pass through the blood-brain barrier. According to our clamping study results, the good hydrogen and hydrophobic interactions shown by CBDA on the H1, GABA (A), M1 and M3 receptors seem more effective than the reference drugs used. On the other hand, 5HT3A, D2, NK1, M2, M4, and M5 receptors showed similar binding affinity values and good receptor-ligand interactions with reference drugs. This result suggests that CBDA may be an alternative for reference drugs on these receptors. On the other hand, glucocorticoids showed low binding energy and weak bond interactions at CB1 and CB2 receptors compared to reference drugs. The low bond affinity and weak interaction with CB1 and CB2 receptors suggest that the psychoactive effects of CBDA will be minimal. Therefore, it shows that CBDA would be a safe candidate as a drug molecule. Considering all these results, it has been determined that CBDA has an antagonist effect on many emetic receptors and is a suitable candidate molecule for antiemetic therapy.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    905347

    Kenevir bitkisi bakteriyel endofitlerinin izolasyonu, karakterizasyonu ve bazı insan patojenlerine karşı etkileri

    Isolation, characterization of cannabis plant bacterial endophytes and their effects against some human pathogens

    MELAK KAMAL HUSSEIN HUSSEIN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2024

    BiyolojiOndokuz Mayıs Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. İBRAHİM ÖZKOÇ

  2. Tez No

    437529

    İnsan larinks yassı hücreli kanseri hücre dizisinde endokannabinoidlerin ve kannabinoid reseptörlerinin varlığının ve düzeyinin araştırılması

    The existence and level investigation of endocannabinoids and cannabinoid receptors in human laryngeal squamous cell carcinoma cell line

    ÖVSEN ÖNAY

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2016

    Kulak Burun ve BoğazHacettepe Üniversitesi

    Kulak Burun Boğaz ve Baş-Boyun Cerrahisi Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. NİLDA SÜSLÜ

  3. Tez No

    879064

    Kenevir (Cannabis sativa L.) bitkisinin kimyasal bileşik içeriğinin, antioksidan aktivitesinin ve asetilkolin esteraz enzimi inhibisyonunun belirlenmesi

    Determination of chemical compound content, antioxidant activity and acetylcholine sterase enzyme inhibition of cannabis plant (Cannabis sativa L.)

    VEFA VEFAOĞLU

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2024

    BiyokimyaMuş Alparslan Üniversitesi

    Kimya Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ERCAN BURSAL

  4. Tez No

    732228

    Kenevir bitkisi atıkları ile kömür karışımının ısıl davranışlarının TGA/FTIRr yöntemiyle incelenmesi ve kinetik modellemesi

    Investigation of thermal behavior of cannabis sativa crop wastes and kömür mixture through TGA/FTIR and kinetic modeling

    MERT YILDIRIM

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    Çevre MühendisliğiAkdeniz Üniversitesi

    Çevre Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. HASAN MERDUN

  5. Tez No

    729832

    Kenevir bitkisinin uydu görüntüleri ile makine öğrenimi kullanılarak spektral değerlerinin incelenmesi

    Cannabis sativa L. spectral discrimination using satellite imagery machine learning

    FATİH BIÇAKLI

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    Jeodezi ve FotogrametriEskişehir Teknik Üniversitesi

    Uzaktan Algılama ve Coğrafi Bilgi Sistemleri Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. GORDANA KAPLAN

Geri Dön